В 1799 г. становится участником Итальянского и Швейцарского походов под командованием генерал-фельдмаршала А. В. Суворова. За боевые отличия был отмечен тремя наградами: орденом Св. Анны 2-й степ. за отличия «при разбитии многочисленного неприятеля при реках Тидоне, Треббии и Нуро», знаком того же ордена, алмазами украшенным, «за оказанную храбрость» в бою при г. Нови. Про награду в формулярном списке сказано следующее: «При входе из Италии в Швейцарию по повелению Главнокомандующего Генерал-фельдмаршала Князя Италийского графа Суворова-Рымникского назначен был командиром Сводного гренадерского Ломоносова батальона и находился в авангарде Генерал-майора князя Багратиона, где за отличную храбрость в сражениях и занятие тамошних гор, Октября 29 того же 1799 года Всемилостивейше пожалован командором Державного ордена Св. Иоанна Иерусалимского с пенсионом по 300 рублей в год из почтовых доходов». В ноябре того же года (т. г.) произведен в генерал-майоры.

Мемуары Е. Ф. Комаровского (обложка книги, изданной в 1990 г)

В следующем году, попав в немилость к Павлу I, был удален из столицы и назначен комендантом Каменец-Подольской крепости. С восшествием на престол Александра I был отозван в столицу и 17.07.1801 г. назначен генерал-адъютантом императора. Некоторое время исполнял обязанности помощника петербургского военного губернатора генерал-фельдмаршала М. Ф. Каменского и начальника полиции. Обратив внимание на нерациональное использование и плохую организацию местных гарнизонных рот и драгунских команд, составил проект создания земского войска и использования его для полицейской службы. Как писал в своих воспоминаниях Комаровский, проект государю «понравился и, может быть, оный послужил основанием учреждения впоследствии внутренней стражи». В 1803 г. получил титул графа. Для поправления здоровья в 1807 г. по разрешению царя выехал с семьей за границу, где не только лечился, но и посещал музеи, библиотеки, слушал курс лекций, встречался и общался с русскими и иностранными дипломатами, министрами, во Франции был принят Наполеоном и императрицей Жозефиной (в мае 1809 г.). Все это описал в своих мемуарах.

Почтовый конверт, выпущенный в честь Дня внутренних войск МВД России

Десять лет Комаровский был рядом с императором. Неоднократно выполнял его ответственные поручения. Несомненно, это имело место и во время двухгодичного пребывания Комаровского за границей. Столь длительное нахождение в фаворе при дворе создавало мнение в близких ко двору кругах о ловкости и изворотливости Комаровского, сумевшего добиться столь долгого расположения к себе императора. По характеристике известного литературоведа Б. М. Энгельгардта Комаровский был «ловкий придворный… до кончиков пальцев исполненный царедворского лукавства». С этим мнением можно поспорить. Комаровский, судя по его биографии, был высокопорядочным, честным и скромным человеком. Конечно, он обладал хорошими деловыми качествами, был энергичен, инициативен, исполнителен, к тому же выделялся и отличался образованностью, воспитанностью, культурой.

Если бы он был столь ловким царедворцем, то вряд ли почти 17 лет пробыл в генерал-майорах, столь долго дожидаясь производства в следующий чин.

07.07.1811 г. назначен инспектором внутренней стражи, занялся организацией и устройством нового войска. «Барклай-де-Толли хотел, — вспоминал впоследствии Е. Ф. Комаровский, — чтобы я носил звание дежурного при нем генерала по внутренней страже, но государь на сие не согласился, сказав: „Граф Комаровский — мой генерал-адъютант, и я хочу, чтобы он был между мной и вами“». Тем самым Александр I подчеркнул значимость вновь учрежденного войска.

Во время Отечественной войны 1812 года содействовал формированию государственного ополчения и резервных полков, для этой цели были выделены окружные генералы, офицеры и нижние чины внутренней стражи. Вместе с подчиненными организовал поставку лошадей в действующую армию. Под его руководством внутренняя стража обеспечивала «тишину и спокойствие» в империи. В связи с созданием согласно указу от 30.03.1816 г. Отдельного корпуса внутренней стражи назначается его командиром. 30 августа т. г. производится в генерал-лейтенанты.

Забот о своем войске у Комаровского хватало. «Должностьмоя была весьма хлопотлива», — писал он впоследствии. За восемь последних лет командования корпусом внутренней стражи он проехал по России 32 тысячи верст, инспектируя батальоны и команды.

Дом на Невском 42, где жил Е. Ф. Комаровский в 1814–1820 гг.

Комаровский проявил себя требовательным, решительным и в то же время заботливым командиром. Внутренней страже приходилось часто выделять команды для водворения порядка во время крестьянских волнений, вызванных, как правило, помещичьим произволом. Комаровский требовал в своих приказах, чтобы выделенные команды «крестьянам никаких обид не делали», виновных в неправомерных по отношению к населению действиях «судить и наказывать по военному артикулу».

Множество приказов было издано о разного рода злоупотреблениях в Отдельном корпусе внутренней стражи со стороны должностных лиц и наказании виновных. И здесь Комаровский показал себя непоколебимым и последовательным в своих действиях начальником. Он не терпит морально опустившихся офицеров, особенно тех, кто издевается над солдатами, использует их в своих личных целях, злоупотребляет своей властью, преступает закон. Он по-отечески относится и к нижним чинам, требует от окружных генералов и офицеров не обижать их, внимательно относиться к их нуждам, обязательно замечать и отмечать их служебное рвение, отвагу и благородство.

Для ликвидации последствий наводнения в столице в 1824 г. временно исполнял обязанности военного губернатора Петербургской и Выборгской сторон города.

Во время восстания 14 декабря 1825 г. показал себя решительным сторонником императора Николая I, организовал конвоирование пленных мятежников в Петропавловскую крепость, был членом Разрядной комиссии и участвовал в заседаниях Верховного уголовного суда по делу декабристов.

Комаровский внес большой вклад в становление внутренней стражи, которой он командовал 18 лет. В начале царствования Николая I Комаровский пользовался и его благосклонностью. Но это продолжалось лишь в течение трех лет. 25.06.1828 г. произведен в генералы от инфантерии, а 13 октября т. г. назначен сенатором. Отдельным корпусом внутренней стражи командовал до 06.12.1828 г. Однако к концу своей служебной карьеры он уже чувствовал определенное охлаждение по отношению к себе со стороны обоих императоров. Оставив военную службу, поселился с семьей в имении, находившемся в с. Городище Орловской губернии, занимался хозяйством, писал воспоминания «для любопытства и воспитания детей». Что же послужило причиной удаления Комаровского от дел?