В 1825 г. Шмидт сдал Росс Павлу Ивановичу Шелихову, который в течение последующих пяти лет занимался благоустройством селения, обращая большое внимание на сельское хозяйство, в основном зерновое земледелие. Во времена Шелихова население Росс состояло: около 60 русских, 80 алеутов и 80 местных индейцев. Он достроил и часовню, в которой церковные требы исполнял выборный церковный староста.

16 ноября 1830 г. Шелихов сдал селение П. С. Костромитинову. Из-за истощения сельскохозяйственных угодий Петр Степанович занялся поисками новых пахотных мест. Так, в окрестностях основали несколько русских факторий-ранчо. Селение Костромитиновское на южном берегу реки Славянка было крупнейшим из трёх и включало в себя большой комплекс зданий: хозяйский дом, дом для индейских работников, молотилку, амбар, пекарню, кузницу, бани, загон для скота, табачный склад, винный погреб. Основой хозяйства было выращивание пшеницы. Ранчо его помощника Егора Леонтьевича Черных располагалось в глубине материка, дальше всего от крепости, на ней выращивались овощи, фрукты, пшеница, а также производилось вино. В 1837–1840 гг. Черных вёл первые в Калифорнии систематические наблюдения за погодой. Ранчо Василия Хлебникова находилось в нескольких километрах к востоку от залива Бодега.

Ближайшая к форту удобная гавань находилась в заливе Бодега почти в 30 км к югу, где был построен порт Румянцев. В нём товары перегружались на небольшие суда и транспортировались к крепости. К 1836 г. население возросло до 260 человек — незначительно, большая часть их жила на берегах речки Славянки. Население было многонациональным: здесь жили русские (в разное время от 50 до 100 человек), привезённые из Аляски алеуты (50–125 человек), креолы (до трети всего населения), индейцы соседних племён, якуты, финны, шведы и даже гавайцы. Многие индейцы и алеуты были крещены и хорошо владели русским языком. Русское население было представлено в основном мужчинами, подписавшими с Российско-Американской компанией семилетний контракт. Русских женщин в селении почти не было, поэтому смешанные браки были весьма распространены.

А. Л. Хисамутдинов (автор книги) на кладбище селения Росс. Фото И. Франкьена

Последним правителем крепости, с 1 августа 1838 г., был Александр Гаврилович Ротчев. К этому времени стало понятно, что место для поселения Росс было выбрано неудачно. Открытая ветрам и волнам со стороны океана бухта не давала надежного укрытия судам. Местоположение колонии Росса было больше приспособлено к обороне, чем занятию сельским хозяйством. Узкая полоска земли между океаном и горами не могла дать в достаточном количестве хлеба и овощей, чтобы прокормить русское население Аляски. При этом частые туманы с океана сводили на нет все усилия земледельцев. В скотоводстве достигли большего успеха: в конце 1830-х гг. здесь было 1700 голов крупного рогатого скота, 940 лошадей и мулов и 900 овец. Ежегодно производилось более 800 кг шерсти, которая шла на экспорт. И все же вольный выпас не оправдывал затрат: после шестимесячного сухого сезона пастбища не могли прокормить животных, которые разбредались по отдаленным окрестностям.

Ремесленники колонии изготавливали мебель, двери, рамы, черепицу из секвойи, телеги, колеса, бочки, «коляски о двух колесах», выделывали кожи (70–90 штук ежегодно поставлялось в Новоархангельск), обрабатывали железо и медь. Строились суда, продавая некоторые испанцам, не имевшим до того времени здесь ни одного корабля. Но, несмотря на эти достижения, селение было убыточным. Пшеница не давала хорошего урожая, обмен с хозяевами страны — испанцами не приносил ощутимой прибыли. Сильно сократилась и местная популяция пушных зверей, поэтому живность в округе была быстро выбита и торговля пушниной со временем сошла на нет. Историк Российско-Американской компании Тихменев подвел такой итог: «Как стратегический пункт, по отдаленности своей от колонии, заселение не могло иметь также никакого значения, тем более, что и небольшой залив Бодего не мог соответствовать этой цели. Словом сказать, при таком положении дела заселение представляло собой для колоний только тяжелую обузу».

После соглашения администрации Российско-Американской компании в Новоархангельске (ныне Ситка) и Компании Гудзонова залива в форте Ванкувер надобность в поставках продовольствия из Форт-Росса отпала. В 1839 г. Российско-Американская компания приняла решение оставить Росс и продать его. Международный статус фактории Росс так и не был определён: правительство Мексики, продолжавшее считать землю под Россом своей, не пожелало платить за неё, ожидая, что русские просто забросят колонию. Наконец, 13 декабря 1841 г. был подписан контракт между А. Г. Ротчевым и гражданином Мексики швейцарского происхождения Джоном Саттером о продаже ему всей недвижимости Росс за 30 тыс. пиастров, или 42 857 руб. серебром. В Америке имя Джона Саттера (John Sutter) (Иоганн Август Зуттер) (23 февраля 1803–18 июня 1880), калифорнийского предпринимателя швейцарского происхождения, известно в связи с золотой лихорадкой: в 1848 г. вблизи лесопилки Саттера было обнаружено первое золото. Впоследствии на его земле основали столицу Калифорнии город Сакраменто. Известно также, что он имел тесные связи с русскими, в частности, с последним правителем РАКа Ротчевым, и приезжал в Новоархангельск. В Форт-Россе Саттер никогда не жил, назначая туда наёмных управляющих.

Злоключения крепости на этом не закончились. Мексиканские власти признали сделку недействительной и через четыре года передали Форт-Росс другому владельцу. Их сменилось немало, и каждый приспосабливал бывшую крепость для своих нужд: под лесной склад, богатое ранчо, непритязательный отель или веселый салун-трактир. Последним управляющим был Вильям Бенитц (William Benitz), который стал арендовать Форт у Саттера. Он в несколько раз увеличил старый русский сад, расширил дом Ротчева, где и жил с 1846 г., построил причал. В 1867 г. Бенитц разделил свои владения на две части и продал их разным покупателям. Форт отошел к Джеймсу Диксону (James Dixon), а 1873 г. его выкупил за 35 тыс. долларов Джордж Колл (George W. Call), поселившийся там с семьёй и превративший его в небольшой интенсивно используемый порт. Тогда же бывшая русская колония начала привлекать первых туристов. В 1903 г. Колл продал Форт Калифорнийской лиге исторических объектов (California Historical Landmarks League), которая в 1906 г. перепродала его штату Калифорния. Это случилось за месяц до сильнейшего землетрясения, разрушившего Форт. К 1916 г. он был восстановлен по сохранившимся деталям. Это бедствие не было последним: 5 октября 1970 г. пожар полностью уничтожил часовню. Через несколько месяцев после этого сгорела крыша дома Ротчева.

Ив Франкьен в крепости Росс

Для выходцев из России Форт-Росс был частичкой утерянной родины, и в русских общинах нет-нет да и возникали инициативы по его реконструкции и созданию музея. А. П. Фарафонтов, П. С. Оленич, В. Н. Арефьев, Г. Е. Родионов, Т. Ф. Токарев, входившие в Деловой комитет по созданию музея Форт-Росса, а также семья Лебедевых и отец А. Вячеславов провели первые реставрационные работы в часовне. Ее открыли 4 июля 1925 г., когда было совершено первое богослужение. В дальнейшем этот день отмечался ежегодно: прихожане Свято-Троицкого собора в Сан-Франциско устраивали паломничество в Форт-Росс, где торжественно проводилась литургия.