Во-вторых, основным узлом в аппаратуре, уменьшавшим надежность работы, была дисковая машина. Проблема решалась двумя путями: подбор металла для контактных пар, их конструкция, смазка и уменьшение количества контактов путем выбора лучших криптологических решений.

К концу деятельности Марфинской лаборатории была создана дисковая машина со стартостопным движением дисков со скоростью два шага в секунду. Окончательная ее отладка была завершена в первые годы существования вновь созданного НИИ. Работали дисковые машины достаточно надежно и находились в эксплуатации длительное время, пока им на смену не пришли электронные шифраторы.

В 1950 году было образовано ГУСС при ЦК ВКП(б), на которое было возложена задача по проведению экспертных работ и выдаче разрешений на проведение испытаний и эксплуатацию аппаратуры засекречивания. Разработка аппаратуры секретной телефонии, как и раньше, оставалась за Марфинской лабораторией. В таком порядке шла разработка телефонной аппаратуры засекречивания в 1950–1951 годах.

В составе ГУСС был создан НИИ № 1 (далее — НИИ-1), в котором Марфинскую лабораторию курировала группа И. Я. Верченко. «Положение о НИИ-1» было введено в действие постановлением Секретариата ЦК ВКП(б) от 9 июня 1950 года и приказом начальника ГУСС от 1 июля 1950 года. Этим положением в составе НИИ-1 предусматривались: ученый совет, аспирантура, специальная научно-техническая библиотека. В задачу НИИ-1 также входила организация научно-технического информирования и издание научных работ и учебных пособий.

Летом 1951 года в лаборатории шла напряженная работа по наладке и испытанию трех образцов системы М-803. События, происходившие в лаборатории летом и осенью этого года, свидетельствовали о том, что в ближайшем будущем стоило ожидать изменений в организации ее работы. В середине июня специальным письменным распоряжением начальника ООТ Ф. Ф. Железова криптографическая группа № 2 была перемещена на самый верхний этаж надстройки основного дома лаборатории — подальше от других подразделений.

В сентябре происходила реорганизация группы № 2: заключенные, работавшие в основном в статистической бригаде, были переведены в другие подразделения, а группа была пополнена пятью штатными работниками, которых нужно было срочно научить основам криптологии. Осенью 1951 года состоялась смена руководителя Марфинского объекта: вместо А. М. Васильева был назначен И. И. Наумов.

Работа по подготовке лаборатории к реорганизации завершилась выходом постановления СМ СССР от 12 января 1952 года «О разработке аппаратуры для засекречивания телефонных переговоров». В соответствии с этим постановлением в ГУСС на базе переданных из ООТ МГБ Марфинской лаборатории и ОТМ, а также 3-й и 5-й лабораторий ГУСС был создан НИИ № 2 (далее — НИИ-2). Начальником института был назначен И. И. Наумов. Численность НИИ-2 на момент его создания составляла 374 человека, а штат был определен в 700 человек. При создании НИИ-2 было оговорено, что в течение года из состава его работников будут выведены все заключенные.

Так завершила свою деятельность Марфинская лаборатория, которая просуществовала около четырех лет. Сразу после выхода постановления по образованию НИИ-2 в ГУСС распоряжением правительства была создана комиссия по изучению результатов деятельности лаборатории под председательством министра связи СССР Николая Демьяновича Псурцева (1900–1980) в следующем составе:

— заместитель министра госбезопасности И. Т. Савченко;

— начальник ГУСС И. Г. Шевелев;

— министр промышленности средств связи Г. В. Алексеенко;

— начальник войск связи Сухопутных войск И. Т. Пересыпкин;

— заместитель начальника НИИ-1 по научной работе И. Я. Верченко;

— директор особого КБ МЭИ В. А. Котельников и др.

В акте комиссии, представленном в бюро Президиума СМ СССР от 15 февраля 1952 года, отмечалось плохое качество восстановленной речи в системе М-803-3. Прослушав образцы аппаратуры М-803-5, комиссия признала аппаратуру М-803-5 приемлемой для использования на зарубежных линиях ВЧ-связи и рекомендовала провести испытания опытных образцов. Что касалось аппаратуры временной стойкости М-503, то комиссия признала ее пригодной для использования на внутренних линиях связи.

Акт правительственной комиссии можно считать подведением итогов деятельности Марфинской лаборатории за четыре года. Принятая правительственной комиссией в качестве серийных образцов аппаратура М-803-5 и М-503 была доработана и изготовлена в НИИ-2. Этот институт также получил условное наименование «почтовый ящик № 37», исходя из номера автобусного маршрута, который заканчивался около его территории.

В 1953 году после смерти И. В. Сталина состоялась очередная реорганизация государственных структур: ГУСС было расформировано, его основные подразделения переданы обратно в органы МГБ, а НИИ-2 — в промышленное министерство: сначала в Министерство электропромышленности и электростанций, а затем в МПСС.

В 1953 году заместителем директора НИИ-2 по научной работе был назначен К. Ф. Калачев, который по 1970 год являлся главным специалистом института и внес большой вклад в разработку аппаратуры засекреченной связи и создание основ этого направления в науке и технике. В 1972 году за создание образцов шифровальной техники ему был присуждена Государственная премия СССР.

В феврале-марте 1954 года начальник НИИ-2 И. И. Наумов назначил институтскую комиссию по определению готовности магистрали Москва — Берлин, оборудованной аппаратами М-803-5 и ретрансляторами М-803-Т, к общим линейным испытаниям. На протяжении двух месяцев работы на линии связи комиссия установила достаточную стойкость работы аппаратуры, после чего рекомендовала предоставить аппаратуру на общие испытания. Акт институтской комиссии был утвержден 3 апреля 1954 года.

В период с 15 апреля по 26 мая 1954 года работала общая комиссия ОПС и НИИ-2 по проведению линейных испытаний аппаратуры М-803-5 и М-803-Т. Комиссия оценила качество речи как приемлемое для проведения опытной эксплуатации магистрали Москва — Берлин. Акт комиссии был утвержден начальником ОПС П. Н. Ворониным и начальником 3-го Главного Управления МПСС И. В. Лобовым в июне 1954 года.

После проведения работниками ОПС опытной эксплуатации была изготовлена партия аппаратуры М-803-5 и М-803-Т, которой были оснащены важные зарубежные магистрали: Москва — Берлин и Москва — Пекин. Тракт связи Берлин — Москва — Пекин был в то время наиболее длинной в мире магистралью засекреченной проводной линии связи.

Так родилась международная правительственная связь. За выпуск серии аппаратуры М-803-5(Т) группа сотрудников НИИ-2 была отмечена правительственными наградами, в частности, ее главный конструктор А. Н. Кабатов был награжден орденом Ленина. В дальнейшем улучшенный вариант этой аппаратуры засекречивания гарантированной стойкости получил название «Лагуна».

Известно, что НИИ-2 разработал для ВМФ аппаратуру засекречивания радиотелефонных переговоров Т-617 «Эльбрус-К», которая использовалась как в составе КВ и СВ, так и УКВ и ДЦВ комплексов радиосвязи. Промышленностью было выпущено более 2400 комплектов Т-617.