13.06.1944 г. Ro-36 (34-й ДПЛ) была потоплена в 75 милях к востоку от о. Сайпан американским ЭМ Мelvin. I-33 (15-й ДПЛ) затонула со всем экипажем (кроме командира и двух верхних вахтенных) в 20 милях к юго-западу от о. Нада (Внутреннее японское море) во время боевой подготовки.

14.06.1944 г. I-52 (11-я эскадра ПЛ) была дозаправлена к югу от Мадагаскара и направилась в Атлантический океан для борьбы с судоходством противника, а Ro-112 (30-й ДПЛ) — в Пенанг. Флоту передали I-364, которая вошла в состав Седьмой Специальной Транспортной эскадры, перешла в Куре и приступила к боевой подготовке. I-53 (15-й ДПЛ), I-5 и I-6 (7-й ДПЛ) вышли из Йокосуки и направились в район в 300 милях к востоку от Марианских о-вов. I-165 (30-й ДПЛ) пришла в Пенанг после патрулирования у побережья Австралии.

15.06.1944 г. I-41 (15-й ДПЛ) вышла с атолла Трук и направилась к Марианским о-вам. Ro-41 (11-я зскадра) пришла в Куре.

16.06.1944 г. Ro-44 (11-я эскадра) была потоплена в 110 милях к востоку от атолла Эниветок американским ЭМ Burden R. Hastings. I-26 (Восьмая эскадра ПЛ) пришла в Йокосуку после крейсерства у о-вов Алеутской гряды. Ro-114 (11-я эскадра ПЛ, лейтенант Ата) в районе в 300 милях к востоку от Марианских о-вов атаковала американское ОС и, по докладу командира, повредила ЛК типа Iowa (фактически, атака оказалась безуспешной).

17.06.1944 г. Ro-117 (11-я эскадра ПЛ) была потоплена в 350 милях к юго-востоку от о. Сайпан самолетом американской базовой авиации. Ro-114 (11-я эскадра) была потоплена в 80 милях к западу от о. Тиниан американскими ЭМ Melvin и Wadleigh. Ro-112 (30-й ДПЛ) пришла в Пенанг. I-177 (12-й ДПЛ) пришла в Куре для текущего ремонта корпуса и механизмов.

18.06.1944 г. Ro-40 (11-я эскадра) вышла с атолла Трук и направилась к о. Сайпан, имея на борту около 60 т продовольствия. Ro-112 (30-й ДПЛ) вышла из Пенанга и направилась к о-вам в центральной части ТО.

19.06.1944 г. I-184 (11-я эскадра ПЛ) была потоплена бомбардировщиками с американского АВ Suwannee в 20 милях к юго-востоку от о. Гуам. Ro-115 (11-я эскадра ПЛ, лейтенант Кореедзи) в районе в 300 милях к востоку от Марианских о-вов безуспешно атаковала американский флотский ТН. I-6 (7–й ДПЛ, капитан-лейтенант Фумон) в районе в 300 милях к востоку от Марианских о-вов безуспешно атаковала американский АВ.

20.06.1944 г. В темное время суток американский адмирал Митчер отдал приказ осветить палубы своих АВ для обеспечения посадки на них самолетов, возвращавшихся после сражения в Филиппинском море. Несмотря на благоприятные условия для атаки, ни одна из японских ПЛ не оказалась в районе сосредоточения кораблей противника. I-41 (15-й ДПЛ) получила приказ следовать к о. Гуам для спасения экипажей сбитых самолетов.

21.06.1944 г. Ro-40 (11-я эскадра) пришла на о. Сайпан, разгрузилась, приняла на борт 56 человек раненых и направилась к атоллу Трук.

22.06.1944 г. I-185 (22-й ДПЛ) была потоплена к востоку от о. Сайпан американскими ЭМ Newcomb и Сhаndlеr. Ro-46 (34-й ДПЛ) пришла в Куре после патрулирования у о-вов Алеутской гряды.

