К сожалению, подобные разовые акции слабо помогали денежным делам клуба. В следующем, 1906-м году финансовое положение оставалось весьма плачевным: к июню клубу едва удавалось свести концы с концами. Еще хуже дела обстояли в августе и в конце года. Тем не менее спортивная деятельность клуба продолжалась. В феврале коломяжцы сыграли в Павловском манеже с кружком футболистов «Стелла», проиграв со счетом 6:2, в мае обыграли «Александрию» (2:1), а в июне провели два знаменитых победных матча: с «Удельной» (19:0) и «Лахтой» (3:1).

Однако же в начале 1907 года «Коломяжский спорт-клуб» находился в упадке: не было ни серьезной организации, ни разумного управления. 25 июля 1907 года клуб получил приглашение стать членом С.-Петербургской пригородной лиги, но не смог этого сделать из-за отсутствия сыгранной боевой команды. Игра в футбол в Коломягах почти совсем прекратилась, спортивная деятельность заглохла. Капитаном клуба сначала был В.Н. Манжо, а затем пост переходил из рук в руки.

Как считает Ю. Лукосяк, начало нового периода спортивной жизни в Коломягах следует отнести к середине лета 1907 года: 25 июля представители коломяжской молодежи и любители спорта устроили собрание под предводительством Константина Карловича Веше, который напомнил о славном спортивном прошлом Коломяг, констатировал современное состояние упадка и призывал всех сочувствующих объединиться, воодушевившись общим желанием вернуть утраченное, возродить общество, усовершенствовать и расширить его деятельность. Собравшиеся откликнулись на призыв К.К. Веше и поручили ем, как инициатору всего дела, разработать устав нового зарождающегося общества. Он выполнил эту работу совместно с М.А. Россетом, и в феврале 1908 года проект устава разослали всем заинтересованным лицам, чтобы те внесли свои замечания и дополнения. Составление устава и его обсуждение очень затянулись, так что даже к летнему сезону 1908 года его еще не успели утвердить, но это обстоятельство не помешало проводить футбольные матчи на поле клуба.

В начале лета 1908 года состоялось общее собрание членов будущего клуба. На нем удалось избрать правление, во главе которого встал Владимир Львович Гомилиус — личность яркая и незаурядная. Потомственный почетный гражданин, главный бухгалтер фирмы «К. Шпан и сыновья», он специализировался на продаже различных машин, станков, двигателей, металла и др. В дальнейшем В.Л. Гомилиусу удавалось очень удачно решать самые важные вопросы жизнедеятельности клуба — финансовые и связанные с арендой футбольного поля. Он избирался также на различные руководящие посты в комитете С.-Петербургской футбол-лиги и руководил коломяжским клубом вплоть до 1923 года.

11 июля на втором общем собрании клуба деятельность комитета признали неудовлетворительной, поэтому его переизбрали. Председателем снова стал В.Л. Гомилиус, его заместителем — Г.Г. Эммерих, капитаном — В.А. Синдеев. По примеру прошлых лет утвердили «комиссию спорта», председателем которой выбрали капитана команды В.А. Синдеева. Присутствовавший на собрании представитель кружка футболистов «Рекорд» В.Н. Крутов предложил организациям объединиться, коломяжцы поддержали эту идею, и «Рекорд», состоявший из 22 футболистов, вступил в состав клуба. То же общее собрание приняло «историческое» решение, подтвердив основные цвета клуба — белый с синим.

В 1908 году матчи проводились все лето, причем играли несколько команд клуба. Соперниками коломяжцев были клубы «Астра», «Диана», «Надежда», «Нива», «Озерки», «Парголово», «Спорт», «Лахта», «Удельная», «Александрия», «Триумф», «Урания» и «Шувалово». Ни одного поражения за все лето не потерпела вторая команда клуба коломяжцев, игравшая против «Шувалово», «Озерков», «Надежды» и «Парголово». Третья команда сыграла только один матч — против «Астры».

«Все летние игры этого сезона велись на том же месте, где и в предыдущие годы, — пишет Ю. Лукосяк. — Никакого права занимать это поле под игру футболисты не имели и пользовались им лишь по праву давности. Все как-то уже привыкли считать этот бугор у леса резиденцией футболистов. Неприятными для играющих спортсменов были лишь помехи, причиняемые гуляющей публикой, да сюрпризы от коломяжских крестьян в виде привязанной на самой середине поля лошади или коровы. Лишь в конце лета 1908 года В.Л. Гомилиус получил от владельца земли, графа H.H. Граббе, бумагу, в которой он заявлял, что ничего не имеет против игры футболистов на этом участке и разрешает пользоваться им и на будущее время, впредь до его новых распоряжений».

