По крайней мере со стороны, все эти назначения выглядели спонтанными, произвольными и даже суетливыми, как будто ФСБ спешила расставить своих людей на все ведущие посты, боясь, что ситуация может измениться не в пользу Лубянки.

27 мая 2000 года генерал КГБ/ФСБ С. Б. Иванов был назначен секретарем Совета безопасности России. 28 марта 2001 года он стал министром обороны, сменив на этом посту маршала Игоря Сергеева. Это означало, что министерство обороны впервые в советско-российской истории было переподчинено Лубянке.

В июле 2000 года директор Службы внешней разведки Вячеслав Трубников (он занимал эту должность с 1996 года) был назначен заместителем министра иностранных дел РФ в ранге федерального министра. Трубников с 1967 года служил в ПГУ. Это был первый случай назначения высокопоставленного офицера госбезопасности заместителем министра иностранных дел СССР/России.

В августе 2000 года Юрий Демин, бывший главный военный прокурор, был назначен первым заместителем министра юстиции России. Внешне в этом назначении ничего неестественного не было. Но в Главную военную прокуратуру Демин пришел с должности начальника договорно-правового управления ФСБ. Офицер госбезопасности назначался министром юстиции впервые.

Тогда же первым заместителем министра по делам федерации, национальной и миграционной политики назначили первого зама директора ФСБ Александра Медяника.

В августе 2001 года первым заместителем директора Федеральной службы налоговой полиции стал Сергей Веревкин-Рахальский, родившийся в 1948 году. Он закончил Ленинградский институт точной механики и оптики, и с 1986 года возглавлял Управление ФСБ по Сахалинской области, а с марта 1999 года — Управление ФСБ по Приморскому краю. В апреле 2000 года его вернули в Москву на должность заместителя министра по налогам и сборам.

Одновременно заместителем директора ФСНП назначили начальника одного из управлений ФСБ Анатолия Цибулевского (1950 года рождения).

В 2001 году Путин уволил ставленника «семьи» Ельцина Владимира Рушайло с поста министра внутренних дел и заменил его карьерным чекистом, коллегой Путина по ГКУ Борисом Грызловым, учившимся в одном классе с Патрушевым[423].

Таким образом, уже в 2001 году абсолютно все ключевые министерские посты оказались во власти ФСБ.

Став президентом, Путин не забыл тех, кто помогал ему в проведении операции по вывозу Собчака во Францию. Заместитель директора ФСБ в 1998–2001 годах. Григорьев возглавил Федеральное агентство по государственным резервам. В 2008 году его даже включали в список возможных преемников Путина, но не срослось — он скоропостижно скончался 10 декабря 2008 года на 60-м году жизни. Юрий Шевченко стал министром здравоохранения России, где получил прозвище Доктор Смерть, так как в период его руководства медициной смертность среди россиян резко увеличилась, а во время освобождения заложников «Норд-Оста» на Дубровке в Москве 23 октября 2002 года в результате неадекватных медицинских мер по спасению людей, отравленных усыпляющим газом, погибли 129 человек. После пяти лет провальной деятельности Шевченко отправили в отставку.

Символичным оказалось и назначение 3 июня 2002 года заместителем генерального директора Всероссийской государственной телевизионной и радиовещательной компании (ВГТРК) генерала ФСБ Здановича, выведенного для этого в ОДР в том же 2002 году в чине генерал-лейтенанта. Это был открытый вызов общественности и СМИ. В знак протеста против этого знакового назначения ушел со своего поста главный редактор программы «Вести» Александр Абраменко. На вопрос, остается ли Зданович в действующем резерве ФСБ, генерал с позволенной временем наглостью ответил:

Как известно, бывших чекистов не бывает. Но не хотелось бы уточнять детали. В тех проблемах, которые я буду решать, конечно, мне будут помогать коллеги. Из чувства солидарности.

24 апреля 2001 года был издан секретный приказ № 094 за подписью директора ФСБ Николая Патрушева, озаглавленный «Об организации работы по прикомандированию военнослужащих органов Федеральной службы безопасности». Согласно этому документу в случае, если зарплата прикомандированного сотрудника на новом месте была выше, чем в ФСБ (в частном секторе она всегда была выше), разницу в зарплате необходимо вернуть на Лубянку. По этой причине многие офицеры, уходившие в ОДР/АПС, предпочитали эту разницу получать наличными в конвертах, формально нарушая закон, используя классический мафиозный способ ухода от налогов и становясь обычными преступниками. Остальные, закон не нарушавшие, честно кормили свое ведомство, создавшее таким образом для российских бизнесов и учреждений некую скрытую форму дополнительного налогообложения (или открытую форму вымогательства) в пользу госбезопасности[424].

Параллельно с открытыми назначениями высших офицеров ФСБ на руководящие должности в государстве происходило создание различных учреждений, в которые не сильно стесняясь, но и не слишком афишируя происходившее, уходили офицеры ДР, продолжавшие инкогнито служить в интересах госбезопасности. В частности, в первой половине 2000 года, предвидя неизбежный арест Гусинского и разгром его медиаимперии, Бобков создал новую структуру: Институт стратегических оценок и анализа (ИСОА). Именно в это учреждение, расположенное по адресу ул. А. Солженицына (бывшая Коммунистическая), д. 40/14, строение 1, плавно перетекли основные аналитические кадры некогда могущественной службы безопасности «Мост-банка».

На сайте института об этапах его развития была представлена не слишком исчерпывающая информация:

Основан в 2000 году на базе аналитического центра, функционировавшего с 1995 года. В совет директоров и штат института входят крупные специалисты в вопросах внутренней, внешней, геостратегической и военной политики, экономики, современной истории и права, большинство из которых имеют богатый опыт руководящей работы на государственных постах.

ИСОА был закрытым акционерным обществом. Информация о его акционерах в открытых источниках отсутствовала, как и информация о сотрудниках Института. Отсутствовало также название аналитического центра, «функционировавшего с 1995 года», на базе которого был создан ИСОА, потому что этим центром на самом деле был «Мост-банк».

Бобков, как и раньше, предпочитал оставаться в тени. Директором и главным редактором издаваемого институтом журнала «Вестник аналитики» с момента создания института был бывший председатель КГБ Азербайджанской ССР Вагиф Гусейнов, экстрадиции которого азербайджанские власти добивались с 1996 года (Россия в экстрадиции Азербайджану отказала).

Под «крышей» ИСОА укрылся также бывший начальник 5-го Управления генерал-лейтенант Е. Ф. Иванов, кадровый офицер 5-го Управления Владимир Масленников и его подчиненный по времени службы в 5-м Управлении Валерий Ширяев, перешедший затем как офицер ДР на должность заместителя редактора в «Новую газету».

В ИСОА оказался также Сергей Петрович Чаплинский, в прошлом офицер 8-го отдела (разработка сионистских националистов) 5-го Управления, помощник начальника 5-го Управления генерала Ивана Абрамова и секретарь комсомольской организации 5-го Управления. Его преемник и по комсомольской линии, и по службе в 5-м Управлении Александр Львович Свечников тоже оказался в ИСОА на должности главного научного консультанта.

Сам Свечников, окончивший в 1973 году географический факультет МГУ и защитивший в 1987 году кандидатскую, служил в КГБ/ФСБ