1986 Возглавил лабораторию в НПО «Биотехнологии» министерства медицинской и микробиологической промышленности, переехал в Москву.

1987 Начал заниматься предпринимательством. «Я до 1987 года, до образования эдакого прототипа „Биопроцесса“, жил весьма скромно… А в восемьдесят седьмом году, на биосинтезе, я зарабатывал по семь-восемь тысяч рублей в месяц… Тогда, при СССР, это было что-то типа „ноу-хау“: мы заключали договора с научными институтами, и его сотрудники, попив чай за рабочий день, в свободное время, вечером, работали для нас. Мы им платили зарплату, равную еще одному окладу. Все были довольны» (Коммерсантъ-Деньги. 1996. 13 октября). «Прототипом» было общественное объединение «Биопроцесс», имевшее право хозяйственной деятельности.

1988 Общественное объединение «Биопроцесс» преобразовано в кооператив. Партнеры Бендукидзе – Михаил Могутов и Михаил Юрьев.

1989 В ночь на 9 апреля внутренние войска и армия разогнали митинг у здания правительства Грузии в Тбилиси: 19 убитых, несколько сот раненых. Бендукидзе вышел из КПСС.

1990 28 октября в Грузии прошли первые полусвободные выборы в парламент. Первое место с 54 % голосов занял нацеленный на независимость блок «Круглый стол – Свободная Грузия». Коммунисты получили 30 % голосов. Председателем Верховного Совета Грузии был избран Звиад Гамсахурдия.

«Биопроцесс» стал акционерным обществом. Бендукидзе – председатель совета директоров.

1991 22 декабря начался государственный переворот в Грузии, в результате которого в январе Гамсахурдия был вынужден бежать из Тбилиси. 25 декабря был распущен Советский Союз.

«Биопроцесс» вместе с Московской нефтяной биржей создал «Народную нефтяную инвестиционно-промышленную Евро-Азиатскую корпорацию» (НИПЕК). Бендукидзе вошел в совет директоров НИПЕК.

1992 Проведена открытая подписка на акции НИПЕКа. Контрольный пакет остался в руках «Биопроцесса» и советско-ливанского СП «Маджесс» под руководством Михаила Могутова.

Вместе с Константином Затулиным, Марком Масарским, Михаилом Ходорковским, Иваном Кивелиди, Владимиром Гусинским, Владимиром Виноградовым и Юрием Милюковым Бендукидзе учредил группу «Предпринимательская политическая инициатива – 92».

1993 В мае «Биопроцесс» приобрел 18 % «Уралмаша» на чековом аукционе. Бендукидзе стал главным управляющим НИПЕК.

Вошел в Совет по промышленной политике при российском правительстве, принял участие в Конституционном совещании, разработавшем новую российскую Конституцию. Неудачно баллотировался в Госдуму от предпринимательского блока «Преображение» – блок не собрал необходимого для регистрации количества подписей.

1994 Группа «Биопроцесс»-НИПЕК продолжила участие в ваучерной приватизации. Бендукидзе возглавил совет директоров судостроительной фирмы «Алмаз». Смерть отца, Автандила Бендукидзе.

1995 Структуры Бендукидзе купили Томский нефтехимический комбинат (в 1997 году продан Сибирскому химкомбинату). Бендукидзе вошел в президиум «Круглого стола бизнеса России».

1996 Бендукидзе подписал заявление президиума «Круглого стола бизнеса России» в поддержку избрания Бориса Ельцина президентом России на второй срок.

Создана компания «Уральские машиностроительные заводы» (УМЗ).

1997 Бендукидзе возглавил совет директоров УМЗ. УМЗ провел размещение акций среди иностранных инвесторов.

Вместе с другими лидерами КСБР Бендукидзе потребовал от правительства ликвидировать систему уполномоченных банков и провести налоговую реформу.

1998 Бендукидзе – генеральный директор УМЗ. Компания разместила американские депозитарные расписки (ADR) на западных биржах. В состав УМЗ вошли «Ижорские заводы».

1999 Раздел активов с Михаилом Могутовым. Бендукидзе отходят активы в тяжелом машиностроении.

2000 УМЗ переименованы в «Объединенные машиностроительные заводы (Группа Уралмаш-Ижора)» (ОМЗ). 10 июля генеральный директор «Уралмаша» Олег Белоненко расстрелян вместе с водителем в Екатеринбурге (убийство осталось нераскрытым). Совет директоров предприятия назначил новым генеральным директором Бендукидзе.

В октябре Бендукидзе вошел в бюро Российского союза промышленников и предпринимателей и возглавил его комитет по налоговой и бюджетной политике.

2001 «Наша цель – стать международной компанией», – написал Бендукидзе в годовом отчете ОМЗ за 2001 год. ОМЗ купили завод «Красное Сормово», НПО «Буровая техника» и завод нефтебурового оборудования Upet в Румынии.

2002 ОМЗ приобрели четыре конструкторских бюро на территории бывшего СССР и инжиниринговую компанию Friede & Goldman Ltd (Хьюстон, США).

В марте Бендукидзе принял участие в «кооперативе олигархов», финансировавшем независимый телеканал ТВС (7,5 %), но в дальнейшем дистанцировался от его деятельности.

2003 В январе ОМЗ приобрели 20 % акций «Атомстройэкспорта» (специализируется на поставках оборудования для зарубежных атомных станций) и 51 % акций инжиниринговой компании «Зарубежэнергопроект». В декабре Бендукидзе и Владимир Потанин договорились о слиянии ОМЗ и «Силовых машин», в результате которого первому должно было достаться 15 %, а второму – 35 % акций объединенной компании (летом следующего года сделка развалилась) С подачи Бендукидзе в России принят новый закон о валютном регулировании, установивший более либеральный режим трансграничного движения капитала.

2004 В мае Бендукидзе принял участие во встрече российских предпринимателей с президентом Грузии Михаилом Саакашвили и получил предложение возглавить грузинское министерство экономики. 1 июня Бендукидзе стал министром, а в декабре пошел на повышение и получил должность государственного министра – координатора структурных и экономических реформ во всех министерствах и ведомствах Грузии.

2005 3 февраля погиб премьер-министр Грузии Зураб Жвания. Новый премьер – Зураб Ногаидели. В марте стартовала радикальная реформа системы лицензирования, в итоге которой число лицензий было сокращено на 85 %.

30 мая Сергей Лавров и Саломе Зурабишвили утвердили график вывода российских военных баз из Аджарии и Ахалкалаки – процесс должен был завершиться до конца 2008 года.

В ноябре Бендукидзе продал свой пакет акций ОМЗ «Газпромбанку».

2006 Взрывы на двух магистральных газопроводах оставили Грузию без тепла в разгар морозов. Оппозиция потребовала отставки Бендукидзе – «пешки в руках Москвы». В сентябре разгорелся шпионский скандал: после задержания в Грузии четырех офицеров ГРУ Россия ввела транспортную блокаду и торговое эмбарго, заблокировала денежные переводы в Грузию, устроила охоту на грузинских иммигрантов. Бендукидзе и его команда готовят радикальную реформу системы здравоохранения, которая будет проводиться в 2007–2009 годах.

2007 Политический кризис в Грузии.

1 ноября ушло в отставку правительство Ногаидели. 7 ноября полиция с применением водометов разогнала демонстрацию у парламента и заняла офис телеканала «Имеди», которым владел противник президента Бадри Патаркацишвили. 22 ноября новым премьером Грузии стал Ладо Гургенидзе, а 25-го Саакашвили подал в отставку, чтобы принять участие в досрочных президентских выборах.