Две в достаточной степени известные и значимые партии не были допущены до участия в выборах: Национал-большевистская партия (НБП) Эдуарда Лимонова и партия "Либеральная Россия" Бориса Березовского - Ивана Рыбкина.

НБП отрезали от выборов еще на дальних подступах: эта партия не смогла получить официальную регистрацию Минюста, несмотря на все свои усилия. Формальные предлоги, которые выдвигал Минюст для нерегистрации, были явно лицемерными. Реальная причина отказа - нежелание допустить НБП, популярную среди молодежи (и еще более потенциально популярную среди той же молодежи) к выборам. НБП не являлась тогда и не является сейчас серьезной электоральной силой. Но еще меньше такой силой являлись примерно 13 из 23-х тогдашних партий и блоков, участвовавших в думских выборах 2003 г. А при определенных условиях НБП могла рассчитывать даже на преодоление 5-процентного барьера.

Но в итоге НБП осталась полухулиганской тусовкой томато-, яйце и майонезометателей, а голоса впервые пришедших на выборы подростков вместо НБП получила ЛДПР Владимира Жириновского, теряющая поддержку представителей старших поколений от выборов к выборам, чего, видимо, и хотели в Кремле. Партию Жириновского там со времен Ельцина холят и лелеют, а партию Лимонова ненавидят и откровенно боятся.

"Либеральная Россия" Березовского - Рыбкина возникла в результате раскола старой "Либеральной России" (лидеры - Сергей Юшенков, Виктор Похмелкин, Борис Березовский) на две одноименные партии. Минюст и Центризбирком предпочли считать легитимной "ЛибРоссию", возглавляемую Виктором Похмелкиным, которая и выступила на выборах под именем "Новый курс - Автомобильная Россия" (и получила 0,84% голосов, 12-е место).

Партия Березовского считалась "непроходимой", и, действительно, ее рейтинг не превышал 0,5-1%. Но, во-первых, эти замеры проводились в условиях, когда партия практически нигде (кроме "Независимой газеты" и интернета) не могла сама сказать о себе. Регистрация и официальное участие в выборах могли бы дать ЛР(б) условия для самопредставления, сравнимые хотя бы с теми, которые получила ЛР по версии Похмелкина. Но если "автомобильную" ЛР(п) трудно было считать партией, политически отличимой от умеренно-демократического фона, то ЛР(б) могла реально претендовать на нишу последовательной демократической оппозиции путинизму. Тем более, что из этой ниши осенью 2003 г. выкатилось ранее занимавшее ее "Яблоко" (голосовавшее за "обрезание" права на референдум, поддержавшее во втором туре Матвиенко в Питере и прекратившее критику лично Путина). ЛР(б) могла поглотить антипутинскую составляющую электората "Яблока" и благодаря этому преодолеть 5-процентный барьер.

Во всяком случае, предположения о шансах НБП и ЛР(б) не могли быть экспериментально проверены, поскольку эти две партии были отсечены от участия в выборах по довольно сомнительным формальным основаниям.

Отсечение от выборов нежелательных для властей участников особенно нагло, откровенно и издевательски происходило в одномандатных мажоритарных округах. Препятствия в регистрации и снятие уже зарегистрированных кандидатов наблюдались на думских выборах 2003 г. десятками. Иногда это был просто продукт борьбы между самими кандидатами, которые пытались снять друг друга с выборов с помощью судов и избиркомов - в этих случаях Центризбирком и Верховный суд в Москве иногда проявляли объективность и восстанавливали регистрацию. Иногда это была инициатива местной власти, которая убирала своих критиков, - Москва в данном случае могла подтвердить или не подтвердить ликвидацию кандидата, исходя из политической целесообразности. Но иногда это был прямой заказ "из-за стенки" (кремлевской) - и тогда любые жалобы несостоявшегося кандидата были бессильны.

Вот только некоторые наиболее громкие примеры применения этой избирательной технологии на думских выборах 2003 г.

В Бурятском округе № 9 ради победы кандидата от "Единой России" Анатолия Старикова было отказано в регистрации кандидату КПРФ, бывшему генпрокурору Юрию Скуратову, о котором некогда сам Путин (тогда - директор ФСБ) утверждал в телевизоре, что "человек, похожий на генерального прокурора", который развлекается с проститутками на знаменитой порнопленке, и есть сам генеральный прокурор. А ранее "человек, похожий на директора ФСБ", передал Михаилу Швыдкому саму порнопленку для показа ее по второму государственному каналу. Видимо, после этой истории Путин стал считать Скуратова своим личным врагом, мечтающим о мести.

Для отказа в регистрации бывшему генпрокурору был избран абсурдный предлог "предоставление недостоверных и не в полном объеме сведений о занимаемой должности", а именно: Скуратов указал свою должность завкафедрой Московского социального государственного университета (МСГУ), но "скрыл" от избирателей, что является еще и профессором этого университета. Кроме того, справка о партийности Скуратова была подписана не председателем ЦК КПРФ Геннадием Зюгановым, а его заместителем Валентином Купцовым.

Председатель ЦИК А. Вешняков поначалу пытался соблюсти приличия: 4 ноября Центризбирком отказ в регистрации Скуратова опротестовал. Однако областной избирком 11 ноября подтвердил отказ. На следующее заседание ЦИКа по жалобе Скуратова А. Вешняков, осознавший желание Кремля, просто не пришел, сказавшись больным. В отсутствие своего председателя ЦИК оставил без изменений решение окружной комиссии. Скуратов пожаловался в Верховный суд, но тот его жалобу отклонил.

(Через пару месяцев кандидат в президенты Владимир Путин указал в регистрационных документах, что занимает в настоящее время пост президента, "скрыв" от избирателей, что он является еще и председателем в Совете безопасности и главнокомандующим. Представитель коммунистов в ЦИК Вадим Соловьев задал по этому поводу А. Вешнякову ехидный вопрос со ссылкой на "казус Скуратова", но Путина, разумеется, зарегистрировали).

Кроме одномандатного округа, экс-генпрокурора под тем же предлогом лишили также права баллотироваться в списке КПРФ (5-е место в Уральской группе кандидатов). Скуратов и тут пытался пожаловаться, но Верховный суд не встал на его сторону.

В Курской области в Курском округе № 97 был снят с регистрации бывший вице-президент России Александр Руцкой - так же, как Скуратов, подозреваемый в мстительных чувствах по отношению к президенту (поскольку в 2000 г. Кремль воспрепятствовал его переизбранию главой администрации Курской области). Предлог использовался зеркально противоположный тому, под которым лишили права баллотироваться Скуратова: Руцкой, наоборот, указал в своих регистрационных документах должность советника ректора - проректора по общим вопросам Московского городского социального университета (МГСУ), которую он фактически занимал. Руцкой представил в доказательство копию трудовой книжки и копию приказов о своем назначении, но, как выяснилось, такая должность не значилась на момент регистрации в штатном расписании МГСУ. Курский областной суд отказался удовлетворять иск против Руцкого, посчитав, что документы заполнены верно, но после этого дело Руцкого было передано в Верховный суд, который и лишил его регистрации.

В Тихорецком округе № 45 (Краснодарский край) был снят с регистрации кандидат от КПРФ, депутат Госдумы 3-го созыва Николай Денисов, "что позволило победить в этом округе брату губернатора Алексею Ткачеву".