24.06.1944 г. I-52 (11-й ДПЛ)[29] была потоплена в 800 милях к юго-западу от Азорских о-вов бомбардировщиками с американского АВ Bogue. Ro-40 и Ro-113 (11-я эскадра ПЛ) пришли на атолл Трук.

29.06.1944 г. Ro-48 (34-й ДПЛ) вышла из Куре и направилась к о. Сайпан, имея на борту 40 т боеприпасов. I-10 (флаг 8-й эскадры ПЛ) направили к о. Сайпан для эвакуации вице-адмирала Такаги и штаба Шестого флота. I-8 (8-я зскадра ПЛ, капитан 3 ранга Аридзуми) к югу от архипелага Чагос потопила английское торговое судно (6118 т).

2.07.1944 г. I-8 (Восьмая эскадра ПЛ, капитан 3 ранга Аридзуми) к югу от архипелага Чагос потопила американский торговое судно Jean Nicolet (4250 т). 98 членов его экипажа были подняты на борт ПЛ и почти все зверски убиты. Оставшихся в живых привязали к палубному настилу корабля, и он погрузился. Тем не менее двум матросам удалось спастись.

4.07.1944 г. I-10 (флаг Восьмой эскадры ПЛ)[30] была потоплена в 65 милях к востоку от о. Сайпан американскими ЭМ David W. Тауlоr и эскортным миноносцем Riddle.

5.07.1944 г. Ro-115 (11-я эскадра) пришла в Йокосуку. I-38 (15-й ДПЛ) была направлена к о. Сайпан для эвакуации штаба Шестого флота. Флоту была передана I-363, которая вошла в состав Седьмой Специальной Транспортной эскадры и приступила к боевой подготовке.

9.07.1944 г. Ro-48 (34-й ДПЛ) подошла к о. Сайпан, но не смогла разгрузиться, т. к. он уже был оккупирован американцами. По приказу командования ПЛ осталась на подходах к острову. I-41 (15-й ДПЛ) подошла к о. Сайпан, приняла на борт 106 офицеров штаба Шестого флота, армейских частей и направилась в Йокосуку. Ro-109 (51-й ДПЛ) пришла в Куре после патрулирования у Марианских о-вов.

10.07.1944 г. Флоту была передана I-47, которая вошла в состав 15-го ДПЛ и приступила к боевой подготовке.

12.07.1944 г. I-12 (Шестой флот) пришла на атолл Трук после патрулирования у о-вов в центральной части Тихого океана.

14.07.1944 г. Ro-48 (34-й ДПЛ) и I-6 (7-й ДПЛ) были потоплены в 75 милях к западу от о. Сайпан американским эскортным миноносцем William С. Miller. I-29 (Восьмая эскадра ПЛ) пришла в Пенанг из Лориана (Франция).

15.07.1944 г. I-53 (15-й ДПЛ) пришла на атолл Трук. I-166 (30-й ДПЛ) на подходах к Сингапуру в надводном положении была потоплена английской ПЛ Telemachus. Экипаж корабля, за исключением командира и трех верхних вахтенных, погиб.

18.07.1944 г. I-41 (15-й ДПЛ) пришла в Йокосуку.

19.07.1944 г. I-5 (7–й ДПЛ) была потоплена в 360 милях к востоку от о. Гуам американским эскортным миноносцем Wyman. Ro-112 (30-й ДПЛ) пришла в Йокосуку. I-26 (Восьмая эскадра ПЛ) вышла из Йокосуки, имея на верхней палубе танк, 25 т боеприпасов, и направилась к о. Гуам.

20.07.1944 г. I-45 (11-я эскадра ПЛ) и I-55 (15-й ДПЛ) вышли из Йокосуки, имея на верхней палубе танк, 25 т боеприпасов, и направились к о. Гуам. I-38 (15-й ДПЛ) пришла на атолл Трук.

23.07 1944 г. I-56 (15-й ДПЛ) вышла из Куре и направилась к атоллу Улити, имея на борту 15 т продовольствия. После разгрузки ПЛ надлежало оставаться в районе и вести борьбу с судоходством союзников.