В империи на западе первоначально планировалось (в 1622 г.) предоставить верховную власть одной торговой компании, ВИК, опять-таки под конечным суверенитетом Генеральных Штатов. Но в этом случае, в отличие от Ост-Индии, с самого начала существовал целый ряд окраинных колоний и зон влияния, которые не управлялись напрямую ВИК. С целью получения прибыли от частных предприятий в не имевших столь жизненно важного значения регионах, ВИК выдавала патенты определенным лицам, собиравшимся колонизировать оговоренные местности, предоставляя им право самим управлять новыми территориями под генеральной эгидой ВИК. Ни одна из них не стала процветающей колонией, но некоторые действительно развились на окраинах Нидерландской империи. Одно из территориальных дарений было сделано зеландскому регенту Абрахаму ван Пере в 1627 г., по которому он получил устье реки Бербик в западной Гайане. Маленькая колония на Бербике продолжала управляться династией ван Пере на протяжении многих десятилетий. В 1650 г. еще одна зеландская регентская семья, Лампсины, получила разрешение на колонизацию Тобаго, который они переименовали в «Новый Валхерен». На протяжении большей части периода (1654-78 гг.), когда Тобаго принадлежал нидерландцам, им управляли Лампсины, главный форт на острове назывался Лампсинсберг.

Более того, хотя Нидерландская Бразилия и форты на гвинейском побережье управлялись ВИК в целом, в случае с другими, принадлежавшими ВИК территориями или зонами влияния, существовала тенденция к передаче ответственности одной из пяти палат — Амстердамской, Зеландской, Маасской, Северной четверти и Гронингенской. Таким образом, Амстердамская палата несла особую ответственность за острова Кюрасао и Новые Нидерланды, тогда как Зеландская палата управляла западной Гайаной и, на начальном этапе периода, нидерландскими Наветренными островами. Среди зон торгового влияния область Гамбия в Западной Африке была отведена Гронингену.

В 1657 г. Зеландская палата передала свою ответственность за западную Гайану трем городам — Мидделбургу, Флюшингу и Веру, которые учредили совместный директорат во главе со своими бургомистрами для управления этим регионом под новым названием «Новая Зеландия», который, помимо Эссекибо и Бербика, включал поселение, основанное зеландцами еще дальше на западе, в Померуне. Когда первоначальная ВИК была ликвидирована и в 1674 г. учреждена новая ВИК, западная Гайана впервые перешла под ее прямое управление, за исключением Бербика, оставшегося во владении семьи ван Пере.

Проблема стала еще более сложной после того, как Суринам был завоеван зеландцами в 1667 г. Новой колонией вначале управлял директорат трех городов Валхерена (Мидделбурга, Флюшинга и Вера), пока в 1674 г. не была учреждена новая ВИК, после чего она перешла под прямое управление Штатов Зеландии. Наконец, в 1682 г. был создан новый орган, получивший название «Общество Суринама», главными партнерами в котором были совместно ВИК и город Амстердам, но большая доля принадлежала также семье Арсен ван Соммелсдейк. Тем временем, нидерландские Наветренные острова — Саба, Синт-Эстатиус и Сен-Мартен — оставались в частном владении, пока не были захвачены англичанами во время третьей англо-голландской войны. Когда они были возвращены по условиям мирного договора 1674 г., владение островами Синт-Эстатиус и Саба было разделено в соотношении 50:50 между ВИК и семьей ван Пере. Затем ван Пере в 1683 г. продали свою часть имущественных прав Компании, после чего все три острова впервые попали под прямое управление ВИК.

Но несмотря на эту более фрагментарную картину, некоторые принципы колониальной администрации на западе, по крайней мере, в основных колониях, напоминали положение в Ост-Индии и Южной Африке. Снова губернаторы и главные должностные лица Компании не были дворянами и управление осуществлялось на консультативной основе. Нидерландские базы на гвинейском побережье управлялись из крепости Эльмина генеральным директором ВИК на гвинейском побережье. Но он, как предполагалось, принимал основные решения только совместно с raad'ом, также находившимся в Эльмине. Аналогичным образом, губернатор Кюрасао, который также нес ответственность за Арубу и Бонайр, назначался федеральным советом ВИК, которому он приносил присягу вместе с Генеральными Штатами. Но в соответствии с данными ему инструкциями он был обязан управлять всеми островами совместно с raad'ом в Виллемстаде, в состав которого входили, кроме командующего гарнизоном и агента ВИК по работорговле, три представителя от горожан. Похожим было положение в Суринаме, где функции обороны, отправления правосудия и поддержания общественного порядка, в том числе подавление восстаний рабов, совместно осуществляли губернатор и raad в Парамарибо.

В своей деятельности ОИК и ВИК могли преследовать, главным образом, торговые интересы, но для получения прибыли в том объеме, к которому они стремились, невозможно было обойтись, в Европе или в Индиях, без военной и территориальной власти; а в рамках раннего Нового времени религия была одним из самых могущественных инструментов контроля над территориями и населением.

Хартии, выданные ОИК (1602 г.) и ВИК (1622 г.), делегировали им суверенную власть Генеральных Штатов над военными и военно-морскими силами, а также дипломатами, состоявшими у них на службе в Индиях. Все военные и военно-морские предприятия ОИК и ВИК в Азии, Африке и Америке, и дипломатическая деятельность осуществлялись от имени Генеральных Штатов, также как и соответствующих компаний. Но в других отношениях великие колониальные компании также были придатками нидерландского конфедеративного государства. Так, обе компании в соответствии с пожалованными им хартиями и инструкциями их директоров были обязаны всемерно покровительствовать и защищать нидерландскую реформатскую Церковь как единственную государственную Церковь в своих колониях, а также предоставлять свободу совести отдельным лицам в соответствии с Утрехтской унией. Точно так же компании и их колониальные правительства не забывали направлять часть своих средств на сохранение и расширение верховенства государственной Церкви. По сути дела, веротерпимость в нидерландской колониальной империи была едва ли менее ограниченной и вынужденной (и в еще большей степени в Новых Нидерландах и Южной Африке), чем в самой Республике.

Экипажи кораблей и гарнизоны ОИК, а также ее старшие чиновники были в духовных вопросах подчинены нидерландской реформатской Церкви. Несмотря на вербовку на службу Компании большого количества иностранцев в качестве моряков и солдат, на кораблях и в гарнизонах ОИК не разрешалось проводить ни лютеранских, ни католических богослужений. В период до 1660 г. около 65% всех солдат и 35% моряков, завербованных ОИК на службу в Ост-Индии, были европейцами-иностранцами, и хотя нидерландский элемент несколько увеличился между 1660 и 1700 гг., доля немцев и скандинавов всегда оставалась высокой. Однако в течение XVII и первой четверти XVIII вв. нигде в нидерландской империи в Азииили Южной Африке не разрешалось строить ни одной лютеранской церкви.

Дисциплинарный кодекс, введенный в гарнизонах и на кораблях ОИК, и наказания за его нарушения были составлены Генеральными Штатами. На кораблях ОИК запрещалось богохульствовать или неуважительно отзываться о реформатской вере или ее проповедниках, под угрозой штрафов и других видов наказаний. Можно было получить разрешение отсутствовать на реформатских богослужениях, но отсутствие без разрешения наказывалось штрафом. Существовали также наказания за разжигание споров на религиозную тему. Помимо штрафов, провинившимся лицам зачастую приходилось целыми днями подряд работать за корабельными помпами или сидеть на вершине мачты. Суровые меры взыскания предусматривались также за пьянство и азартные игры.