Чуть позже, летом 1909 года, В.Л. Гомилиус сумел заключить на четыре года льготный арендный договор на землю с управляющим H.H. Граббе. Кстати, впоследствии сам граф числился членом ревизионной комиссии футбол-клуба «Коломяги». В 1912 году арендный договор с H.H. Граббе возобновили сроком на десять лет, но уже за повышенную плату. Согласно новому договору, за первые шесть лет клуб платил по 400 рублей, а за остальные — по 600 рублей.

Осенью 1908 года в клубе произошло важное событие: 23 сентября наконец удалось утвердить устав. А 4 декабря состоялось общее собрание, на котором присутствовали и пользовались правом голоса лишь те, кто внес членский взнос. Как считает Ю. Лукосяк, именно это мероприятие следует считать первым общим собранием клуба, а его участников — отцами-основателями футбол-клуба «Коломяги» (тогда он официально именовался «фут-болл клуб „Коломяги“»). Их было семнадцать человек: Константин Карлович Веше, Андрей Фомич Вильямс, Владимир Иванович Войцеховский, Владимир Львович Гомилиус, Николай Васильевич Елизаров, Петр Васильевич Елизаров, Василий Иванович Кораблев, Леонид Николаевич Котков, Николай Константинович Кривоногов, Иван Николаевич Крутов, Николай Иванович Крутов, Николай Эдуардович Ланге, Петр Вильямович Ларзен, Михаил Адольфович Россет, Владимир Анатольевич Синдеев, Гуго Иванович Фальк, Георгий Георгиевич Эммерих.

Председателем комитета снова единогласно избрали В.Л. Гомилиуса, его заместителем — К.К. Веше, а капитаном — В.А. Синдеева. Этот триумвират долгое время находился во главе клуба (так, В.Л. Гомилиус занимал должность председателя почти без перерывов до 1918 года) и немало сделал для его процветания. Забегая вперед, отметим: в 1910 году В.Л. Гомилиус стал почетным членом клуба — за исключительную деятельность на пользу клуба, выразившуюся в устройстве балов, а Н.И. Крутов — почетным членом клуба за материальную поддержку ссудой. А еще через год, 23 сентября 1911 года, празднуя третью годовщину со дня утверждения устава клуба, его члены, подчеркивая свое уважение к деятельности В.Л. Гомилиуса, постановили открыть между собой подписку и учредить кубок его имени.

На собрании членов клуба 4 декабря 1908 года было принято решение о вступлении в С.-Петербургскую футбол-лигу. 30 июня следующего года, клуб стал наконец-то полноправным членом лиги, а уже осенью состоялся дебют в чемпионате города в классе Б. Представители «Коломяг» в 1909 году впервые оказались в составе комитета С.-Петербургской футбол-лиги: В.Л. Гомилиус был избран «вторым товарищем председателя» (со 2 сентября по 5 ноября), а В.А. Синдеев — секретарем (с 12 ноября). 1 июля 1910 года В.Л. Гомилиуса избрали председателем комитета С.-Петербургской футбол-лиги.

С тех пор «Коломяги» стали набирать очки, сделавшись одним из лучших петербургских футбольных клубов. Он участвовал в матчах с городскими и пригородными клубами. В 1909 году, на IX чемпионате Петербурга, он поделил первое место с клубом из Павловска и клубом «Удельная». По окончании сезона капитан клуба В.А. Синдеев, обращаясь к игрокам обеих коломяжских команд, поблагодарил их за то, что за весь сезон ни один игрок не позволил себе по какой-либо причине пропустить игру или даже на минуту опоздать к назначенному времени начала состязания. «Благодарю господ игроков за такую аккуратность, — подчеркнул В.А. Синдеев, — ценю ее особенно высоко за то, что, по моему мнению, она является следствием сознания каждого игрока, что он есть часть известного целого, единство которого он обязан поддерживать, и следствием всеобщего желания, чтобы футбол-клуб „Коломяги“ никто не мог упрекнуть в непорядке или в плохой организации боевых команд».