Некоторая военная активность в течение апреля— мая наблюдалась на северном направлении (восточные отроги Муровдагского хребта, район Полистан), где карабахско-армянское командование стремилось восстановить ранее утраченные позиции, предприняв несколько атак и неудачную попытку высадки тактического вертолетного десанта.

Относительная оперативная пауза в боевых действиях, установившаяся с середины апреля и вызванная активизацией международных усилий по урегулированию конфликта, завершилась 12 июня переходом карабахских частей в массированное наступление на центральном участке фронта.

Эти боевые действия развернулись на фоне очередного резкого обострения внутриполитического противостояния в Азербайджане, вызванного мятежом командования и личного состава 709-й мотопехотной бригады, дислоцированной в городе Гянджа, которым руководил полковник Сурет Гусейнов[70]. Руководством республики в этих условиях был отдан приказ на проведение операции по разоружению бригады силами президентской гвардии и внутренних войск. 4–5 июня произошли вооруженные столкновения, в ходе которых с обеих сторон было убито более 60 военнослужащих. Используя переданную технику и вооружение выведенной неделей ранее российской 104-й гвардейской воздушно-десантной дивизии (105 боевых машин десанта, БТР, 42 артиллерийско-минометные системы), руководство военной оппозиции взяло под контроль город Гянджу, аэропорт и прилегающие районы, разоружило и расформировало подразделения внутренних войск, лояльных НФА.

В течение последующих нескольких суток оппозиционные силы, поддержанные перешедшей на ее сторону 707-й бригады 1-го армейского корпуса и других частей армии Азербайджана, совершили интенсивный марш-бросок в восточном направлении вдоль шоссе Тбилиси — Баку. К исходу дня 10 июня они вышли на дальние подступы к столице, установив контроль над северо-западным и центральным районами Азербайджана. Передвижение сил оппозиции происходило беспрепятственно, при негласном нейтралитете высшего военного командования и частей регулярной армии. В результате было обеспечено начало процесса отстранения от власти НФА.

Тем временем с утра 12 июня карабахские части предприняли массированное наступление в направлении райцентров Агдам и Мардакерт. В этой операции задействовалось более 6 тысяч военнослужащих, до 75 единиц бронетехники, поддержанных огнем гаубичной и реактивной артиллерии, ударами эскадрильи вертолетов Ми-24. В качестве ближайшей задачи ставилось расчленение боевых порядков азербайджанских частей с последующим окружением Агдама, уничтожением сосредоточенной в нем группировки сил, штабов, склада боеприпасов, базы ремонта бронетехники и военного госпиталя. При этом учитывалось сложное положение обороняющейся стороны, отрезанной от основных сил частями оппозиции, продвигавшихся из Кировобада в направлении Баку.

В первые трое суток карабахцам удалось выйти на рубеж 5 километров севернее и 10–15 километров южнее Агдама, таким образом охватив город с двух сторон. Хотя азербайджанские части пытались оказать сопротивление, однако удержать основные позиции снова не удалось. При этом в бой были брошены все наличные самолеты и вертолеты ВВС Азербайджана, которые нанесли удары по армянским позициям. Только 18 июня после подхода подкреплений азербайджанские войска предприняли контратаку, отбросив противника на исходные позиции практически по «сему периметру Агдама.

Не добившись успеха в районе Агдама, армянское командование перенесло усилия на Мардакертское направление. Перегруппировав на данный участок мобильные танковые части из-под Агдама, карабахцы начали атаку на прикрытые минными полями азербайджанские позиции вокруг райцентра. После затяжных боев, сопровождавшихся значительными потерями, карабахские части 26 июня заняли Мардакерт.

К началу июля армянское командование сосредоточило на Агдамском направлении основные силы 2-го армейского корпуса ВС Армении: четыре пехотных полка (до 6 тысяч военнослужащих), два танковых батальона (60 танков), пять артиллерийских дивизионов (120 стволов артсистем), часть 1-го десантно-штурмового полка, вертолетную эскадрилью. Задействовав имеющиеся силы, армянские войска предприняли в общей сложности шесть массированных атак с целью захвата Агдама. При этом они неоднократно входили в пределы городской черты, но были выбиты после уличных боев. Несмотря на упорную оборону, гарнизон города был поставлен в сложное положение из-за затяжного внутриполитического кризиса, развернувшегося в Баку. Личный состав был измотан многодневными боями и испытывал отсутствие подкреплений, нехватку боеприпасов. В результате в ночь с 23 на 24 июля, после 42 суток непрерывных боевых действий, части агдамской бригады оставили город и отошли в северном и восточном направлениях (причем очень часто отход представлял стихийное, неконтролированное бегство).

Процессы, развернувшиеся в Азербайджане, крайне негативно отразились на его обороноспособности. Начатая в апреле мобилизация была сорвана, произошли очередные перемещения высшего командного состава МО и ГШ. В этих условиях активизировался саботаж, частыми стали уклонения от призыва в армию. Ошибкой стало расформирование корпусного звена управления, в результате чего было нарушено руководство частями действующей армии. Отрицательным фактором при обороне Агдама и других населенных пунктов явилось вмешательство в оперативное планирование руководства «военной оппозиции», добившейся ряда ключевых государственных постов, в первую очередь со стороны премьер-министра Сурета Гусейнова. Политический кризис негативно повлиял на морально-психологическое состояние личного состава. Военное командование было вынуждено расформировать непосредственно в зоне боевых действий в общей сложности тридцать три батальона, контролировавшиеся НФА.

Одновременно в июле — августе обострилась проблема самопровозглашенной Талышско-Муганской республики.

Дело в том, что в южной части Азербайджана проживают представители народности талыши. Это потомки иранских племен индоевропейской семьи атропатенцев, которые говорят на талышском языке. О влиянии этой народности в истории Азербайджана стоит сказать, что, собственно, само слово «азербайджанец» изначально относилось к населению страны, говорящему на талышском языке, и только в XX веке стало обозначать население, говорящее на тюркском языке, которое до этого называло себя «турки», а в Российской империи было известно как «адербейджанские татары».