В ноябре 2012 г. Следственный комитет России возбудил новое дело о мошенничестве в структурах «Оборонсервиса» по факту реализации здания Мосвоенторга на Арбате. «В соответствии с указаниями бывшего министра обороны совершение сделок, связанных с отчуждением недвижимого имущества организаций ОАО «Оборонсервис», осуществлялись по обязательному согласованию с ДИО Минобороны России», — сказал представитель СКР Маркин. — С апреля по декабрь 2011 года должностные лица этого департамента и лица, выполнявшие управленческие функции в ОАО «Военторг» и в ОАО «Мосвоенторг», совместно с учредителем и генеральным директором ООО «Центр правовой поддержки «Эксперт» Екатериной Сметановой и лицами, выполнявшими управленческие функции в подконтрольном ей ООО «ВитаПроджект», произвели ряд последовательных действий, направленных на хищение денежных средств ОАО «Мосвоенторг» и реализацию по заниженной стоимости здания на Арбате в центре Москвы». В частности, 1 сентября 2011 года между «Мосвоенторгом» и Центром правовой поддержки «Эксперт» был заключен договор на проведение оценки этого нежилого помещения. «При этом Сметанова организовала оценку указанного здания по заниженной стоимости. Она оценила его «в 115 миллионов рублей при рыночной стоимости на момент сделки купли-продажи не менее 140 миллионов рублей», — уточнил Маркин. Помимо этого, добавил он, — «должностные лица Департамента имущественных отношений Минобороны России, и лица, выполнявшие управленческие функции в ОАО «Оборонсервис» и сторонних коммерческих организациях, с апреля 2011 года по январь 2012 года при заключении и оплате дополнительного соглашения к одному из договоров, совершили хищение у «Мосвоенторга» 2,8 миллиона рублей».

По данным СКР Главным военным следственным управлением возбуждено уголовное дело в отношении должностных лиц ДИО Минобороны, а также лиц, выполнявших управленческие функции в дочерних зависимых компаниях ОАО «Оборонсервис» и сторонних коммерческих предприятиях по трем статьям УК РФ — ч. 3 ст. 285 (злоупотребление должностными полномочиями»), ч.2 ст. 201 (злоупотребление полномочиями) и ч.4 ст. 159 (мошенничество, совершенное организованной группой либо в особо крупном размере).

По данным ФАС, в начале 2013 года были зарегистрированы имущественные права ООО «Вита-Проджект» на акции ОАО «Полигон», ОАО «Владимироборонстрой», ОАО «Воронежское РСП «Замоскворечье». В пояснительной записке к бухгалтерской отчетности «Оборонстроя» за 2011 год говорится, что за реализацию этих четырех «дочек» (включая «31-й ГПИСС») «Оборонстрой» получил доход в размере 143 млн. рублей. Вместе с тем в этой же отчетности сообщается, что расходы «Оборонстроя» от сделки составили 1,4 млрд. рублей. То есть в собственном же отчете компания признает, что получила убыток от данной сделки в размере более 1,2 млрд. рублей.

Финский залив. В середине марта 2013 г. Президиум Высшего Арбитражного Суда удовлетворил иск военного прокурора Западного военного округа (ЗВО) о признании недействительной сделки о продаже береговой полосы ковша Галерного фарватера в Санкт-Петербурге. Решение о реализации береговой полосы Финского залива принималось экс-министром обороны Анатолием Сердюковым по предложению бывшего руководителя ДИО Евгении Васильевой. Военная прокуратура установила, что вопреки закону два земельных участка вдоль Финского залива общей площадью 11278 кв. м. были незаконно реализованы Минобороны России в пользу коммерческой организации ОАО «ТрансСтрой» за 525 млн. рублей. В свою очередь она перепродала его ОАО «Новый дом» через непродолжительное время более чем за 600 млн. рублей. Также 24 января 2013 г. Арбитражным судом Санкт-Петербурга и Ленинградской области удовлетворен иск об истребовании береговой полосы из незаконного владения коммерческой организации. Материалы в отношении должностных лиц Минобороны в порядке ст. 37 УПК РФ направлены в Главное военно-следственное управление.

Всеволожский район. 12 февраля 2013 года в Северо-Западном территориальном управлении имущественных отношений Минобороны, в здании Федеральной службы госрегистрации, кадастра и картографии по Ленинградской области, а также в администрациях нескольких районов области начались обыски. Военные контрразведчики и следователи СКР искали документы и другие улики по аферам с землей Минобороны во Всеволожском районе Ленинградской области на общую сумму в 1 млрд. рублей. По факту незаконного отчуждения земель Минобороны в Ленинградской области возбуждено уголовное дело по статье 159 УК («Мошенничество»). Следственная бригада по делу о масштабных хищениях активов Минобороны проверяла также возможную взаимосвязь между убийством местного главного архитектора Эдуарда Акопяна и аферами с земельными участками в Левашовском военном лагере. Один из эпизодов этого дела касается сомнительных обстоятельств отчуждения более 600 га земель Минобороны рядом с городом Сертолово в Ленинградской области. В начале 2012 года земли были загадочным образом поставлены на кадастровый учет как муниципальные территории. Например, согласно распоряжению тогдашнего губернатора Ленинградской области Валерия Сердюкова от 23 марта 2012 года № 130, более 100 га были выведены из земель специального и военного назначения и переведены под жилищное строительство. Как выяснилось, земли были переданы десяти дачным кооперативам в долгосрочную аренду. Среди них были два поселка «Северная Лица», а также «Углово Аэродром». Сейчас сотка земли в них стоит от 100 тысяч рублей. По мнению следствия, государству в лице Минобороны был причинен ущерб в 1 млрд. рублей. Общая кадастровая стоимость данных участков составляет 1,286 млрд. рублей, — заявил глава управления информации ГУ МВД по Петербургу и области Вячеслав Степченко. Обыски прошли и в администрации Всеволожского района. По данным следствия, в этом районе Минобороны лишилось около 456 га земли Левашовского военного полигона.

На документах по сомнительным сделкам стоят подписи все той же Евгении Васильевой, главы МО «Сертоловское городское поселение» Юрия Ходько, главы администрации Всеволожского района Александра Соболенко, а также его подчиненного Эдуарда Акопяна.

Ст. Петербург. Невский проспект, 68. В 2005 г. по этому адресу в центре Петербурга фирма Пузикова и его партнеров — «Автокомбалт» — получила от районной налоговой инспекции исторический особняк в обмен на 10000 кв. м на Лермонтовском проспекте. В то время, когда Сердюков работал главой УМНС Петербурга, это здание использовалось петербургскими налоговиками. Сердюков организовал их переезд по другому адресу, а освободившийся особняк на Невском уступил частнику — ООО «АвтоКомБалт», которое запланировало создать на этом месте дорогой апарт-отель. «Автокомбалт» хотел реконструировать историческое здание, но столкнулся с трудностями согласования, протестами градозащитников, а затем случился еще и финансовый кризис. В 2011 г. их выручила строительная группа ЛСР сенатора Андрея Молчанова, выкупив этот проект. Была ли это рядовая сделка или знак внимания по отношению к «правильным людям»? Все-таки ЛСР заключила с Минобороны контрактов на 39 млрд. руб. «Это была сугубо коммерческая сделка», — настаивает представитель ЛСР. Но в питерских СМИ оценили эту аферу однозначно — «фактическим застройщиком Невского, 68 является министр обороны Анатолий Сердюков, убедительно просивший губернатора Валентину Матвиенко посодействовать его коммерческим интересам» (Данные ЕРГЮЛ, СПАРК-Интерфакс, Википедия).