Каждому кокутаю был присвоен идентификационный номер или собственное имя. Например, к середине 1944 года было 85-90 кокутасв. Из них 65 имело номера, а остальные носили имена баз, где проходили формирование. Около 40- 45 кокутаев было развернуто в воздушные флотилии, а остальные кокутай базировались на авианосцах или других надводных кораблях.

Номера воздушных групп несли в себе информацию о типе самолетов группы и месте ее формирования. О типе самолетов, которыми оснащалась группа, говорила первая цифра номера:

* 1 – разведывательные самолеты;

* 2 – истребители типа «Ко» – «Зеро», предназначенные для достижения господства в воздухе;

* 3 – истребители перехватчики «Оцу»;

* 4 – ночные истребители «Хей»;

* 5 – штурмовики;

* 6 – смешанные группы, как правило, базирующиеся на авианосцах, включали в свой состав истребители, пикирующие бомбардировщики, торпедоносцы и разведчики;

* 7 – средние бомбардировщики наземного базирования;

* 8 – летающие лодки:

* 9 – разведывательные гидропланы и бомбардировщики, приданые надводным кораблям и плавучим базам для противолодочной борьбы и патрулирования;

* 10 – транспортные самолеты.

О месте формирования части говорила вторая цифра номера.

Кокутай подразделялись на две части – хикотая. Хикотай примерно соответствовал эскадрильи. Существовало несколько видов хикотасв:

* истребительный (Сентоки Хикотай);

* штурмовой (Когски Хикотай);

* разведывательный (Тейсацу Хикотай);

* транспортно-десантный (Унсо Хикотай).

Штаты хикотаев разного типа отличались друг от друга:

* Истребители «Ко» – 36 самолетов первой линии, 12 самолетов резерва 36 пилотов и’ 144 человека обслуживающего персонала;

* Истребители «Оцу» – то же;

* Истребители «Хей» – 18 самолетов первой линии. 6 самолетов резерва. 46 летчиков и 114 человека обслуживающего персонала;

* Палубные пикирующие бомбардировщики – 36 самолетов первой линии, 12 самолетов резерва, 90 летчиков. 134 человека обслуживающего персонала;

* Палубные бомбардировщики – 36 самолетов первой линии, 12 самолетов резерва, 144 летчика, 116 человек обслуживающего персонала:

* Бомбардировщики наземного базирования (трехместные) – 36 самолетов первой линии, 12 самолетов резерва. 144 летчика, 204 человека обслуживающего персонала;

* Бомбардировщики наземного базирования – 36 самолетов первой линии, 12 самолетов резерва, 252 летчика, 252 человека обслуживающего персонала;

* Палубные разведывательные самолеты – 18 самолетов первой линии. 6 самолетов резерва, 96 летчиков. 114 человек обслуживающего персонала:

* Разведывательные самолеты наземного базирования – 18 самолетов первой линии. 6 самолетов резерва, 132 летчика, 304 человека обслуживающего персонала;

* Разведывательные гидросамолеты – 18 самолетов первой линии, 6 самолетов резерва, 72 летчика, 59 человек обслуживающего персонала;

* Летающие лодки – 12 самолетов первой линии, 4 самолета резерва. 72 летчика, 72 человека обслуживающего персонала.

Данные по наземным службам не охватывают всей инфраструктуры, действовавшей на уровне кокутая – штабов, снабжения, медицинской помощи, управления. Например, на сентоки хикотай, оснащенный истребителями «Ко» и «Оцу», приходилось 470 человек наземного личного состава.

В состав хикотая входили два хикобунтая (иногда называемых дайтай), каждый хикобутай подразделялся на два чутая. Чутай состоял из двух-трех звеньев. До 1944 года звено насчитывало три машины и было наименьшим авиационным подразделением японской морской авиации. В 1944 году число самолетов в звене увеличилось до четырех и звено стало состоять из двух пар.

Воздушная флотилия (коку сентай) – часть высшего уровня состояла из трехчетырех кокутаев. но были сентаи, состоявшие из шести-десяти кокутаев – все зависело от задач, поставленных перед данной флотилией. В состав флотилии также входило небольшое авиационное подразделение. подчинявшееся непосредственно командованию сентая. Кроме того, в сентае имелась развитая административная инфраструктура и штаб, в ведение которого входили вопросы общей организации флотилии, координация действий подразделений сентая. обслуживание баз, доставка топлива, боеприпасов. оборудования, пищи и обмундирования, замена потерянных самолетов, замена выбывшего летного и наземного состава, проведение учений в рамках флотилии, организация транспортировки личного состава и оборудования. Периодически в ведение командования сентая поступали разведывательные и транспортные самолеты, моряки-торпедисты, обслуживающие самолеты-торпедоносцы, строительные батальоны, транспортные суда и т.д.

Еще более высокий организационный уровень был представлен воздушными флотами. Обычно в состав воздушного флота входило две воздушные флотилии, в конце войны некоторые воздушные флоты могли состоять из трех-четырех флотилий.

На протяжении всей войны Япония располагала семью воздушными фтотами:

* 11-й коку кантай – сформирован в конце 1941 года;

* 12-й коку кантай – сформирован в начале 1943 года;

* 13-й коку кантай – сформирован в сентябре 1943 года;

* 14-й коку кантай – сформирован в конце 1943 года;

* 1-й коку кантай – сформирован в конце 1943 года;

* 2-й коку кантай – сформирован в июле 1944 года;

* 3-й коку кантай – сформирован в июле 1944 года.

Первые четыре из перечисленных флотов действовали нал районами Тихого океана, контролируемыми японцами. 1-й воздушный флот был сформирован в конце 1943 года для прикрытия остальных Мобильных Сил ВМФ и подчинялся непосредственно главнокомандующему Объединенного Флота. В состав 1-го Воздушного флота входили две большие флотилии – 61-я и 62-я.

Остальные воздушные флоты подчинялись командующим флотов отдельных отдельных ТВД:

* Юго-Восточный флот – контролировал Новую Гвинею, Новую Британию. Новую Ирландию. Соломоновы острова (8-й и 9-й Флота, 11-й Воздушный флот, наземные силы);

* Северо-Западный флот – контролировал Северную Японию и Курилы (5-й Флот, 12-й Воздушный флот, наземные силы);

* Юго-Западный флот – контролировал Бирму. Малайю, Французский Индокитай, Голландскую Ист-Индию и Филиппины (Флот крейсеров, эсминцев и подводных лодок. 13-й Воздушный флот, наземные силы);

* Центрально-Тихоокеанский флот – контролировал Маршалловы острова. Каролинские острова, Марианские острова (легкие корабли, наземные силы и 14-й Воздушный флот).

Кроме того в состав Императорского военно-морского флота входило несколько авиационных частей, предназначенных для авианосцев. Для таких отрядов зарезервировали номера с 1 по 10, однако, на практике, число их никогда не превышало пяти. В свою очередь из авианосцев формировали дивизионы, в каждом дивизионе было по две авиационные части. Авианосцы не только служили базами для самолетов, но и подчинялись авиационному командованию. Часто используемый штамп «авианосцы адмирала Нагумо» означает «палубная авиация адмирала Нагумо», поскольку Нагумо фактически командовал 11-м Воздушным флотом (Коку Кантай), а не самими авианосцами, которые подчинялись другим командирам. Когда авиационная часть базировалась на определенном дивизионе авианосцев (а сами по себе дивизионы авианосцев не были самостоятельной тактической единицей), это означало, что авианосцы поступали в распоряжение военных летчиков.