Для приёма граждан СССР из-за границы, направляемых водным путем, в разное время были созданы сборно-пересыльные пункты в Выборге, Мурманске, Одессе и Баку. Штатный состав каждого СПП — 6 офицеров, 3 сержанта, 10 рядовых и 2 человека вольнонаёмных{125}. Существенно раньше, еще с 1944 г., действовали и проверочно-фильтрационные пункты (ПФП) НКВД, расположенные цепочкой вдоль границы СССР. По состоянию на 23 декабря 1944 г. их было всего 15: в Молдавии — Болград и Кишинёв, в Черновицкой области — Черновцы, в Дрогобычской — Мостиска и Хыру, во Львовской — Рава-Русская и Яворув, в Волынской — Владимир Волынский, в Белоруссии — Брест, Волковыск и Гродно, в Литве — Высоко-Литовск и Пружаны, в Ленинградской области — Выборг, в Карелии — Сортавала. Лица, проходившие в них проверку, зачислялись в спецконтингент НКВД только по результатам проверки ПФП. Пропускная способность каждого проверочно-фильтрационного пункта составляла около 3 тысяч человек{126}.

Ещё в декабре 1944 г. в республиканские и областные совнаркомы за подписью Ф.И. Голикова были разосланы письма, где предлагалось выявить и учесть по каждой области и району фактические возможности по приёму репатриантов, организовать по 2–3 областных приёмо-распределительных пункта (ПРП) ёмкостью 1–3 тыс. человек и сеть районных{127}. Ответственность за ход репатриации на республиканском уровне возлагалась на специальных уполномоченных, а также на заместителей председателей республиканских СНК.

6 января 1945 г. СНК СССР принял постановление об организации приёма и устройстве репатриируемых граждан СССР{128}. В феврале — марте 1945 г. органы репатриации были созданы во всех семи затронутых оккупацией союзных республиках{129}:

Наименов. республик Отделы Приёмо-распределительные пункты При СНК республик При облисполкоме При уисполкоме Республиканские Областные Уездные и районные кол. чел. кол. чел. кол. чел. кол. чел. кол. чел. кол. чел. РСФСР 1 5 20 160 — — — — 31 248 125 125 УССР 1 10 24 120 — — — — 40 320 1 3 БССР 1 8 12 48 — — — — 12 60 — — Эст. ССР 1 7 — — 10 30 4 12 — — — — Лит. ССР 1 8 — — 20 40 5 25 — — 11 33 Лат. ССР 1 8 — — 19 57 3 9 — — 19 38 Молд. ССР 1 8 — — 6 12 2 10 — — 6 18 Итого: 7 54 56 328 55 139 14 56 83 628 152 217

Из таблицы видно, что отделы по репатриации были созданы при 7 республиканских СНК, 56 облисполкомах и при 55 уездных исполкомах. Кроме того, действовала сеть из 249 приёмо-распределительных пунктов, в том числе 14 республиканских, 83 областных и 152 уездных. Местные органы осуществляли приём репатриированных советских граждан, трудовое и хозяйственно-бытовое устройство их, а также материальное обеспечение и политическое воспитание. Практическое руководство этой работой в республиках было возложено на заместителей председателей Совнаркомов, в областях и районах (уездах) — на заместителей председателей исполкомов, в городах — на председателей исполкомов депутатов трудящихся.