Максимальная нагрузка на Охранную агентуру выпадала в течение трех зимних месяцев во время пребывания высочайшего двора в столице. В остальное время свободные от других обязанностей агенты прикомандировывались к Охранному отделению, где под руководством опытных филеров «не только знакомились со всеми подозрительными лицами… и получали возможность следить за такими местами при исполнении постовой службы на пути Высочайших проездов, но и практически изучали те приемы, которые необходимы для успешного исполнения лежащих на них обязанностей…».

В 1887 году по просьбе генерала П. А. Грессера ассигнования на Охранную агентуру были увеличены Министерством внутренних дел с 90 до 120 тысяч рублей. Одним из обоснований этого решения было высказанное им опасение того, что уволенные ввиду недостатка финансирования агенты «из чувства озлобления могут сообщить известные им сведения посторонним лицам». В анонимном письме, направленном в это время на имя министра внутренних дел, говорилось: «Просим обратить Ваше милостивое внимание на Агентов Охраны. Прослужив почти 5 лет, теперь увольняют без всяких причин… Если же с вашей стороны не будет обращено должное внимание — постараемся подать прошение Государю Императору». Нам неизвестно, была ли эта угроза претворена в жизнь, но увольнения агентов охраны удалось избежать.

Межведомственной борьбе за руководство Охранной агентурой между Департаментом полиции и градоначальником был положен конец министром внутренних дел графом Д. А. Толстым, когда 23 мая 1887 года была утверждена инструкция «Состоящему в Управлении Санкт-Петербургского Градоначальника отделению по охранению общественной безопасности и порядка в столице», в которой, в частности, говорилось:

«При отделении охранной наружной службы состоит особая команда вольнонаемных людей (Охранная Агентура), которая действует под непосредственным руководством и наблюдением начальника отделения. На обязанности охранной команды лежит наружное наблюдение, в пределах полученных указаний, за подозрительными лицами. Порядок службы охранников определяется особой инструкцией, утвержденной Градоначальником. Охранная команда в целом составе и по частям может быть командируема в другие местности Империи».

Вслед за этим 10 октября 1887 года санкт-петербургский градоначальник генерал-лейтенант П. А. Грессер утвердил подготовленную подполковником Секеринским инструкцию «О порядке службы Охранной агентуры», в которой, в частности, говорилось: «Специальное назначение ОА — обеспечение-безопасности Высочайших Их Императорских Beличеств и Государя Наследника Цесаревича проездов в столице». На заведующего Охранной агентурой, назначаемого градоначальником с правами помощника начальника Охранного отделения, возлагалось «распределение между служащими в Агентуре и прикомандированными к охранной деятельности Санкт-Петербургской столичной и Речной полиции обязанностей их, как охранников, размещение агентов по постам, назначение очереди и продолжительности дежурств и т. п., разъяснение охранникам их обязанностей и тех практических приемов, кои будут признаны наиболее целесообразными…».

Устанавливался следующий порядок приема на службу в Охранную агентуру: «О каждом, вновь принятом на службу в ОА лице, предварительно собираются справки о семейном положении, прошлой жизни и о степени политической благонадежности. По испытании затем такого лица в качестве кандидата на должность агента-охранника в течение одного месяца, списки таких кандидатов, удовлетворяющих условиям службы в ОА, через Начальника Охранного Отделения, предоставляются на утверждение Градоначальника».

Все агенты-охранники по роду выполняемых ими обязанностей делились на местных и постовых. Местные агенты осуществляли «внутреннее наблюдение за домами в тех местностях, где бывают Высочайшие проезды». Они назначались из числа более грамотных и наиболее развитых полицейских и подразделялись «на заведующих меблированными комнатами, отдельными домами и определенными участками».

Местные агенты должны были жить в пределах вверенных их надзору районов. Их служебные обязанности определялись следующим образом: «Главная обязанность местных агентов заключается в самом подробном ознакомлении с постоянными жителями и временными посетителями вверенных их надзору меблированных комнат и домов. Они обязаны знать семейное положение, образ жизни, род занятий, материальные условия всех живущих в доме, а равно и всех знакомых каждого жильца и при малейшем сомнении в какой-либо личности немедленно докладывать заведующему Охранной агентурой. Если затем такое лицо будет оставлено з этом доме, то местный агент должен уже иметь тщательное наблюдение за всеми его действиями, обращая особое внимание на то, что им приносится в дом и на все его связи и отношения…» При этом рекомендовалось «обращать особое внимание: на живущих в подвальных этажах, на занимающих лицевые квартиры и на промышленные и торговые помещения в домах». Для выполнения этих задач рекомендовалось устанавливать хорошие личные отношения «с домашнею прислугою жильцов, торговцами, содержателями ресторанов и других посещаемых публикою заведений, а также с дворниками и швейцарами».

На тех из них, которые могут быть использованы в интересах Охранной агентуры, предлагалось представлять подробные сведения заведующему ОА. Предписывалось также обращать внимание «на всякий приступ к каким-либо работам, особенно в подвальных этажах, стараясь с точностью выяснить цели и повод производимых работ…». При еженедельных обходах своего района местные агенты должны были «собирать сведения о вновь прибывших в дома и выбывших лицах и в тот же день доставлять об этом сведения, по особо установленным листкам, в местный полицейский участок» и под видом паспортистов «вручать квартирантам виды на жительство, отдаваемые в прописку».

В обязанности постовой агентуры вменялось «следить за появлением злоумышленников по пути Высочайших проездов». Наблюдательные посты, на которые выставлялись постовые агенты, делились на суточные и дневные. На первых постах дежурили по восемь часов, сменяя друг друга, четыре агента, на вторых — с восьми утра до десяти вечера посменно два агента. Их смена проводилась обходными дежурными.

«Находясь на посту, агент все время дежурства проводит на улице, он может по временам садиться у ворот домов на скамейках, предназначающихся для дворников, но отнюдь не вправе заходить в дома, ни в другие помещения». В холодное время обходной дежурный мог сменить его не более чем на полчаса. Им разрешалось вступать в контакт с местными дворниками для получения от них нужных сведений и при этом держать себя вежливо и обходительно, стремиться «сблизиться с ними настолько, чтобы руководить ими при вызове их на дежурство в случаях Высочайшего проезда».

Предписывалось также «обращать преимущественно внимание на лиц ему незнакомых, которые без видимой надобности и цели будут появляться в пределах поста, ходить или чего-либо выжидать». Таких лиц необходимо было прослеживать до ближайшего поста и сообщать о них для той же цели следующему постовому агенту. Таким образом, такие лица передавались от одного поста к другому до места их жительства, где они устанавливались через дворника. Рекомендовалось также «обращать особое внимание на извозчиков и кучеров, которые будут часто появляться и стоять в пределах поста, отказываясь от найма желающих ехать», а также «на таких лиц, которые скрывают под одеждой какие-либо предметы или узелки, прослеживая их в указанном порядке».