Поскольку Каунас был в области, подведомственной другой армии вермахта, чем Вильнюс, то здесь полицейские части формировались по-другому. Военный комендант Каунаса и Каунасского уезда полковник Ю. Бобелис распустил все вооруженные отряды и 28 июня 1941 г. начал организовывать первый батальон литовской полиции, который сначала (до 7 августа 1941 г.) назывался 1-м батальоном охраны национального труда. В дальнейшем названия и нумерация этого батальона несколько раз менялись: с 7 августа 1941 г. он назывался Батальон службы вспомогательной полиции, позже — 1-й батальон службы вспомогательной полиции, а с 20 декабря 1941 г. — 13-й охранный батальон.

Командир 2-го (12-го) литовского полицейского батальона майор А. Импулявичюс (A. Impulevičius)

По состоянию на 4 июля 1941 г. в батальоне TDА служили 724 унтер-офицера и нижних чина. Основная функция батальона — охранять объекты военного значения, патрулировать улицы города, охранять лагерь советских военнопленных (Stalag 336). Батальон размещался на Зелёной Горе, на улице Аукштайчю, а штаб — на аллее Свободы, 20. Батальон, комплектуемый добровольцами, вскоре сплотил в своих рядах 1600 мужчин. Командиром батальона стал бывший полковник армии Литвы А. Буткунас, его заместителем — майор Антанас Импулявичюс (Antanas Impulevičius). 24 июля должность военного коменданта Каунаса занял капитан Стасис Квецинскас — (Stasys Kviecinskas), его заместителем стал полковник Миколас Кальмантас (Mykolas Kalmantas), а командиром 1-го батальона TDА был назначен майор Казис Шимкус (Kazys Šimkus). В то время почти все бойцы батальона не имели униформы и, чтобы можно было их отличить от других граждан и других работников полиции, им было велено на левом рукаве носить жёлтую повязку с надписью «Служба вспомогательной полиции Л.Н.П.» — «L.N.P. Pagalbinė policijos tarnyba» (Polizeihilfsdienst). Если носили литовскую форменную фуражку или пилотку, её украшали эмблемой из белого метала с изображением буквы «D» (дружинник — draugovininkas). В июле батальон TDA нёс службу при VII форте, где охранял арестованных, при Кабинете министров (аллея Свободы, 70), при военной комендатуре Каунаса (ул. Гедимино, 34), при тюрьме (ул. Мицкявичяус, 9), при здании полиции безопасности (аллея Свободы, 6), при складах жидкого топлива (ул. Наполеона, 5). Кроме того, он охранял склады взрывчатых материалов и изоляционной фабрики, водопроводную станцию, электростанцию, Каунасскую радиостанцию и больных военнопленных в военном госпитале, патрулировал мосты Высшей Панемуне, Витаутаса Великого и охранял в VI форте лагерь для советских военнопленных Dulag 100 и т.д. Со временем, по инициативе немецкой полиции безопасности и СД, 3-я рота и частично 1-я рота батальона были втянуты в массовые убийства не только литовских евреев, но и евреев из Австрии, Белоруссии, Чехословакии, Германии.

24 июля 1941 г. военный комендант Каунаса полковник Ю. Бобелис через директора Департамента полиции обратился ко всем командирам партизанских отрядов г. Каунаса и уезда, напоминая им, что согласно приказу военного командования Германии, деятельность всех партизан как самостоятельных единиц должна быть прекращена, поэтому имеющееся оружие они обязаны сдать местным полицейским участкам или в комендатуру.

30 июля приказом главнокомандующего силами вермахта в рейхскомиссариате «Остланд» генерала от кавалерии В. Бремера командовать всеми литовскими вооружёнными подразделениями был назначен командир немецкого 11-го резервного полицейского батальона майор полиции Франц Лехтхалер (Franz Lechihaier). Из семи рот 1-го литовского батальона 7 августа в Каунасе были созданы два батальона, названные батальонами, службы вспомогательной полиции (Hilfsschutzmannschaft). Командиром 1-го батальона остался К. Шимкус, командиром 2-го батальона 7 августа был назначен А. Импулявичюс, а через неделю сформированного 3-го — капитан Антанас Швилпа (Antanas Švilpa).

В августе было объявлено о наборе добровольцев в формируемые в Каунасе батальоны вспомогательной полиции. Принимались унтер-офицеры, ефрейторы и рядовые запаса, с крепким здоровьем, годные к строевой службе, честные, непьющие и не старше 35 лет. Доброволец был обязан написать заявление, к нему приложить свой паспорт или удостоверение личности и справку о своём лояльном политическом прошлом. Такую справку выдавало местное учреждение полиции. Кроме того, доброволец не должен был быть женатым на русской или польке, и в дальнейшем это ему запрещалось. Это требование касалось всех членов полицейских соединений на территории Генерального округа Литвы. Выполнив все формальности, принятый новобранец приступал к обучению. Принятые добровольцы обязаны были служить не менее 6 месяцев, во время службы они получали оклад, который был почти равен окладу служащего полиции общественного порядка.

Каждый доброволец батальона обязан был подписать следующее обязательство:

«Я, нижеподписавшийся (звание, фамилия, имя), родом из , с 1941 вступаю добровольно во Вспомогательный Батальон Полиции на шесть (6) месяцев и под руководством Вождя Великого Германского рейха Адольфа Гитлера, создавая новую Европу, обязуюсь возлагаемые на меня обязанности выполнять честно, соблюдать военную дисциплину, за служебные преступления и проступки отвечать перед Военными судами, свято хранить тайну и не принадлежать к запрещённым организациям; врагам не предоставлять никаких сведений и всё, что только про них узнаю, немедленно сообщать своему начальству

(Подпись давшего обязательство)

Подпись подтверждаю».

Все находившиеся в Каунасе части 15 августа по приказу майора полиции Ф. Лехтхалера были разделены на пять батальонов. Кроме того, были созданы отдельные роты — строительная, транспортная[85]и техническая. 25 августа командиром 4-го батальона был назначен капитан Викторас Климавичюс (Viktoras Klimavičius), его заместителем — капитан Иозас Бутенас (Juozas Butėnas); командиром формируемого с 28 августа 5-го батальона — капитан Иозас Кришчюнас (Juozas Kriščiūnas)[86], его заместителем и начальником штаба — майор Иозас Юркунас (Juozas Jurkūnas). С 16 сентября роты батальонов частей самообороны были распределены и пронумерованы следующим образом:

1-й батальон — 1-я — 4-я роты;

2-й батальон — 5-я — 8-я роты;

3-й батальон — 9-я — 12-я роты;

4-й батальон — 13-я — 15-я роты.

26 сентября был образован Каунасский Жалякальняйский гарни

зон частей службы вспомогательной полиции (начальник майор К. Шимкус), состоящий из 1-го и 3-го батальонов вспомогательной полиции и автомобильной роты вспомогательной полиции, командиром которой был капитан Дионизас Мейжис (Dionizas Meižys). Приказом Каунасской комендатуры с 8 октября были изменены названия батальонов вспомогательной полиции и отдельных рот — они стали охранными батальонами и ротами. Для проверки общественного порядка и для того, чтобы полицейские придерживались правил вежливости, 13 ноября в Каунасе была создана служба военной полиции. Её сотрудники при исполнении служебных обязанностей должны были на правое плечо пристегнуть белый аксельбант. Им было предоставлено право задерживать и доставлять к командиру соответствующего подразделения непорядочных и нарушающих общественный порядок полицейских.