Тела стрельцов были выставлены на всеобщее устрашение, и их долго не разрешали похоронить. В Москве на Красной площади, где их казнили, и по всем местам, где зарыли их тела, были установлены позорные столбы с чугунными плитами, на которых был текст приговора. Но на этом расправа не закончилась. Земельные владения стрельцов, участвовавших в бунте, были конфискованы, а следствие над оставшимися в живых велось до 1707 года, когда ему на смену пришло следствие по делу Кондратия Булавина. В 18 веке стрелецкие полки были полностью расформированы, их сменила регулярная армия.

Первым восстанием стрельцов правление Петра началось, вторым – продолжилось, и, хотя Петр правил жестко и твердой рукой, народные возмущения в период его полного самовластия не утихали. Восстания в Башкирии и Астрахани, приписные бунты в Кижах, волнения против рекрутских наборов – всё это черты его времени, когда народ вынужден был отдавать последнее, чтобы Петр мог вести войны и строить новую столицу. Не прекращались недовольства и во время Северной войны. И снова инициатором бунта выступила наиболее активная часть тогдашнего общества – казаки. И снова – на Дону.

В 1707 году Петр издал указ о сыске на Дону беглых и отправил на Дон для ведения сыска воеводу Юрия Долгорукова. Князь должен был донести до казаков простую мысль, что скрывать беглых, как они делали испокон веков, нельзя, а нужно их арестовывать и сдавать присланному из Москвы войску. Указ Долгоруков зачитал в Черкассах атаману Максимову. Против ожидания, указ был встречен казаками с ропотом. Во исполнение указа начались рейды по казачьим станицам, что казакам уж совсем не понравилось. Кроме того, прибыв на Дон, Долгоруков принялся исполнять и другие царские указы, к которым тут относились с небрежением, и начал он со сбривания бород. Все это вкупе – сыск беглых и «личное безобразие» – перевело ропот в полное неприятие.

«Когда полковник князь Долгоруков со своим отрядом и с пятью казаками, данными старшиною, отправился для отыскания беглых, – рассказывает Костомаров, – атаман Кондратий Булавин, из Трехизбянской станицы на Донце, напал на него 9 октября 1707 года на реке Айдаре, в Ульгинском городке, убил его, перебил всех людей и начал возмущать донецкие городки, населенные беглыми. В этих городках встречали его с хлебом и медом. Булавин составил план взбунтовать все украинные городки, произвести мятеж в донском казачестве, потом взять Азов и Таганрог, освободить всех каторжных и ссыльных и, усиливши ими свое казацкое войско, идти на Воронеж, а потом и на самую Москву. Но, прежде чем Булавин успел возмутить городки придонецкого края, донской атаман Лукьян Максимов быстро пошел на Булавина, разбил и прогнал, а взятых в плен его сотоварищей перевешал за ноги. Булавин бежал в Запорожье, провел там зиму, весною явился опять в верхних казачьих городках с толпою удалых и начал рассылать грамоты; в них он рассказывал, будто Долгоруков, им убитый, производил со своими людьми в казачьих городках разные неистовства: вешал по деревьям младенцев, кнутом бил взрослых, резал им носы и уши, выжег часовни со святынею. Булавин в своих воззваниях убеждал и начальных лиц, и простых посадских, и черных людей стать единодушно за святую веру и друг за друга против князей, бояр, прибыльщиков и немцев. Он давал повеление выпускать всех заключенных из тюрем и грозил смертною казнью всякому, кто будет обижать или бить своего брата. Донской атаман Максимов пошел на него снова, но значительная часть его казаков перешла к Булавину. В руки воровского атамана досталось 8000 р. денег, присланных из Москвы казакам. Сам Максимов едва бежал в Черкассы. Эта победа подняла значение Булавина. За нею поднялись двенадцать городков на Северном Донце, двадцать шесть – на Хопре, шестнадцать – на Бузулуке, четырнадцать – на Медведице. Восстание отозвалось даже в окрестностях Тамбова: и там в селах крестьяне волновались и самовольно учреждали у себя казацкое устройство». Это восстание так и вошло в историю под именем Кондратия Булавина.

Булавин рассылал по всей округе письма с напоминанием «братьям-казакам» держаться за старину и защищать свои права, а тому, кто не поддержит казачьи вольности, обещал смертную казнь. Разумеется, после такого обращения к соотечественникам Булавину сдавались городами и переходили на его сторону станицами. К Булавину пристал запорожский атаман Щука, и объединенное войско двинулось на Черкасск, который был отбит у царских воевод. Положение для правительственных войск складывалось такое печальное, что Петру в апреле 1708 года, в разгар военных действий пришлось снять с фронта Василия Долгорукова (брата убитого Юрия) и послать его подавлять казаков. Под командование Долгорукову передали 32 000 человек, среди которых были московские полки и московские дворяне, два украинских полка, присланных Мазепой, ахтырский и сумской полки, воронежские драгуны, а также, как было писано в приказе царя, все, кто может воевать конным. Ярость Петра достигла предела, когда ему донесли о письме Булавина к крымскому хану, которого атаман подбивал идти на Москву.

Максимова, который выступал против булавинского похода, казнили по решению казачьего круга. Сам Кондратий был тут же провозглашен атаманом Войска Донского. Как атаман он теперь поспешил начать военные кампании по трем направлениям: на Волгу были отправлены отряды Ивана Павлова, Игната Некрасова, Лукьяна Хохлача численностью 3500 человек. Они взяли Дмитриевск и Царицын, безуспешно осаждали Саратов; на Северск вели отряды атаманы Драный, Голый и Беспалый, именно они столкнулись с царскими войсками и потерпели от них поражение (Семен Драный погиб, но Никите Голому удалось набрать новых добровольцев и уйти на Старый Айдар); сам Булавин пошел в направлении Азова, пытался штурмовать крепость, но неудачно. И не то, опасаясь расправы, его убили казаки, не то он сам в безвыходном положении застрелился.

После его смерти руководство восстанием принял на себя Игнат Некрасов, который сидел в Царицыне. Он решил возвращаться на Дон, а в городе оставил атамана Павлова, который столкнулся с царскими войсками и был разбит, но ускользнул от царских воевод и соединился с Никитой Голым. Осенью 1708 года эта группировка, расположившаяся в степях под Донецком, была уничтожена московскими силами, а отряды Некрасова, осознав бесперспективность дальнейшей борьбы, ушли во владения крымского хана на Кубань.

Царский гнев обрушился на все земли, которые занимали донские казаки. Многие станицы были полностью уничтожены, часть земель Донского Войска – отобрана, беглые возвращены их владельцам, а самостоятельность Дона упразднена. Для устрашения многие казаки были казнены. Долго еще по Дону плыли виселицы на плотах (так распорядился для острастки упорных Василий Долгоруков) с телами повешенных. Таких плотов с виселицами было несколько сотен…