К 1908 году система и порядок обучения в отряде несколько изменились: поступившие в отряд офицеры-слушатели с начала ноября до начала апреля теоретически изучали механизмы и технику, одновременно изучая устройство подводных лодок всех типов, используя зимний период ремонта, когда механизмы лодок были разобраны и доступны осмотру. Во второй период занятий, продолжавшийся с апреля по сентябрь включительно, офицеры-слушатели распределялись по подводным лодкам отряда, причем сначала исполняли на них обязанности специалистов-матросов: рулевых, торпедных, машинных, электромеханических и водолазных частей. В одном из приказов контр-адмирал Э. Щенснович писал: «Офицеры подводного плавания… должны управляться всеми механизмами и лодками самостоятельно, без какого-либо участия нижних чинов. С этой целью для обучения г.г. офицеров лодки должны выходить в море, не имея ни одного нижнего чина и только в должности как офицерские, так равно и должности нижних чинов, должны быть замещены на лодках офицерами согласно расписания…» Затем офицеры практиковались в управлении лодкой и в стрельбе самодвижущимися минами по неподвижной и подвижной цели. Во второй половине июля и в августе, после изучения лодок, офицеры знакомились с условиями службы на них в базах и походах.

Обучающийся офицерский состав комплектовался из офицеров надводного флота, выразивших желание служить в подводном плавании и удовлетворявших по состоянию здоровья особым условиям службы на подводных лодках. Кроме того, требовалось, чтобы офицер, поступающий в число слушателей, прослужил предварительно на надводных кораблях не менее трех лет.

Офицер Российского императорского флота Г. Граф в своей книге «Императорский Балтийский флот между двумя войнами. 1906–1914 гг.» вспоминал: «В то время подводные лодки появились впервые, и молодые офицеры, учитывая их громадное боевое значение в будущем, стали стремиться попасть в отряд (Учебный отряд Подводного плавания. – А.Л.), чтобы сделаться подводниками. Лодки, конечно, были еще очень примитивные, водоизмещением 150–200 тонн, и на них было плавать далеко не безопасно. При испытаниях было уже несколько несчастных случаев, но плавать под водою казалось очень интересным. Мы с приятелем, мичманом Коссаковским, тоже пришли к убеждению, что отчего бы и нам не пойти по подводной части… Поэтому раньше, чем подать официальные рапорты, решили пойти к начальнику отряда и заручиться его согласием взять нас в число слушателей. Адмирал держал свой флаг на транспорте «Хабаровск», который стоял в канале у самого аванпорта и служил маткой для подводных лодок. Весь личный состав подлодок жил на нем, так как на самих лодках жить было нельзя. С большим волнением мы ожидали, пока флаг-офицер ходил докладывать адмиралу… Наконец нас позвали в каюту адмирала. Он сидел за письменным столом и при нашем появлении сейчас же начал нас оглядывать испытующим оком. Мы поклонились и стояли навытяжку. Он не особенно приветливо кивнул головой и отрывисто сказал: «Садитесь»… Добрый час он мучил нас, задавая каверзные вопросы по устройству судов, на которых мы служили. Наконец сурово сказал: «Хотя вы и мичманы и вам следовало бы послужить вахтенными офицерами на больших кораблях, но можете подать рапорты о зачислении в отряд; с моей стороны препятствий не будет». …Через несколько дней я попробовал было заикнуться командиру, что собираюсь подать рапорт о зачислении в подводное плавание. Он так на меня обрушился… и заявил, что он меня не отпустит. После этого я решил отложить всю эту затею».

Офицеры флота, собранные в Офицерском классе Учебного отряда Подводного плавания, занимались не только личной подготовкой как специалисты-подводники, но также привлекались к выработке и развитию концепции использования подводных лодок в войне на море. Общая продолжительность прохождения курса офицерами составляла десять месяцев. В начале октября особая комиссия от флота проверяла знания офицеров, закончивших курс обучения. Выдержавшие испытания назначались на подводные лодки и получали звание «Офицер подводного плавания».

С целью повышения авторитета офицеров-подводников приказом № 19 от 26 января по Морскому ведомству был утвержден специальный нагрудный знак для офицеров, удостоенных звания «Офицер подводного плавания».

«Государь Император в день 26 января сего года, Высочайше соизволил утвердить нагрудный знак… для офицеров флота, успешно выдержавших выпускные практические испытания и удостоенных звания Офицеров подводного плавания. О таком Высочайшем соизволении объявляю по Морскому ведомству для сведения и руководства.

Подписал Морской министр, Свиты Его Величества контр-

адмирал Воеводский».

Нагрудный знак представлял собой серебряный 84-й пробы круг, образованный якорь-цепью, внутри которого были вертикально размещенный и обвитый канатом якорь Холла и горизонтально расположенный силуэт подводной лодки. На обороте знака, в середине имелся стержень с винтовой нарезкой и гайкой с двумя обушками, для закрепления на мундире. Означенный знак носился офицерами-подводниками на правой стороне груди.

Ученики-подводники комплектовались из специалистов надводного флота, окончивших ранее минную, машинную или водолазную школы, при этом прохождение курса делилось на два периода. В течение первого периода подводники изучали устройство лодок всех типов и их механизмы, а также особенности свой специальности применительно к подводному плаванию. После экзаменов, во второй период занятий, учеников разделяли по лодкам, где они закрепляли на практике свои специальные знания. Ученики комплектовались преимущественно из специалистов старшинского звания, желающих служить на подводных лодках, прошедших медицинской отбор и годных к службе по состоянию здоровья. По итогам обучения специальная комиссия проверяла знания моряков, закончивших курс обучения.

Не менее важным делом была подготовка и слаженность действий экипажа подводной лодки в целом. С этой целью разработали документ: «Курс подготовки подводных лодок», который предусматривал все этапы подготовки по принципу «от простого к сложному», со сдачей лодкой соответствующих «задач», принимаемых штабом и флагманскими специалистами соединения подводных лодок.

Впервые «задачу № 1» сдала подводная лодка «Щука» под командованием лейтенанта И.И. Ризнича в июле 1905 года.

В Российском Государственном архиве ВМФ сохранился рапорт контр-адмирала Э.Н. Щенсновича в Главный Морской Штаб от 30 июня 1905 года:

«…Для осмотра с целью определить степень подготовленности командира, офицеров и команды миноносца «Щука» прошу Главный Морской Штаб о назначении комиссии от Флота. Проект программы такого осмотра представляю.

Заведующий подводным плаванием контр-адмирал Щенснович».

Учебная база отряда Подводного плавания постоянно совершенствовалась и расширялась. Для занятий офицеров-слушателей и учеников построили классы: минный, электротехнический, машинный, аккумуляторный, оборудовали лабораторию для исследования топлива и смазочных масел. В мае 1913 года начальником Учебного отряда Подводного плавания был назначен капитан 1-го ранга Е.Н. Одинцов, боевой офицер и отличный организатор, до этого служивший помощником начальника Учебно-артиллерийского отряда Балтийского флота.

Евгений Николаевич Одинцов по окончании Морского Корпуса плавал на транспорте «Артельщик» и на миноносце «Анакрия» в 1890 году. В январе 1891 года произведен в лейтенанты. Минный офицер миноносца «Гогланд», минный офицер крейсера «Опричник», канонерской лодки «Бобр», крейсера «Память Азова». В 1902