На начало перестройки в войсках по охране железнодорожных сооружений насчитывалось семь дивизий и пять бригад, дислокация которых осуществлялась по принципу «Часть охраняет дорогу».

Согласно директиве Управления войск по охране особо важных предприятий промышленности от 10 февраля 1942 года, подчиненные части должны были перейти к выполнению служебно-боевых задач гарнизонами с 1 апреля 1942 года [10]. К этому числу командование частей обязывалось подобрать место и разместить гарнизоны таким образом, чтобы тратилось минимум времени на смену нарядов и своевременное прибытие личного состава на объект для отражения нападения диверсионных групп или десантов противника. Основными видами нарядов в гарнизонах являлись: часовые, дозоры, патрули, секреты и засады. Служебно-боевая деятельность, таким образом, стала представлять собой совокупность действий различных видов нарядов по охране объектов, высылаемых начальником гарнизона непосредственно из места размещения личного состава. Соответствующее изменение претерпела организация боевой подготовки и воспитательной работы в частях и гарнизонах.

Перестройка службы в войсках по охране особо важных предприятий промышленности вызвала неизбежные изменения во взаимоотношениях с другими видами охраны на тех предприятиях, где еще существовали ведомственная военизированная охрана (ВВО), военизированная пожарная охрана (ВПО) и вахтерская охрана (ВО), состоящие из отдельных команд. В их ведении находились небольшие цеха, мастерские, склады ГСМ, другие второстепенного значения производственные участки и подсобные помещения. И хотя в своей деятельности эти команды руководствовались положениями, утвержденными ведомственными наркоматами, в оперативном отношении по вопросам организации и несения службы, соблюдения правил пропускного и внутриобъектового режимов, вооруженная вахтерская и ведомственная охраны подчинялись начальнику гарнизона, который, по существу, являлся полностью ответственным за охрану всего объекта.

В войсках по охране железнодорожных сооружений перестройка коснулась лишь вопросов переформирования личного состава в гарнизонах и приведения их штатов в соответствие с объявленными типами. Из-за возросшей угрозы нападения диверсионных групп противника на охраняемые объекты в прифронтовой полосе и на сопредельных территориях приказом начальника Управления войск по охране железнодорожных сооружений от 5 мая 1942 года в частях была запрещена организация службы по шаблону [11]. Не разрешалось выставлять наряды по табелю постам, а организовывать службу только на основе сложившейся обстановки. Количество нарядов, их расположение должны были определяться начальником гарнизона, чередоваться по видам и выставляться в разное время. Приказ, таким образом, давал начальникам гарнизонов широкие возможности для маневра силами и средствами, позволял разумно подходить к вопросу о плотности охраны, об использовании особенностей прилегающей к объекту местности.

Исключительными по своей значимости стали мероприятия в войсках НКВД по охране железнодорожных сооружений и особо важных предприятий промышленности по созданию агентурной сети. В предвоенные годы войска не занимались этим вопросом. Войсковые методы службы, помощь бригад содействия в полной мере обеспечивали надежность охраны. Однако сложные условия военного времени, постоянная угроза нападения диверсионных групп на охраняемые объекты, увеличение количества производств и сооружений, расширение задач — все это побудило НКВД СССР принять решение о создании разведывательных аппаратов в частях по охране железнодорожных сооружений и особо важных предприятий промышленности. Приказом от 17 июля 1942 года в штабах дивизий, полков были сформированы разведывательные отделения. Перед оперативными подразделениями ставилась задача развернуть на вверенных объектах агентурно-разведывательную работу с целью совершенствовать формы борьбы с вражеской агентурой и преступностью, а также осуществлять общее руководство деятельностью бригад содействия [12]. При этом важным направлением работы оперативных аппаратов являлась разведка прилегающей к объекту местности, подходов к периметру. Радиус активных действий создаваемой агентуры определялся в 15 и более километров вокруг объекта. При этом считалось, что вопросы совершенствования внутриобъектового режима можно было решать с помощью бригад содействия.

К концу мая 1942 года перестройка служебно-боевой деятельности была в общих чертах завершена. Войска по охране особо важных предприятий промышленности выполняли обязанности на 378 объектах, в том числе на 41 объекте Наркомата боеприпасов, 28 — Наркомата вооружения, 35 — Наркомата авиационной промышленности, 50 электростанциях, 117 объектах Наркомата связи, 25 — Наркомата химической промышленности. В составе 723 гарнизонов службу несли 5597 суточных постов и 2349 блокпостов служебных собак. Из указанного количества гарнизонов имелось: 1‑го типа — 130, 2‑го — 86, 3‑го — 120, 4‑го — 150, 5‑го — 131, 6‑го — 106. Накопленный опыт перестройки позволил Управлению войск по охране особо важных предприятий промышленности разработать и выслать в войска для руководства «Временную инструкцию по службе гарнизонов», ставшую нормативным документом новых методов выполнения служебно-боевых задач по охране объектов в военное время.

Перестройка преследовала и другую цель — снизить затраты на охрану объектов. Более рациональное использование личного состава, даже с учетом увеличения количества охраняемых объектов на 39 единиц и 647 выставляемых постов, позволило уменьшить в войсках расчетное число личного состава на один пост с 14–16 до 11–12 человек. А это, в свою очередь, позволило сократить общую численность войск более чем на двадцать пять тысяч человек и создать резерв в количестве более пяти тысяч бойцов и командиров, за счет которых были сформированы один запасной полк и два отдельных батальона.

Реорганизация существующей ранее системы служебно-боевой деятельности позволила ликвидировать обезличку, повысить ответственность командного состава за состояние охраны и обороны объектов. Дислокация гарнизонов на объектах или максимальное приближение личного состава к ним создали предпосылки более надежной, гибкой и активной обороны. Располагаясь непосредственно на объектах, бойцы и командиры вольно и невольно, в реальных условиях обстановки, с учетом особенности местности могли непрерывно совершенствовать системы охраны и оборонительных сооружений. На большинстве объектов и вблизи периметров кроме окопов полевого типа были построены ДЗОТы с амбразурами для ведения огня из пулеметов с перекрытиями сооружений в 1–2 наката из бревен. В процессе подготовки обороны крупных объектов имелись случаи, когда вокруг периметра строились от 4–6 до 10–12 долговременных огневых точек. Территория охраняемых объектов и прилегающая местность разбивались на секторы, на которых в соответствии со значимостью каждого возводилось соответствующее количество оборонительных сооружений. Вокруг объектов или на отдельных направлениях создавались запретные зоны, границы которых обозначались предупредительными знаками. Оказавшиеся в запретной зоне лица задерживались и передавались в местные органы НКВД или милиции.

Период перестройки службы в войсках совпал с проведением ряда других мероприятий НКВД СССР. С февраля по июнь 1942 года из состава войск по охране особо важных предприятий промышленности был передан на укомплектование вновь создаваемых внутренних войск НКВД СССР наиболее подготовленный личный состав в количестве свыше двадцати шести тысяч бойцов и командиров. Войска по охране железнодорожных сооружений передали свыше семнадцати тысяч человек. Взамен войска по охране особо важных предприятий промышленности получили из военкоматов и запасных частей Красной Армии около двадцати пяти тысяч человек старших возрастов и ограниченно пригодных для выполнения служебно-боевых задач. Войска по охране железнодорожных сооружений получили взамен аналогичное пополнение [13].