Согласно планам командования сухопутных войск, предполагалось формирование первых четырех бригад зенитной артиллерии завершить к 10 января 1945 г., а оставшиеся шесть сформировать в течение февраля. Были ли эти планы осуществлены в полном объеме, установить не удалось. Во всяком случае, в марте 1945 г. имелось лишь восемь легких бригад зенитной артиллерии — с 501-й по 508-ю. Поскольку новых 20-мм строенных установок не хватало, бригады получили вместо части таких орудий обычные одноствольные пушки, что отрицательно сказывалось на плотности огня, а значит — и на эффективности прикрытия объектов.

С самого начала развертывания системы ПВО подавляющее большинство огневых средств зенитной артиллерии находилось в ведении люфтваффе. Организационно они подчинялись авиационным округам. По итогам польской кампании началась реорганизация ПВО, призванная обеспечить более тесное взаимодействие с сухопутными частями в наступлении. Началось формирование зенитных корпусов, а впоследствии — бригад и дивизий. К примеру, созданный в октябре 1939 г. на базе частей 3-го авиационного округа 1-й корпус зенитной артиллерии имел в своем составе три зенитных артполка — 101-й, 102-й и 104-й, — а также два прожекторных дивизиона. 101-й полк был придан 12-й полевой армии, 102-й — танковой группе фон Клейста, а 104-й — 16-й полевой армии. Дивизионы прожекторов взаимодействовали со 10-м и 104-м полками.

В типовом варианте зенитный артполк имел четыре дивизиона — три тяжелых и легкий. В тяжелом дивизионе было две батареи по 4 88-мм и три 20-мм зенитка, а также батарея с 12-ю 20-мм пушками. Легкий дивизион имел две батареи с 12-ю 20-мм зенитками. Третья его батарея была вооружена либо 37-мм зенитками (9 пушек), либо 20-мм счетверенными установками (восемь единиц).

Зенитные части, приданные сухопутным войскам, сохраняли двойное подчинение. Например, 1-й корпус зенитной артиллерии в административном отношении подчинялся командованию 3-го воздушного флота, а в оперативном — сухопутным войскам. Подобное положение вещей могло стать источником потенциальных конфликтов между сухопутным и авиационным командованиями. Однако маршал Кессельринг в своих мемуарах отмечает, что такие конфликты никогда не возникали, поскольку авиаторы охотно «делились» с армейцами зенитными частями. Вероятно, в этом утверждении есть определенная доля предвзятости — ведь Кессельринг принадлежал к командованию люфтваффе. Но подобная система двойного подчинения просуществовала всю войну.

После завершения кампании корпуса зенитной артиллерии были разукрупнены в бригады. Например, на базе частей 1-го корпуса были сформированы 1-я и 2-я бригады зенитной артиллерии. Но при подготовке к операции «Барбаросса» корпуса восстановили. Вновь сформированный 1-й корпус зенитной артиллерии сосредоточили в районе Варшавы, а затем придали 2-й танковой группе, воевавшей в составе группы армий «Центр». В июне 1941 г. корпус располагал лишь двумя полками — 101-м и 104-м, но и для них главной задачей было отнюдь не ПВО, а поражение наземных целей, прежде всего, бронированных. Характерно, что к концу 1941 г. 1-й корпус зенитной артиллерии записал на свой счет 314 сбитых самолетов и целых 3000 уничтоженных танков!

В конце 1941 г. командование люфтваффе приступило к созданию зенитных артиллерийских дивизий. Такие соединения формировались и проходили боевую подготовку на территории рейха либо оккупированных стран, а затем отправлялись на фронт. Таким образом, к маю 1942 г. в составе 1-го корпуса зенитной артиллерии вместо двух полков, с которыми он начал боевые действия, было уже четыре дивизии — 9-я, 10-я, 15-я и 17-я. К тому времени корпус передали в состав группы армий «Юг», а его дивизии были распределены между входящими в эту группу армиями. В частности, 6-я армия генерала Паулюса получила 9-ю зенитную артиллерийскую дивизию. Части этой дивизии приняли участие в уличных боях в Сталинграде, а в начале 1943 г. были уничтожены в сталинградском «котле» вместе с остальными соединениями 6-й армии. Сам же 1-й корпус с боями отступал через территорию Украины и Польши, пока его остатки не были уничтожены в Силезии.

