Первым начальником спецотдела стал известный к тому времени чекист Глеб Бокий, еще до революции ставший членом оккультного масонского Ордена Мартинистов. Вскоре после создания спецотдела он сделал своим ведущим научным консультантом профессора медицины Александра Барченко, который с 1911 года в возрасте 30 лет начал изучать проблемы паранормальных способностей человеческого организма (О. Шишкин. Битва за Гималаи. М., 1999. С. 374; А. И. Первушин. Оккультные войны НКВД и СС. Спецслужбы и Армагеддон. М.: Эксмо, 2002. С. 345–350).

В 1921–1922 годах Барченко организовал ряд экспедиций в Карелию и на Кольский полуостров с целью поиска следов древнейших магических цивилизаций и их главнейшего артефакта, дарующего магическое могущество, который он называл «Камень Ориона» и который в Европе был известен как «Чаша Грааля» или «Святой Грааль».

Эти его экспедиции привлекли внимание чекистов, а через них и Специального отдела. Познакомившись и пообщавшись с Барченко, глава Спецотдела Бокий включил его в штат, а затем сделал и главным научным консультантом.

В 1925 году Барченко создает в Спецотделе масонскую ложу «Единый трудовой союз», в которую сначала вошел Бокий, а затем через него начальник одного из подразделений Спецотдела Е. Е. Гоппиус, заместитель народного комиссара иностранных дел Б. С. Стомоненков и член ЦК ВКП(б) И. М. Москвин (А. И. Первушин. Оккультные войны НКВД и СС. Спецслужбы и Армагеддон. С. 415–429).

Одновременно с работой в Спецотделе Барченко становится ведущим научным сотрудником другой очень засекреченной организации – «Всесоюзного института экспериментальной медицины» (ВИЭМ). В нем он работал в лаборатории нейроэнергетики (О. Шишкин. Битва за Гималаи. С. 375).

Основные идеи Барченко, подтверждение которым он искал в своих многочисленных экспедициях, заключались в том, что, по его мнению, сотни тысяч лет назад на Земле существовали могучие магико-технологические цивилизации, которые обладали способностью воздействовать на различные стороны психики людей и возможностью устанавливать контакты с высшим космическим разумом.

С целью поиска главнейшего артефакта одной из таких цивилизаций – уже упоминавшегося «Камня Ориона» («Чаши Грааля») – Барченко, помимо экспедиций 1921–1922 годов в Карелию и на Кольский полуостров, после своего прихода в Спецотдел в 1926–1927 году организовал археологическую экспедицию по пещерным городам Крыма и окрестностей Севастополя. Штаб этой экспедиции находился в одном из домов на улице Азис в Бахчисарае.

Одновременно с экспедицией Барченко в Крыму в Гималаи на поиски Шамбалы как главного хранилища артефактов древнейших магических цивилизаций Спецотдел отправил экспедицию известного еще с дореволюционных времен известного российского мистика Рериха. Там же, в Британской Индии, занимался этим же делом спецагент ОГПУ Яков Блюмкин.

Неизвестно, нашел ли в ходе крымских экспедиций Барченко «Камень Ориона», но по крайней мере ему удалось на основании полученных находок в ходе раскопок в пещерных городах и поблизости от них сделать эпохальное открытие в области археологии и древней истории. Оно заключалось в том, что он пришел к выводу, что пещерные города в Крыму и в окрестностях Севастополя гораздо древнее, чем считала и до сих пор считает официальная историческая наука. По мнению Барченко, эти пещерные города были созданы не бежавшими в Крым от репрессий императоров-иконоборцев византийских монахов, как до сих пор утверждает официальная археология, а племенами, пришедшими из Северной Африки в эпоху конца мезолита – начала неолита. Это открытие Барченко было подтверждено спустя 30 лет известным крымским археологом Аскольдом Щепинским, открывшим при раскопках кургана Кеми-Оба неолитическую цивилизацию, занимавшую в период 6–4 тысячелетий до нашей эры весь Крым и значительные территории к северу от него, которую Щепинский назвал «Кеми-Обинской культурой».

Масонские тайны и дела Барченко привели его к тому, что в мае 1937-го он был арестован, а 25 апреля 1938-го в возрасте 57 лет расстрелян. Та же судьба постигла и его начальника Бокия.

По нынешним, сугубо официальным данным, все разработки и материалы его экспедиций были уничтожены в ноябре 1941 года, во время эвакуации Центрального архива НКВД из Москвы в связи с угрозой ее захвата в то время немецкими войсками.

Наличие в 20–30 годы в тогдашних органах государственной безопасности СССР большого количества масонов и просто высокопоставленных агентов различных западных разведок привело к тому, что на Западе, и в том числе в Германии, были достаточно хорошо осведомлены об этих экспедициях. Так что когда в 1933 году в Германии пришли к власти нацисты они, решили по примеру Спецотдела ОГПУ-НКВД создать в составе своих спецслужб аналогичную структуру.

В 1935 году по распоряжению рейхсфюрера СС Генриха Гиммлера в составе СС был создано «Немецкое общество по изучению древней германской истории и наследия предков», которое больше стало известно под сокращенным названием «Наследие предков» («Аненербе»).

Первым руководителем этой организации стал немецко-голландский филолог Герман Вирт, который еще в 1928 году частным образом создал предшественника «Аненербе» под названием «Общество Германа Вирта» (Герман Вирт. Хроника Ура Линда. Древнейшая история Европы. М.: Вече, 2007. С. 52).

В 1932 году Вирт при помощи нацистской партии на базе своего общества создал «Исследовательский институт духовных исследований древности». Затем совместно с профессором Вальтером Даре в 1935 году создал «Собрание народных традиций и древней религии».

Эти две структуры и стали основой для последующего создания Гиммлером в том же 1935 году «Аненербе».

В 1936 году Гиммлер назначил директором «Аненербе» одного из своих ближайших соратников штандартенфюрера Вольфрама фон Зиверса. Тот, в свою очередь, в качестве главного научного консультанта взял декана философского факультета Мюнхенского университета Вальтера Вюста. После этого в состав «Аненербе» начался приток представителей различных сфер академической науки.

К началу Второй мировой войны в составе «Аненербе» действовало порядка пятидесяти отделов и других подразделений, которые занимались нетрадиционными исследованиями в различных видах естественных, общественных и технических наук.

Ведущее место в исследовательской деятельности «Аненербе» занимали биологические и медицинские исследования. Проводились массовые медицинские опыты как над заключенными концлагерей и советскими военнопленными, так над и немецкими военнослужащими-добровольцами, чтобы, в частности, узнать различные пределы выносливости и приспосабливаемости человеческого организма в различных условиях, а также для получения новых лекарств и методов лечения. Наиболее одиозную известность в связи с этим приобрел доктор Менгеле из Освенцима. Деятельность «Аненербе» в различных видах медицинских и биологических исследований, сопровождавшихся большим количеством насильственных опытов над людьми, была признана Нюрнбергским международным трибуналом одним из преступлений нацистского режима Германии против человечества.

Также в «Аненербе» было немало различных экзотических отделов, занимавшихся, к примеру, парапсихологией, оккультизмом. Но кроме них различные нетрадиционные методы познания окружающего мира изучали и представители различных академических наук. Так, например, в отделе геологии и минералогии проверялись различные методы и рецепты средневековых алхимиков.