Кроме этих футболистов в чемпионском сезоне также выступали: Деннис Бергкамп (в 28-и матчах забил 16 голов и стал лучшим бомбардиром команды), Реми Гард, Мэттью Апсон, Луиш Боа Морте, Альберта Мендес, Скотт Маршалл, Стивен Хьюз и Паоло Вернацца. По одному разу выходили на замену Гэвин Макгован и Исаия Ранкин.

В 1999 году Николя Анелька был продан мадридскому «Реалу», но зато в команде Венгера появились хорват Давор Шукер, нигерийский нападающий Нванкво Кану из миланского «Интера», французский вингер «Ювентуса» Тьерри Анри, который вскоре стал культовым футболистом на «Хайбери» и лучшим бомбардиром в истории клуба, аргентинский защитник Нельсон Вивас, полузащитник сборной Швеции Фрэдрик Юнберг и гвинейский форвард Каба Диавара. В сезоне 1998/1999 уже «Манчестер Юнайтед» на одно очко опереди «Арсенал», который стал вице-чемпионом Англии. Футболисты «МЮ» оказались лучшими и в розыгрыше Кубка Англии, переиграв «канониров» в полуфинале (0:0, 2:1).

В следующем году отрыв от «Манчестера Юнайтед», оформившего свое очередное чемпионство, еще больше вырос – ставший в чемпионате вторым «Арсенал», в составе которого дебютировали бразилец Силвинью и украинец Олег Лужный, отстал на 18 очков! «Канониры» имели шанс стать обладателями Кубка УЕФА, но упустили его. Основное время финального матча против турецкого «Галатасарая», который состоялся 17.05.2000 в Копенгагене, завершилось со счетом 0:0. Не выявило победителя и добавленное время, а в серии пенальти точнее оказались футболисты из Стамбула, победившие со счетом 4:1. Свои попытки провалили Давор Шукер и Патрик Виейра, и лишь Рэй Парлор смог поразить ворота бразильца Клаудио Таффарела.

В сезоне 2000/2001 вновь «Манчестер Юнайтед» был первым в чемпионате, а «Арсенал» – вторым, с разрывом в 10 очков. Вторыми оказались «канониры» и в розыгрыше Кубка Англии – поражение в финале от «Ливерпуля» со счетом 1:2. Не помогли команде ни французы Робер Пирес и Сильвен Вильтор, ни камерунец Лоран, ни латыш Игорь Степанов, ни бразилец Эду, заменившие ушедших из коллектива Марка Овермарса и Эммануэля Пети.

Ситуация коренным образом изменилась в сезоне 2001/2002. «Арсенал» смог на 7 очков обогнать «Ливерпуль», и на 10 – «Манчестер Юнайтед», став в очередной раз лучшей командой Туманного Альбиона. Удачно завершился для «канониров» и кубковый сезон – в финале Кубка ФА со счетом 2:0 был переигран «Челси» (отличились Юнгберг и Парлор).

За победителей в финальном поединке выступали: Дэвид Симен, Лоран, Сол Кэмпбелл, Тони Адамс, Эшли Коул, Сильвен Вильтор (Мартин Киоун), Рэй Парлор, Патрик Виейра, Фрэдрик Юнгберг, Деннис Бергкамп (Эду), Тьерри Анри (Нванкво Кану). В резерве остались Ричард Райт и Ли Диксон.

Кроме этих футболистов в чемпионате Англии также играли: Робер Пирес, Фрэнсис Джефферс, Стюарт Тэйлор, Джованни ван Бронкхорст, Жилль Гриманди, Мэттью Апсон, Олег Лужный, Игорь Степанов, француз Жереми Альядьер.

Так был оформлен второй золотой «дубль» под руководством Арсена Венгера. По окончанию этого блестящего сезона сезона ушли из команды Ли Диксон и Тони Адамс – столпы легендарной обороны «канониров». Сезон 2002/2003 ознаменовался вторым местом в чемпионате и победой в Кубке Англии (в финале со счетом 1:0 был повержен «Саутгемптон», а победный гол забил Робер Пирес).

Пиком тренерской карьеры Арсена Венгера в «Арсенале», который при французе из скучной и однообразной команды, проповедовавшей оборонительный футбол, превратился в коллектив, способный показывать феерический атакующий футбол и при этом добиваться результата, стал сезон 2003/2004, принесший наставнику и его подопечным третий чемпионский титул. При этом, в том победном для них турнире «канониры» установили достижение, которое превзойти невозможно – команда не проиграла ни одного из 38 матчей чемпионата, чего никому не удавалось сделать с самого первого розыгрыша в сезоне 1888/1889.