Две зенитные артиллерийские дивизии — 19-я и 20-я — были направлены в Северную Африку. Здесь они подчинялись в административном отношении авиационному корпусу «Тунис», а в оперативном одна из них взаимодействовала с германской 5-й танковой армией, а другая — с итало-германской танковой армией. На эти соединения зенитной артиллерии, кроме прикрытия полевых войск, возлагалась и задача ПВО североафриканских портов.

Естественно, на фронте оказались далеко не все соединения зенитной артиллерии. Значительная их часть обеспечивала ПВО территории рейха — как, например, 1-я дивизия зенитной артиллерии, вплоть до конца войны прикрывавшая с воздуха берлин. Впрочем, с февраля 1945 г. части этой дивизии также были брошены на наземный фронт.

Весьма интересным моментом в организации ПВО рейха стало создание крупных соединений зенитных прожекторов. В июле и сентябре 1940 г. были сформированы 1-я и 2-я бригады зенитных прожекторов, в августе следующего года развернутые в дивизии. Каждая прожекторная дивизия включала четыре полка. Обе прожекторные дивизии развернули на так называемой «линии Каммхубера», названной по имени генерала — командующего ночной истребительной авиацией люфтваффе. Линия эта находилась на пути следования стратегических бомбардировщиков союзников с Британских островов к целям на территории Германии и простиралась от Брюсселя через Бремен и Гамбург до Кёльна. При этом полки 1-й дивизии были дислоцированы в Бельгии и Нидерландах, а 2-й — в северной Германии. Главной их задачей стало взаимодействие с истребителями, действовавшими на этой линии, в то время, как основные силы зенитной артиллерии были сосредоточены за ней, прикрывая Рурский бассейн и другие важные промышленные центры и крупные города. Развитие технических средств обнаружения воздушных целей привело к тому, что в июле 1942 г. обе прожекторные дивизии расформировали, а их части включили в состав дивизий и корпусов зенитной артиллерии. На «линии Каммхубера» функции обнаружения целей взяли на себя радиолокаторы — сначала типа «Фрейя», а затем — более совершенные «Вюрцбург».

Несколько слов следует уделить материальной части прожекторных подразделений — о ней, в отличие от зенитной артиллерии, редко пишут в книгах. Итак, во время войны в Германии производились четыре типа зенитных прожекторов. Первый из них, самый маленький, имел диаметр 60 см, а луч его света распространялся на расстояние до 5 км. Такие прожектора использовались не только в частях, прикрывавших тыловые районы, но и в зенитных дивизионах в составе дивизий вермахта и «ваффен СС». Вдвое большую дальность действия имел 150-см прожектор. Следующий по размеру прожектор с диаметром 200 см «бил» на 15 км. Наконец, наиболее мощный прожектор, а, собственно говоря — счетверенная прожекторная установка, имел досягаемость 20 км. Следует также отметить, что прожектора, как и все иное спецоборудование ПВО, были довольно дорогими. К примеру, 200-см прожектор стоил 85 000 рейхсмарок, то есть больше, чем две 8 8-мм зенитки и почти столько же, сколько один танк Pz.Kpfw. III.

Характерной чертой зенитных частей ПВО рейха было увеличенное количество стволов в батареях по сравнению с теми частями, что действовали на фронте. Например, легкая батарея в рейхе имела 16 20-мм автоматов вместо 12-ти на фронте, средняя с 37-мм пушками — 12 вместо девяти, а тяжелая — шесть 88-мм орудий вместо четырех. К тому же, в тыловых частях применялись наиболее тяжелые системы, которые на фронте вовсе не встречались — например, 105-мм и 128-мм зенитные орудия, или же монстроподобные 128-мм спаренные стационарные установки. Довольно широко применялись трофейные системы, прежде всего, советские. Их количество позволяет наглядно представить огромные потери Красной армии в начальный период войны. Например, в январе 1944 г. люфтваффе располагали 642 37-мм автоматами Flak 39(r). В августе того же года в частях ПВО насчитывалось 723 76,2-мм зенитные пушки образца 1931 г., принятые на вооружение вермахта под обозначением Flak M31(r), часть которых получила рассверленные до калибра 88 мм стволы. Широко применялись и 85-мм зенитки образца 1939 г., обозначавшиеся как Flak M39(r). Например, в корпусе зенитной артиллерии «Даннмарк» в 1944 г. имелось восемь батарей таких зениток по 6–8 орудий.