Первым приобретением о. Антонина на Святой Земле стал достаточно большой участок земли с древним Мамврийским дубом вблизи Хеврона, под сенью которого, согласно Священному Писанию, Авраам встретил Святую Троицу. Приобретение этого места православными увеличило поток паломников и облегчило им путешествие. В 1874 г. трудами о. Антонина был построен двухэтажный дом, который и сегодня стоит между дубом и храмом, возведенным о. Леонидом (Сенцовым) в начале XX века. Несколько десятилетий спустя, уже после строительства здесь храма, участок Русской миссии в Хевроне начал превращаться из паломнического общежития в монашескую общину: Свято-Троицкий скит стал в XX веке одним из двух русских мужских монастырей на Святой Земле.

В наше время в Иерусалиме есть три русских женских монастыря: Горненский, Елеонский и Гефсиманский. Все три участка были приобретены трудами о. Антонина, он же организовал строительство главных храмов и жилых зданий этих монастырей. При его жизни монастырями стали «полтора» из трех. В Горенском размещалась женская монашеская община, а Елеонский монастырь был запланирован о. Антонином как мужской, и у монастыря даже был настоятель, но общины так и не получилось. В начале XX века, уже после смерти Антонина, Елеонский монастырь превратили в женскую обитель. Что же касается Гефсимании, то тут монашеская община появилась лишь в начале 30-х годов XX века.

Архимандрит Антонин прилагал массу усилий для того, чтобы устроить на Святой Земле постоянную русскую церковную жизнь, которая была бы здесь независимо от изменчивых паломнических волн. Его вторым крупным проектом после приобретения на благо русских паломников Мамврийского дуба стала покупка Горней вблизи Иерусалима и устроение в ней женской монашеской общины. Устройство монастыря планировалось необычное. Здесь сыграли роль личные предпочтения о. Антонина: сам он, будучи монахом, никогда не жил в монастыре и скептически относился к общежитийному монашеству, распространенному в России. Вот и Горненский монастырь он задумал не общежитийным, а раздельножительным: каждой сестре полагался отдельный домик и собственное обеспечение. Сестры встречались друг с другом только на службе и иногда на общей трапезе. Общего сестринского корпуса или множества общих послушаний не было. Не предполагалось даже присутствия игуменьи: община находилась в прямом подчинении начальника РДМ, в то время – отца Антонина (Капустина).

Еще до строительства храма о. Антонин открыл здесь школу для православных арабских детей. Это была уже вторая русская школа на Святой Земле. Храм в Горней был освящен лишь 30 марта 1883 года в честь Встречи Марии и Елизаветы. По ходатайству архим. Антонина эта дата была в том же году утверждена русским Синодом как местный монастырский и храмовый праздник. В 1886 году русский Синод присвоил общине статус монастыря (а Иерусалимский патриарх признал этот статус лишь в 1924 году), и Горненский стал, таким образом, трудами о. Антонина первым со времен Средневековья русским монастырем в Иерусалиме.

Одновременно с Горней о. Антонин занимался Елеонским монастырем, который задумывался как мужской, но в конечном итоге тоже стал женским. Если в Горней храм строился в честь Богородицы (которая несколько месяцев прожила в тех местах), то храм на Елеоне задумывался в честь Христа (ведь там Христос был и в момент Вознесения, и неоднократно до того). Однако

Иерусалимский патриарх попросил не освящать новую церковь в честь Вознесения Христова, поскольку место этого события почиталось все-таки в стороне. Храм был освящен в честь Христа Спасителя, но со временем все же стал называться храмом Вознесения Христова.

Не без участия архим. Антонина в 1882 г. в России было основано Православное Палестинское Общество. В 1889 г., когда его возглавил брат царя – Великий Князь Сергей Александрович, – Общество стало называться Императорским. У Общества было три основные задачи:

1. Помощь в организации паломничества на Святую Землю (и не только) и обустройство паломников: гостиницы, странноприимные дома, больницы.

2. Помощь православному населению Святой Земли. Отчасти благотворительная, но в первую очередь просветительская: школы и учительские семинарии.

3. Исследовательская работа, посвященная изучению христианства на Святой Земле. Издательская деятельность.

Таким образом, Общество брало на себя значительную часть хозяйственной и административной работы, освобождая от нее Русскую Духовную Миссию. Очень важной частью работы была деятельность внутри России по популяризации идеи паломничества и русского присутствия на Святой Земле, а также сбору средств. Во многих епархиях Русской Церкви были открыты представительства ИППО. Оно было общественной, а не государственной организацией, но то, что во главе его стоял брат царя, придавало Православному Палестинскому Обществу подлинно общенациональный, всероссийский масштаб.

Одним из первых проектов Православного Палестинского Общества стало строительство храма у подножия Елеонской горы, в Гефсимании. Император Александр III и его братья построили в память о родителях два храма: Спас на Крови в Петербурге в память об Александре II и храм Марии Магдалины в Гефсимании – в Иерусалиме – в память об императрице Марии Александровне. Остюда и посвещение храма Марии Магдалине. Оба царских храма строились в русском стиле. На освящении храма в 1888 году присутствовала Вел. Кн. Елизавета Феодоровна, – жена Вел. Кн. Сергея Александровича. Именно здесь она приняла решение стать православной. В 1921 г. мощи Елизаветы Феодоровны упокоились в храме, на освящении которого она была.

Палестинское Общество занималось обслуживанием уже существовавших подворий для паломников, а также строило новые, из которых самым известным стало Сергиевское подворье в Иерусалиме, а также Александровское – в Старом Городе, знаменитое своими раскопками и храмом Александра Невского. За последние 35 лет XIX века – с 1865 по 1901 год – через русские подворья в Иерусалиме прошло около 86 тысяч паломников. Из них 66 % – женщины. Более 97 % прибыли на Святую Землю на пароходах третьим классом. Это говорит о том, что характер русского паломничества был в то время по-настоящему народным, а служение ИППО и Русской миссии – совершенно «демократичным».

Во времена архим. Антонина деятельность Русской миссии была тесно связана с приемом паломников и делегаций. Но при этом школ для местного населения открылось гораздо больше, чем странноприимных домов. Появилось два монастыря, но возникло и два «пединститута» – учительские семинарии, готовившие педагогов для местных школ. Кроме того, было учреждено три больницы. Вот какой формат миссии определил своим служением о. Антонин.

Помимо этого, в миссии шла постоянная научная деятельность. Наукой отец архимандрит занимался лично, подавая пример другим. Он сам инициировал и проводил археологические раскопки, изучал византийские рукописи и писал научные и публицистические статьи. Коллекция созданного им при Русской миссии археологического музея состояла из его собственных находок, а также из огромного количества приобретаемых им предметов. Один английский археолог того времени писал: «…был на русских постройках у человека, который знает о Святой