В марте 1986 года Соединенные Штаты после долгих раздумий решили пойти на риск и модернизировать поставляемое оружие, включив в него самую современную ручную зенитную ракету "Стингер". Эти ракеты вступили в строй в сентябре и сбили множество советских и афганских самолетов и вертолетов (в том числе, по крайней мере, один гражданский пассажирский самолет). Они также были незаконно переправлены в другие страны: Иран приобрел некоторые из них у афганских повстанцев, а Китай - у Пакистана. К началу 1990-х годов ЦРУ пыталось выкупить "Стингеры" по завышенным ценам у различных афганских группировок. Несколько штук было использовано в 1992 году против узбекских (номинально таджикских) самолетов в ходе распространения исламского восстания из Афганистана на новую независимую бывшую советскую республику Таджикистан.

Соединенные Штаты также предоставили финансирование для обучения антикоммунистических афганцев пропаганде "связей с общественностью" на Западе, а также предоставили передатчик для Радио Свободный Афганистан ("Голос свободного Афганистана"), которое тайно вещало из Пакистана после октября 1985 года. И, как часть военной поддержки, помимо вооружения и обучения современным видам оружия, таким как "Стингеры", ЦРУ также сотрудничало с ИСИ в обучении афганцев диверсионно-террористическим операциям в городах и поставляло снайперское оружие и пластиковую взрывчатку.

Самым опасным американским действием, предпринятым, по-видимому, по собственной инициативе в октябре 1984 года (еще до появления NSDD-166), было поощрение афганских повстанцев к совершению рейдов на советскую территорию с целью военного преследования, саботажа и подрывной пропаганды (включая распространение Корана) в Узбекистане и Таджикистане. После того, как об этой программе стало известно в Вашингтоне, она была свернута. Афганские повстанцы сами иногда совершали рейды на советскую территорию.

Соединенные Штаты также участвовали, без особого внимания или интереса на высоком уровне, в переговорах между Афганистаном и Пакистаном, проводимых под эгидой ООН в Женеве с 1982 по 1988 год. На протяжении всего этого периода, за исключением нескольких высокопоставленных чиновников в 1987-88 годах, не было никаких надежд на то, что Советский Союз когда-либо согласится уйти. Более того, многие в Вашингтоне предпочитали, чтобы они остались и "пускали кровь". Все внимание было сосредоточено на ведении войны в Афганистане, чтобы измотать Советский Союз. Такое невнимание к переговорам на высоком уровне впоследствии привело к определенным трудностям на заключительных переговорах в 1988 году.

Наряду с усилением американской военной поддержки моджахедов в Афганистане после 1985 года в рамках доктрины Рейгана, в июле 1985 года было наконец получено одобрение Конгресса на отмену поправки Кларка, разрешающей возобновление поставок оружия повстанцам в Анголе. Вопрос о том, стоит ли это делать, обсуждался несколько месяцев, но администрации удалось получить разрешение на это, о чем было объявлено в январе 1986 года, когда Савимби посетил Вашингтон и был принят президентом Рейганом, который с гордостью назвал бывшего маоистского партизана "борцом за свободу".104 Хотя военная помощь была оказана в гораздо более ограниченном масштабе, чем афганским повстанцам, решение о поставке зенитных ракет "Стингер" повстанцам в обеих странах было принято одновременно (март 1986 года).

Как уже отмечалось ранее, на практике "Доктрина Рейгана" была гораздо более узконаправленной, чем предполагали ее широкие моральные, идеологические и геополитические термины. Никарагуа была первой ключевой целью во времени и оставалась важной в основном из-за внутриполитического резонанса доктрины Монро в сочетании с двухпартийной политической невралгией по поводу кубинского влияния кастроитов. Но он также становился все более раскольническим, противоречивым и в конечном итоге - даже до "Иран-контра" - политическим обязательством. Афганистан оставался наиболее политически поддерживаемой заявкой, причем Конгресс выделил даже больше средств, чем запрашивала администрация. Обоснование было в основном антисоветским, частично (особенно в первые годы) подпитываемым страхами перед дальнейшей советской экспансией в регионе, а частично (особенно в более поздние годы) - тем, что Афганистан представлялся хорошей возможностью навязать тяжелое бремя.

Ангола сочетает в себе антикубинские и антисоветские мотивы с особым давлением со стороны политической элиты, которая приветствует общий фронт с Южной Америкой.

Напротив, несмотря на логику и протесты правых, в Мозамбике (где не было советских или кубинских войск, хотя эти страны оказывали определенную экономическую и военную поддержку, включая советников) администрация продолжала придерживаться дипломатического курса, призывая к урегулированию путем переговоров. Американская стратегия, по словам Шульца, заключалась в том, чтобы "подружиться с Саморой Машелом (тогдашним президентом Мозамбика) и переманить его из советского лагеря". В марте 1984 года ЮАР и Мозамбик подписали соглашение, согласно которому повстанческое Мозамбикское национальное сопротивление (РЕНАМО) будет ассимилировано, а ЮАР прекратит оказывать ему помощь, но на практике это соглашение распалось. Как подтвердил госсекретарь Шульц, Уильям Кейси в эти годы проводил противоположную политику, поощряя Южную Африку продолжать оказывать тайную помощь РЕН АМО, несмотря на дипломатические соглашения. Иногда в администрации возникали острые споры, особенно в 1985 году, когда Рейган неохотно встретился с Машелом - пока не был очарован его симпатией и не подтвердил политику отхода Мозамбика от Советов, после того как Машел осыпал Рейгана антисоветскими шутками и уничижительными анекдотами о коммунизме. В 1987 году в Соединенных Штатах вновь усилилось давление со стороны кломатических правых сил, требующих применения доктрины Рейгана в Мозамбике, но администрация продолжала давать им отпор.

Эфиопия казалась бы подходящей целью для доктрины Рейгана, с советским оружием, военными советниками и кубинскими войсками (до 17 000 на пике, в 1978 году). Тем не менее, администрация не решилась ввязаться в это дело. В отсутствие американской поддержки повстанцев кубинцы в одностороннем порядке вывели три четверти своих войск в 1984-85 годах, оставив только одну бригаду численностью 2500 человек и около 500 солдат. (Кроме того, там находилось около 1500 советских военных советников, несколько сотен восточногерманских сотрудников службы безопасности и несколько сотен израильских военизированных сотрудников). Это заметно контрастировало со значительным увеличением численности кубинских войск в Анголе в 198-88 гг. в соответствии с американской военной помощью повстанцам УНИТА, показывая, что, по крайней мере, в краткосрочной перспективе американские действия не приведут к сокращению кубинского присутствия.

В некоторых других случаях США либо прекращали военную помощь (как в Сомали в 1987-88 годах, благодаря решению Конгресса), либо вмешивались клановым образом в тайные политические действия (как, по сообщениям, в Маврикии и Маклагаскаре). Но эти события не были прямо связаны с доктриной Рейгана.

В Камбодже (называвшейся в 1980-х годах Кампучией) открытая американская помощь началась в небольших масштабах в 1985 году в качестве конгрессной, а не адрнинистративной.

Хотя помощь направлялась только небольшим некоммунистическим силам сопротивления, те объединились в коалицию с печально известными "красными кхмерами" против поддерживаемого Вьетнамом (и СССР) правительства в Пномпене.