Использование в качестве двигательной установки «Швальбе» пульсирующих реактивных двигателей предполагало необходимость выполнения взлета с помощью дополнительных ракетных двигателей, так как пульсирующие и прямоточные двигатели требовали для своей нормальной работы большого расхода воздуха, а, следовательно, высокой скорости полета самолета. Собственно поэтому Fi 103 стартовали со специальных эстакад, на которых их разгоняли до необходимой скорости. Они расходовали много топлива, и поэтому оснащенный ими самолет не мог долго находится в воздухе. Кроме того, посадка была практически невозможна. Это было обусловлено трудностью управления тягой As 014, вследствие чего посадочная скорость была бы чрезмерно велика. Маневрирование в воздухе приводило к срыву потока воздуха поступающего в двигатель и могло приводить к его остановке. Правда, его можно было снова запустить, но во время воздушного боя пилот не должен был заниматься то и дело останавливающимся двигателем. Следующим недостатком силовой установки с пульсирующими двигателями была их плохая работа на больших высотах. Оснащенный ими Ме-262 должен был бы ограничиваться перехватом самолетов подлетающих на небольшой высоте. В довершении всего из-за упоминавшихся проблем с обслуживанием, самолет был бы «одноразовым», стартуя на перехват противника — уже не возвращался бы на свой аэродром. Поэтому не удивительно, что «Швальбе» с пульсирующими реактивными двигателями остался только на чертежных досках конструкторов.

На базе «Швальбе» была создана концепция бомбардировщика Р 1099, с полностью новым фюзеляжем, в котором располагался экипаж из нескольких человек и с гондолами двигателей Jumo 004C либо HeS 011 сдвинутыми назад. Этот проект начал разрабатываться с марта 1944 года и получил индекс Р 1099В. От Me 262 А-1а он унаследовал крылья с двигателями, а так же оперение. Экипаж состоял из трех человек. Силовая установка состояла из двигателей Jumo 004C. Самолет был необыкновенно сильно вооружен. Спереди находилась неподвижная пушка МК 103 калибра 30 мм. Две такие же пушки обслуживал стрелок сидящий спиной по направлению полета. Они размещались в задней части фонаря кабины и могли обстреливать верхнюю полусферу. Еще две МК 103 находились в подвижных установках по бокам задней части фюзеляжа и управлялись стрелком дистанционно.

Дальнейшим развитием Р 1099В был Р 1100, который однако был не истребителем, а бомбардировщиком. В самом первом своем варианте, датированном 7 марта 1944 года, этот самолет оснащался двигательной установкой из двух двигателей HeS Oil, размещенных в прифюзеляжных гондолах. Машина имела стреловидные крылья и оперение, экипаж состоял из двух человек. Бомбы должны были размещаться в двух фюзеляжных бомбоотсеках. Трехопорное шасси имело одинарные колеса на всех стойках, передняя из которых убиралась в фюзеляж, а главные в фюзеляж и крылья. Варианты от 22 марта значительно отличались от описанного проекта. В них вернулись к классическому крылу «Швальбе» и двигателям Jumo 004C. Самолет имел длину 12,00 м и размах крыльев 12,613 м. В первом из этих вариантов, кабина экипажа, сидящего тандемом, размещалась не симметрично — сдвинута влево (глядя сверху). Основное шасси состояло из двух двухколесных стоек, убиравшихся в фюзеляж. Второй вариант имел нормальную кабину с фонарями экипажа рядом друг с другом. Самолет был вооружен двумя пушками МК 108 — одна внизу передней части фюзеляжа, стреляющая вперед и одна в задней части, стреляющая назад. Бомбовая нагрузка составляла 2000 кг, а запас топлива 3900 л, в пяти баках — 900, 900, 600, 900 и 600 л.

