Войска Красной армии еще продолжали марши по дорогам Прибалтики, а нарком обороны маршал Советского Союза С.К. Тимошенко 17 июня 1940 г. направил И.В. Сталину и В.М. Молотову докладную записку № 390/сс: «В целях обеспечения скорейшей подготовки Прибалтийского ТВД считаю необходимым немедленно приступить, на территории занятых республик, к осуществлению следующих мероприятий:

1. Границу с Восточной Пруссией и Прибалтийское побережье немедленно занять нашими погранвойсками для предотвращения шпионской и диверсионной деятельности со стороны западного соседа.

2. В каждую из занятых республик ввести по одному (в первую очередь) полку войск НКВД для охраны внутреннего порядка.

3. Возможно скорее решить вопрос «с правительством» занятых республик.

4. Приступить к разоружению и расформированию армий занятых республик. Разоружить население, полицию и имеющиеся военизированные организации.

5. Охрану объектов, караульную и гарнизонную службу возложить на наши войска.

6. Решительно приступить к советизации занятых республик.

7. На территории занятых республик образовать Прибалтийский Военный округ со штабом в Риге.

Командующим войсками округа назначить командующего САВО генерал-полковника т. Апанасенко.

Штаб округа сформировать из штаба 8-й армии.

8. На территории округа приступить к работам по подготовке ее как театра военных действий (строительство укреплений, перешивка жел[езных] дорог, дорожное и автодорожное строительство, склады, создание запасов и пр.).

План подготовки ТВД представлю дополнительно»[1728].

Более радикальное предложение сделал командующий БОВО, направивший в 12.15 21 июня наркому обороны записку: «Существование на одном месте частей литовской, латвийской и эстонской армий считаю невозможным.

Высказываю следующие предложения:

Первое. Армии всех 3-х государств разоружить и оружие вывести в Советский Союз.

Второе. или После чистки офицерского состава и укрепления частей нашим комсоставом – допускаю возможность на первых порах – в ближайшее время использовать для войны части литовской и эстонской армий – вне БОВО, примерно – против румын, авганцев [Так в тексте. – М.М.] и японцев.

Во всех случаях латышей считаю необходимым разоружить полностью.

Третье. После того, как с армиями будет покончено, немедля (48 часов) разоружить все население всех 3-х стран.

За несдачу оружия расстреливать.

К выше перечисленным мероприятиям необходимо приступить в ближайшие дни, чтобы иметь свободу рук, – для основной моборганизационной подготовки округа. Для проведения вышеуказанных мероприятий БОВО готов, лишь прошу приказ по мероприятиям дать за 36 часов до начала действий»[1729]. Правда, столь грубые меры не нашли поддержки в Москве и советское руководство решило реализовать предложение наркома обороны. В ходе начавшегося по решению Народных правительств стран Прибалтики разоружения населения и военизированных организаций к 15 июля только в Латвии и Литве было изъято 36 214 винтовок и карабинов, 21 250 пистолетов, 433 легких и 17 станковых пулеметов, 4 654 единицы холодного оружия, 2 835 гранат, 608 толовых шашек, 1 танк и 5 510 013 патронов[1730].

Тем временем, в связи с завершением ввода войск Красной армии в Прибалтику было решено вывести оттуда лишние соединения. Так, уже 24 июня начальник штаба БОВО издал распоряжение № 018519 о переброске в другой округ 29-й, 113-й и 143-й стрелковых дивизий, которые должны были быть готовы к погрузке в эшелоны соответственно 27, 26 июня и 1 июля[1731]. В тот же день в 16.45 и 17.18 командир 16-го стрелкового корпуса издал приказы №№ 03 и 04 соответственно, согласно которым 143-й стрелковой дивизии следовало в 24 часа выступить из Ширвинтоса и к исходу 29 июня сосредоточиться в Молодечно, а 29-ю стрелковую дивизию было приказано к исходу 26 июня сосредоточить в районе Кайшядорис, Вильнюс для погрузки в железнодорожные эшелоны и переброски в район Белосток, Слоним[1732].

В 14.30 30 июня начальник Генштаба направил наркому обороны докладную записку № 104541/сс с проектом дислокации войск Красной армии в западных приграничных округах:

«1. Представляю на Ваше рассмотрение проект дислокации стрелковых дивизий, конницы и танковых войск.

Представляемая дислокация учитывает намечаемый к организации Прибалтийский военный округ с включением в его состав Латвии, Литвы и западной части Калининского военного округа. Калининский военный округ намечен к расформированию с включением его территории Московскому и Западному военным округам. Территория Эстонии включается в состав Ленинградского военного округа; отходящая к СССР северная часть Буковины к Киевскому Особому военному округу, а Бессарабия к Одесскому военному округу.

2. На территории Ленинградского военного округа намечается дислоцировать, включая и территорию Эстонии:

а) 14 стрелковых дивизий, из них 3 стр[елковых] дивизии и один стр[елковый] полк на территории Эстонии;

б) механизированный корпус в составе 2-х танковых и одной моторизованной дивизии;

в) четыре танковых бригады.

3. На территории намечаемого к формированию Прибалтийского военного округа:

а) 10 стрелковых дивизий;

б) механизированный корпус в составе двух танковых и одной моторизованной дивизии;

в) две кав[алерийских] дивизии;

г) одну танковую бригаду.

4. На территории Западного военного округа:

а) 23 стрелковых дивизий,

б) механизированный корпус в составе двух танковых и одной моторизованной дивизии,

в) одну кав[алерийскую] дивизию,

г) три танковых бригады.

5. На территории Киевского Особого военного округа: