Тайфун, который стал считаться в Японии божественным, конечно, сыграл свою роль. Но были и другие причины провала кампании по завоеванию Японских островов. Возможно, все сложилось бы иначе, если бы не запоздалое прибытие главных сил монголов к Кюсю, именно ко времени свирепствования здесь штормов. Задержка, в свою очередь, была обусловлена большими трудностями, связанными со снаряжением и обеспечением огромной по численности военной экспедиции, неудовлетворительной организацией. Монгольская армия была вооружена намного лучше японской, в частности метательной артиллерией, которая посылала в противника зажженные снаряды, уничтожившие немалую часть береговых укреплений японцев. Монголы, владевшие более совершенной тактикой, могли бы победить самураев. Однако армию завоевателей составляли воины из покоренных монголами государств Восточной Азии, что затрудняло управление войсками. Воины-сателлиты воевали без особого рвения, характерного для монголов. Это была не их война. Монголы не были моряками и вынуждены были при операциях на море полагаться во всем на китайских, корейских и маньчжурских мореходов и их командиров. Кроме того, самоуверенные руководители похода недооценили мужество японцев, их готовность к самопожертвованию, единство и сплоченность перед лицом внешней опасности.

В ходе боев на море громоздкие и неповоротливые корабли флота Хубилая оказались неспособны противостоять небольшим, но маневренным и быстрым боевым судам японцев. Монголы соединили свои корабли железными цепями, чтобы создать из них плавучие крепости, что сыграло роковую роль во время урагана — корабли ударялись друг о друга, разбивались и шли ко дну.

И вторая неудача покорения Японии не обескуражила Хубилая. Людей, в подвластных монголам Китае и Корее, было много. Их жизни для верховного правителя Монголии и китайского императора ценности не представляли, впрочем, как и жизни монголов. Поэтому Хубилай не отказался от своих планов относительно Японии и начал готовить третий завоевательный поход.

Новое вторжение было запланировано на 1286 год. Ряд обстоятельств воспрепятствовал этой экспедиции. У монголов были проблемы и с другими территориями, завоеванными и еще не завоеванными. Неприятности были и у самого Хубилая. В год гибели монгольского флота у берегов Японии умерла любимая жена хана, а в год, на который была назначена третья экспедиция в Японию — любимый сын, наследник престола. Здоровье Хубилая начало ухудшаться, и в 1294 году Хубилай умер, так и не победив Японии и не реализовав свою мечту об империи, простирающейся и за морем.

Со смертью Хубилая закончилась эпоха великих монгольских ханов. Все последующие правители Монголии и Китая были менее значительными и масштабными фигурами и таких титулов уже не имели. В 1368 году монгольские феодалы вместе с последним императором империи Юань — Тогон Тэмуром были изгнаны из Китая, их власть была сброшена народными восстаниями. Юаньская династия монголов не просуществовала и столетия. Во второй половине XIV века монгольское господство пало в Иране, Закавказье, затем в Средней Азии и на Руси. Роскошь и развращенность монгольской верхушки, сытая жизнь большинства среднего и низшего звена монгольской армии снижали ее боевую способность. Монголы уже не могли сражаться так, как раньше. В конце XVI века они сами пострадали от маньчжурской экспансии. Окончательно закатилась звезда некогда могущественнейшей империи в 1758 году, когда войска маньчжурских феодалов уничтожили монгольское ойратское государство, истребив более полумиллиона монголов. Монгольскую феодальную империю постигла та же участь, что и все империи мира.

После неудавшегося вторжения монгольский флот ушел от берегов Японии. Однако бдительности японцы не теряли. Западное побережье Кюсю оставалось в постоянной военной готовности практически до конца XIII столетия. Оборонительные сооружения содержались в полном порядке, войска были готовы к боевым действиям. Для улучшения контроля над военным положением на острове Кюсю и юго-западе Хонсю сёгунат назначил специальных полномочных представителей — тиндзэй тандай. Наиболее важные посты, координирующие усилия по безопасности и обороне, регенты Ходзё сконцентрировали в своих руках. Чиновники сёгуната должны были решать всевозможные вопросы, которые возникали между сёгунскими вассалами на Кюсю, выступать в качестве руководителей войсками в случае вторжения.

Удачная оборона Кюсю и отражение внешней опасности на некоторое время повысили престиж регентов Ходзё, особенно Ходзё Токимунэ. Его превозносили при жизни, он занял очень высокое место среди всех исторических личностей Японии всех времен. В 37-м году эпохи Мэйдзи (1904 год), длившейся с 1867 по 1912 годы, в словаре выдающихся людей японского государства Токимунэ посмертно удостоился первого места. После отражения монгольского нашествия Токимунэ прожил недолго. В возрасте 34 лет он скончался в уединенном жилище монаха в буддийском храме Энгакудзи, который был построен по его повелению в 1282 году.

Благодаря событиям 1274 и 1281 годов Япония сохранила свои культурные ценности и традиционный образ жизни, десятки и сотни тысяч человеческих жизней. Однако война с монголами потребовала огромного напряжения сил и обернулась для страны страшным экономическим истощением. Вассалы вынуждены были нести службу за свой счет. Подавляющее большинство воинов не получили ни земли, ни других вознаграждений за все свои усилия и пролитую кровь, хотя они и требовали наград. Но взять новые земли и владения для отличившихся самураев было негде. Японское духовенство после гибели флота вторжения приписало заслугу монгольской катастрофы себе. Синтоистские и буддийские священники тоже просили наград за вызов божественного ветра. Позиции Синто после провала вторжения монголов усилились настолько, что эта древняя религия оказалась с буддизмом почти в равном положении.

Монгольское нашествие, заставившее мобилизовать все внутренние силы страны, ухудшило материальное положение и крестьянства, которое должно было вносить большую часть производимого продукта на нужды войны, и создало предпосылки для кризиса мелкопоместного хозяйства. В это время появилась тенденция к распаду системы сёэн (средних и мелких феодальных хозяйств) и образованию новых крупных земельных поместий, в которых искали покровительства многочисленные самураи, окончательно оторванные от сельского хозяйства. Доверие к сёгунату среди военного сословия начало постепенно падать, а внутренние противоречия усиливаться. В конечном итоге монгольское вторжение оказало довольно существенную роль в падении камакурского сёгуната в первой половине XIV века.

В настоящее время невозможно определенно говорить о том, одержали бы победу монголы при других обстоятельствах и при иной организации похода. Но именно с этого времени, с конца XIII века, в сознании японцев укрепилась мысль о том, что их страна находится под особой защитой японских богов, и победить ее не сможет никто. Очевидно, такая особенность этнопсихологии закономерна и характерна для всех народов. Любой успех, удача позволяют представителям народа ставить свой народ в ранг исключительного, опекаемого высшими, небесными, сверхъестественными силами. Как показывает история, избранными себя считали и завоеватели, и жертвы агрессии. Всех поддерживало небо и свои боги. И монголы, и японцы полагали, что занимают особое место под солнцем. Правители «исключительных» народов черпали из этого выгоду, объявляя себя наместниками богов на земле. Так правящей верхушке было легче управлять подданными.