В Маньчжурии подготовленных дорог, кроме КВЖД, вовсе не существовало, а что касается последней, то она не была приспособлена к развитию грузового движения: на станциях не было ни платформ, ни запасных путей, а на всем протяжении — достаточного количества подвижного состава. Транссибирская железнодорожная магистраль и КВЖД в начале войны пропускали 3 пары поездов в сутки, в то время как еще в 1870 году провозоспособность германских железных дорог определялась в 10 пар для одноколейного пути и в 20 пар для двухколейного. Кроме того, рельсовый путь, по которому осуществлялся подвоз, прерывался Байкалом, и переправа через него отнимала много времени.

Организацией военных перевозок ведало Управление военных сообщений Главного штаба. Несмотря на то что вопрос железнодорожных перевозок во время Русско-японской войны был одним из самых больных, деятельность этого управления заслуживает всяческих похвал. А.Н. Куропаткин в письме к императору называл Управление военных сообщений единственным «светлым исключением» в аппарате Главного штаба. Автор предвидит недоумение читателей, вызванное подобным утверждением, но все дело в том, что Управление военных сообщений в мирное время никак не могло повлиять на развитие железнодорожной сети, и ответственность за слабость коммуникационной линии на Дальнем Востоке лежит на Министерстве путей сообщения. Управление военных сообщений занималось организацией перевозок войск и военных грузов, а влиять на развитие железных дорог могло только во время войны, да и то лишь по согласованию с МПС[35]. Во время Русско-японской войны это подразделение Главного штаба сделало все от него зависящее для увеличения пропускной способности железных дорог.

Как уже говорилось выше, озеро Байкал прерывало коммуникационную линию, и ко второй половине войны была построена Круго-Байкальская железная дорога. На Самаро-Златоустовскую и дороги Сибирской магистрали экстренно командировался подвижной состав с дороги Европейской России. Несмотря на недостаток отпускаемых правительством средств, велось строительство стратегических шоссе. Во время войны чрезвычайно остро встал вопрос о расширении и переустройстве железнодорожных узлов, так как в условиях военного времени особенно четко проявилось их несовершенство. Преодолевая бюрократические рогатки, Н.Н. Левашев добился усовершенствования московского и варшавского узлов. В 1904 г. по настоянию Управления военных сообщений были рассмотрены проекты переустройства узловых станций Петербурга, Бреста, Минска, Навтлуга и т. д.. Большая часть этих проектов была утверждена. Хотя, конечно, управление чисто физически не могло за полтора года решить всех проблем железнодорожной системы России, результаты его деятельности были значительны. К 1905 г. пропускная способность коммуникационной линии увеличилась в 6 раз и достигла 18 пар эшелонов в сутки.

Управление приняло ряд мер по охране железных дорог. На военном положении были объявлены Самаро-Златоустовская, Забайкальская и Круто-Байкальская железные дороги, а также КВЖД и Круто-Байкальский почтовый тракт. Проведены мобилизация и отправка на Дальний Восток железнодорожных рот. Железнодорожные батальоны были выделены в особую категорию войск. К концу войны разработано Положение о железнодорожных войсках. Все это было как нельзя кстати в условиях революционной ситуации и массовых беспорядков на железных дорогах. Во время забастовок и волнений железнодорожных служащих на железнодорожные войска была возложена работа по поддержанию и возобновлению движения поездов.

Лишь благодаря им железные дороги, по которым отправлялись грузы в действующую армию, не были парализованы во время революции.

Во время Русско-японской войны Главный штаб показал себя не с лучшей стороны[36]. Разработанная им система частных мобилизаций привела к тяжелым последствиям. Помимо того, что в результате этих мобилизаций действующая армия оказалась укомплектована наихудшим из возможных контингентов солдат, выборочный характер призыва и отсутствие дифференциации по возрасту и семейному положению еще более усилили недовольство населения, порожденное революционной ситуацией и непопулярностью войны. Принятые Главным штабом меры по пресечению беспорядков при призыве не принесли пользы, так как корень зла заключался в общей постановке мобилизационного дела в России.

Отсутствие необходимого количества учебных частей, прямым виновником которого являлся Главный штаб, привело к тому, что запасные солдаты попадали в действующую армию без необходимой переподготовки. На низком уровне находилась и тактическая подготовка войск.

В период Русско-японской войны Главный штаб не сумел справиться с некомплектом офицерского состава. Принимаемые меры оказались неэффективны. Немалый вред работе Главного штаба приносили бюрократизм и слепое следование устаревшим инструкциям. Характерный пример этого — история с «воскресшими покойниками». На низком уровне оказались разведка, контрразведка и военная цензура. Основными причинами, затруднявшими работу разведки, были недостаток финансовых ассигнований и квалифицированных кадров, а также отсутствие четкой организации. Особенно плохо был организован сбор разведданных в Японии, что объяснялось пренебрежительным отношением к этой стране. В результате Россия вступила в войну абсолютно неподготовленной. Кроме того, пришлось лихорадочно менять все планы и расчеты Военного министерства.