Ме-262 привлекал внимание не только как основа для новых модификаций или же новых типов самолетов. Испытания с буксируемыми бомбами, проводившиеся на десятом прототипе показали, что «Швальбе» может использоваться для выполнения и такого типа заданий. Рассматривались возможности полетов с летающими бомбами Fi 103 V1, а так же с другими крылатыми снарядами на буксире. Об этих работах осталось очень мало информации, вероятно по той причине, что Ме-262был не слишком пригоден для буксировки тяжелых снарядов, даже при использовании более мощных двигателей. Другая ситуация была с проектом истребителя Me Р 1103, классифицированного как «bordjager», то есть бортовой истребитель. Он должен был доставляться к группам союзных бомбардировщиков другим самолетом. Там Р 1103 отцеплялся бы и проводил самостоятельную атаку. Силовая установка этого миниатюрного самолета, длиной едва 4,7 м, составляли два… стартовых ускорителя R1 202 либо один ракетный двигатель Walter HWK 109-509А-1. Масса самолета равнялась 1100 кг, а вооружение должно было состоять из пушки МК 108 и установки с ракетными снарядами WGr 21.

Конец войны застал в арсеналах Люфтваффе большое количество разнообразного вооружения, зачастую только символической ценности либо находящегося еще на начальной стадии развития. Одним из них была система Mistel. Первоначально предназначенная для атаки крупных надводных целей, вскоре она стала использоваться для атаки сильно укрепленных и трудных для уничтожения наземных объектов. Mistel состоял из двух самолетов, один из которых укреплялся над другим. Верхний самолет исполнял роль станции управления. Его пилот имел в своем распоряжении радиоаппаратуру, служащую для дистанционного управления нижним самолетом. Этот второй самолет не имел экипажа и был, собственно говоря, управляемой бомбой большой массы. Нижний самолет даже получил название «Grossbombe» по названию, использованному Зигфридом Хольсбауэром — автором идеи мощных бомб с собственной двигательной установкой, управляемых по радио с другого самолета. Применявшиеся в боях Mistel состояли из истребителей Bf-109 либо FW-190, а в роли бомб выступали бомбардировщики Ju-88.

Ме-262 так же рассматривался как элемент системы Mistel. Интересно, что в одном из проектов он составлял обе части системы. Самолет управления находящийся сверху, был обычным Ме-262 двухместной модификации A-2a/U2. Аппаратуру управления обслуживал бомбардир лежащий в застекленной передней части фюзеляжа. Нижний самолет был специально приспособлен к новой роли летающей бомбы. С него было снято все лишнее оборудование, ликвидировано и шасси. Фонарь кабины ликвидирован, а ее проем в фюзеляже заделан. В фюзеляже размещалась и боевая часть. Вся система должна была взлетать в воздух с помощью пяти колесной сбрасываемой стартовой тележки.

Другой проект имел название Mistel 4. Управляющим самолетом должен был быть обычный Ме-262 А-1а, а в качестве бомбы предполагалось использовать модифицированный бомбардировщик Ju 287B-1 с крыльями обратной стреловидности, оснащенный двумя двигателями HeS Oil. И в этом случае из нижней машины изымалось все лишнее оборудование, в кабине экипажа устанавливалась боевая часть большой разрушительной мощности. Система должна была стартовать с аналогичной стартовой тележки, с использованием тяги всех двигателей, а так же четырех стартовых ускорителей установленных на тележке. Их использование должно было сокращать разбег на 1/3. После рассоединения с нижним самолетом, Ме-262 мог вступать в воздушный бой как обычный истребитель.

Еще одним проектом предусматривалось использование в качестве бомбы самолета Ju-188, в то время как самолетом управления был Ме-262. Проектные работы над такой системой проводились на предприятиях Юнкерса в Нордхаузене, но они не вышли из начального этапа. Старт должен был осуществляться с помощью собственного усиленного шасси нижнего самолета. Юнкере так же планировал использование «Швальбе» как носителя и управляющего самолета для мощной бомбы с собственным реактивным двигателем — Ju-268. Интересно, что она имела полностью деревянную конструкцию. Только в виде отдельных проработок остался замысел использовать «Швальбе» вместе с летающей бомбой Arado E.377.