Одержав 26 побед и 12 матчей завершив вничью, «Арсенал» на 11 очков опередил ставший вторым «Челси», и на 15 – «Манчестер Юнайтед». «Канониры» в этом сезоне больше всех забили (73 мяча) и меньше всех пропустили (26). Основным вратарем команды в этом году стал немец Йенс Леманн (он провел 38 матчей), а Тьерри Анри в 37 матчах Премьер-лиги забил 30 голов.

Кроме этих футболистов в чемпионском составе выступали: Эшли Коул (32 матча), Деннис Бергкамп (28 матчей, 4 гола), Робер Пирес (36/14), Сол Кэмпбелл (35/1), Коло Туре (37/1), Эду (30/2), Лоран (32), Фрэдрик Юнберг (30/4), Жилберту Силва (32/4), Патрик Виейра (29/3), Рэй Парлор (25), Паскаль Сиган (18), Хосе Антонио Рейес (13/2), Сильвен Вильтор (12/3), Гаэль Клиши (12), Жереми Альядьер (10), Нванкво Кану (9/1), Мартин Киоун (10), Дэвид Бентли (1), Джастин Хойт (1).

В сезоне 2004/2005 «Арсенал» стал вторым в чемпионате и первым в Кубке Англии. В финале, состоявшемся 21.05.2005 на стадионе «Миллениум» в Кардиффе, «канониры» переиграли «Манчестер Юнайтед» в первой в истории финалов Кубка ФА серии пенальти (основное и дополнительное время 0:0, пенальти – 5:4; Йенс Леманн парировал удар Скоулза).

Очередной трофей в копилку «Арсенала» принесли: Йенс Леманн, Лоран, Коло Туре, Филипп Сендерос, Эшли Коул, Сеск Фабрегас (Робин Ван Перси), Патрик Виейра (капитан), Жилберту Силва, Робер Пирес (Эду), Хосе Антонио Рейес, Деннис Бергкамп (Фрэдрик Юнгберг).

Венцом сезона 2005/2006 стал первый выход «Арсенала» в финал Лиги чемпионов. По пути к финалу «канониры» выбили из турнира мадридский «Реал» (незабываемый гол в гостевом матче забил Анри), «Ювентус» и «Вилльяреал». Решающий матч, где соперником англичан стала испанская «Барселона», состоялся 17.05.2006 на стадионе «Стад де Франс» в Париже. Игра, в которой была показана первая красная карточка в истории турнира (ее на 18-й минуте получил вратарь «канониров» Йенс Леманн за нарушение против Самюэля Это’О), завершилась со счетом 2:1 в пользу испанской команды. Сол Кэмпбелл на 37-й минуте великолепным ударом головой открыл счет, но во втором тайме «Барселона» дважды поразила ворота вышедшего на замену Мануэля Альмуния.

За «Арсенал» в этом матче играли: Йенс Леманн, Эммануэль Эбуэ, Коло Туре, Сол Кэмпбелл, Эшли Коул, Робер Пирес (Мануэль Альмуния), Жилберту Силва, Сеск Фабрегас (Матьё Фламини), Александр Глеб (Хосе Антонио Рейес), Фрэдрик Юнгберг, Тьерри Анри (капитан).

В сезоне 2006/2007 «Арсенал», который уже не мог реально конкурировать с «Манчестер Юнайтед» и «Челси» в борьбе за золото чемпионата, упустил шанс выиграть и Кубок Футбольной лиги. 25.02.2007 «канониры», чей состав пополнили Эммануэдь Адебайор, Тео Уолкотт, Томаш Росицкий и Абу Диаби, проиграли в финале «Челси» со счетом 1:2. Вскоре покинул коллектив Анри, отправившийся в «Барселону», и для болельщиков «Арсенала» наступили тяжелые времена. Громких побед и завоеванных трофеев больше не было.

После второго места в Премьер-лиге сезона 2004/2005 лучшим результатом «канониров» в этом турнире стали 3-й места в сезонах 2007/2008, 2009/2010 и 2011/2012. Не смог «Арсенал» и победить в финале Кубка Футбольной лиги 2011 года, проиграв со счетом 1:2 скромному «Бирмингем Сити». При этом, в команде Арсена Венгера тогда играли (кроме тех, кто уже был назван выше) такие классные исполнители, как Вильям Галлас, Робин ван Перси, Денилсон, Александр Сонг, Йоан Джуру, Гаэль Клиши, Бакари Санья, Эдуардо, Никлас Бентнер, Самир Насри, Арон Рэмзи, Андрей Аршавин, Томас Вермален, Лоран Косельни, Джек Уилшир, Пер Мертезакер, Микель Артета, Жервиньо, Лукас Подольски, Оливье Жиру, Алекс Окслейд-Чемберлен, Санти Касорла и другие.