В результате неожиданно открытого немцами артиллерийского огня и авиационных налетов застигнутые врасплох части гарнизона крепости понесли большие потери убитыми и ранеными. Особенно большие потери имели части и подразделения, находившиеся в центральной части крепости (цитадели).

Для выхода из крепости на восток можно было использовать только одни северные ворота, но по ним противник сосредоточил наиболее сильный артиллерийский огонь. Поэтому выйти из цитадели смогли лишь отдельные подразделения, которым вывезти какую-либо материальную часть не удалось. Не смог вырваться даже разведывательный батальон 6-й стрелковой дивизии, имевший на вооружении легкие танки Т-37А/Т-38 и бронемашины.

В кратком боевом отчете о действиях 6-й стрелковой дивизии так описывается начало борьбы за крепость:

С началом артиллерийской подготовки противника в 4 часа в городе и крепости погас свет, а было еще довольно темно. Телефонная связь с городом прекратилась. Это еще больше усилило растерянность личного состава. Средних командиров в батальонах насчитывалось единицы. Командиры, сумевшие пробраться в крепость, вывести части и подразделения не смогли и остались в крепости. Так, например, командир 44-го стрелкового полка 42-й стрелковой дивизии майор П.М. Гаврилов, пробравшийся в первый час артиллерийского налета к своему полку, не смог вывести его остатки из крепости и остался на месте, возглавив оборону восточного сектора крепости. По воспоминаниям Гаврилова, все выходы из бастионного кольца крепости находились под таким сильным артиллерийским, минометным, а позже и пулеметным огнем, что 98-й отдельный дивизион ПТО при попытке прорваться из крепости был почти целиком уничтожен.

Следовательно, большое количество личного состава частей 6-й и 42-й стрелковых дивизий осталось в крепости не потому, что они имели задачу оборонять крепость, а потому, что не могли из нее выйти.

Артиллерия, находившаяся в открытых артиллерийских парках крепости, в большей своей части была уничтожена огнем противника на месте. Почти целиком погиб конский состав артиллерийских и минометных частей и подразделений дивизий, находившийся во дворе Брестской крепости у коновязей. Автомашины автобатальонов и других частей обеих дивизий, стоявшие в объединенных открытых автопарках, были сожжены. Все документы и имущество частей остались в крепости.

Заместитель командира 6-й стрелковой дивизии по политической части полковой комиссар М.Н. Бутин доносил о результатах артиллерийского обстрела немцами Брестской крепости и условиях выхода частей по тревоге следующее:

Воинские части и учреждения Численность и вооружение Примечания Наряды 9-й линейной и 3-й резервной погранзастав 3-й погранкомендатуры 17-го Краснознаменного погранотряда Точная численность неизвестна, исходя из норматива плотности охраны границы на участке Брестского погранотряда — 7 чел. на 1 км при возможности размещения нарядов вдоль Буга и на «внешней» границе (500 м) — в пределах 8-10 человек; вооружение: винтовки, ручной пулемет Полковая школа (школа младшего командного состава) 84-го стрелкового полка им. Коминтерна В крепости осталось дежурное подразделение и караул (50–60 человек), а также освобожденные от полевого выхода во главе с командиром отделения пульвзвода И. Долгоновым; на вооружении: винтовки, три ручных пулемета Накануне войны была выведена на артиллерийский полигон 4А в деревне Волынка 95-й медсанбат 6-й стрелковой дивизии Всего 253 человека; на вооружении 135 единиц стрелкового оружия, в том числе два пистолет-пулемета Брестский военный госпиталь № 2396 окружного подчинения (расформировываемый) и корпусной полевой госпиталь 28 ск Точные данные отсутствуют, штаб полевого госпиталя (№ 4/5) — 108 человек, из них 48 человек вольнонаемные, расчитан на 150 коек; личное оружие — только у командования: 4–5 пистолетов На 22 июня был назначен переезд медперсонала Брестского окружного госпиталя в Пинск; больных — 160 чел. — частично эвакуировали в Пинск (80 чел.), а частично (еще 80 чел.) передали в 95-й мотострелковый батальон Дежурная смена ДОТ, строители Данных нет Итого (л/с) Около 180 человек На дежурстве 40 человек