10 марта Блэйк появился у гавани Лиссабона. Тотчас же было послано требование к королю Жуану IV разрешить вход на рейд Парламентской эскадре и сотрудничать с ней в поимке или уничтожении пиратской эскадры Руперта. На следующий день Блэйк попытался войти в устье Тахо и подняться вверх по реке, но береговые батареи португальцев произвели несколько предупредительных выстрелов, и «морской генерал» был вынужден отказаться от своих намерений. После этого Блейк остался на рейде и потребовал, чтобы португальцы заставили Руперта выйти в море, но получил отказ. Далее, обе эскадры несколько месяцев оставались на якорях, и обе стороны пытались убедить португальцев, что другая сторона была мятежной.

Тем не менее ситуация была тупиковой. Требования Блейка выдать Руперта или заставить его выйти в море или разрешить Блейку атаковать Руперта были португальцами отвергнуты.

В начале апреля у Тахо появились два французских корабля; они знали о присутствии здесь Руперта и, спутав с ним флагман Блейка «Джордж», отсалютовали «Джорджу». Последовал неприятный инцидент, но Блейк не пошел на обострение с французами и отпустил их. Во время заполнения бочонков водой на берегу между враждующими партиями были постоянные стычки: Руперт обвинял кромвелистов в попытках захватить его, а те – в попытке взорвать вице‑адмиральский «Леопард»: моряк и два негра в португальской одежде направились к «Леопарду», имея в лодке бочонок с зажигательной смесью (Руперт увлекался химией), с целью поджечь «Леопард», но английская речь выдала их, и попытка не удалась.

В свою очередь на роялистской эскадре дела были совсем плохи: настроение экипажей было мятежным, было много дезертиров, так что Руперту пришлось даже 10 из них повесить на реях. Положение с экипажами становилось отчаянным, даже на флагмане Руперта из команды в 300 человек осталось всего 40; это было сборище настоящих бандитов, которых привлекали только призовые деньги.

21 мая Блэйк захватил 10 английских торговых кораблей, зафрахтованных португальцами для торгового конвоя в Бразилию. Тут же он направил Жуану IV письмо, в котором предлагал освободить эти суда, если король передаст Парламентскому флоту корабли Руперта. Португальский монарх, прочитав послание Блэйка, рвал и метал – в ярости Жуан IV приказал арестовать всех находящихся на территории Португалии английских подданных, сочувствующих Протекторату, а эскадре Блэйка было запрещено использовать португальские гавани и брать питьевую воду у португальских берегов. В результате необдуманного поступка своего командующего Парламентский флот был вынужден теперь посылать за провизией и водой корабли в Кадис.

Однако 26 мая к Блэйку прибыло подкрепление – эскадра Эдварда Попхэма в составе 68‑пушечного «Резолюшн», 42‑пушечного «Эндрю», 36‑пушечного «Феникс», 28‑пушечного «Сатифэкшн» и четырех торговых судов с провиантом и припасами. Попхэм же привез приказ парламента Блэйку начать операции против португальской торговли, если Жуан IV не согласится на требования Англии. В этой ситуации португальский король попросил Руперта по возможности покинуть португальские воды. В ночь с 21 на 22 июля Руперт снялся с якоря и вместе с 22 португальскими и несколькими французскими судами взял курс в открытое море. Жуан нашел хитрый выход – он сообщил Руперту, что в его атаке на Блэйка принца поддержит португальский флот, поскольку Браганса уж очень хочет отомстить за 10 захваченных кораблей. В этот момент Блэйк был ослаблен – 7 его кораблей ушли в Кадис за провиантом и водой, у «морского генерала» было только 10 кораблей и 9 «бразильцев», захваченных в мае и включенных в Парламентский флот.

Однако вскоре португальцы отстали, а потом и вовсе бросили якорь, не выходя из устья реки, и Руперт оказался предоставленным сам себе. До 28 июля принц раздумывал, атаковать ему или нет, но потом подошли корабли из Кадиса, и Руперт вернулся в Лиссабонскую гавань.

19 августа Блэйк захватил и потопил богатый португальский корабль, возвращавшийся с грузом из Индии (ценностью в 100 тысяч фунтов стерлингов). 14 сентября «морской генерал» атаковал «Бразильский флот» (23 торговых судна), захватил шесть и сжег одно судно. На призах было взято 4000 ящиков сахара и 400 пленных. Еще 5 кораблей из этого злосчастного конвоя захватил позже Попхэм.

После этих событий Жуан IV резко охладел к Руперту, поэтому 12 октября принц был вынужден покинуть Лиссабон с «Констант Реформейшн», «Суоллоу», «Блэк Принс», «Секонд Чарльз», «Генри» и «Мэри», и направился в Средиземное море, захватив по пути 3 торговых английских судна.

18 октября Руперт миновал Гибралтарский пролив. Далее он взял курс на Малагу, где, по слухам, находилось много английских торговых судов. Данные эти подтвердились, и принц решил отправить замаскированный под купца «Генри» на рейд Малаги, с которого абордажные партии ночью должны были напасть на торговые суда. Сам же Руперт с основными силами планировал войти на рейд порта в полночь, чтобы ловить и захватывать беглецов. Однако план этот провалился – часть команды дезертировала с «Генри» и предупредила о готовящемся нападении испанские власти.

Разочарованный Руперт отплыл к Велес‑Малаге, где стояли 4 английских купца. Губернатор этого порта не разрешил принцу войти в гавань, тогда принц соорудил брандер и пустил его на торговцев. В результате два купца сгорели. Роялисты взяли курс на Гибралтар, но там столкнулись с флотом Блэйка, который 20 октября после жаркого боя захватил 36‑пушечный приватир Руперта «Жюль». «Морской генерал» после боя отошел к Кадису, чтобы продать приз, а «Сэконд Чарльз» в это время смог захватить торговца «Уильям энд Джон».

Тем временем парламент решил послать в Средиземное море для защиты торговли адмирала (commander in chief) Уильяма Пенна с 4 кораблями. У берегов Испании Блэйк должен был оставить Пенну свои лучшие корабли, а сам – возвращаться домой. Также Пенн имел и еще одно спецзадание – надо было перехватить Бразильский флот, чтобы, во‑первых, проучить короля Португалии, а во‑вторых – достать деньги для снаряжения и снабжения эскадры.

Блэйк же 3 ноября застиг врасплох у мыса Палос отделившиеся для крейсерства «Генри», «Блэк Принс», «Сэконд Чарльз», «Мэри» и два приза и загнал их в Картахену, откуда они уже никогда не вышли. При этом походя был захвачен «Генри», а «Блэк Принс» разбился при входе в гавань Картахены. До 23 ноября Блэйк искал повсюду оставшиеся корабли Руперта, дошел даже до Майорки, 13 декабря вернулся в Кадис, а 10 февраля 1651 года прибыл в Англию. Попхэм вернулся еще 24 октября 1650 года.

Результатом действия английских эскадр у берегов Иберийского полуострова стало то, что Испания признала Протекторат.

Руперт же 6 ноября после жаркого боя захватил английский корабль «Мармадюк», а потом прибыл на Балеарские острова. Далее он взял путь на Тулон, но попал в жестокий шторм, был отнесен на «Констант Реформэйшн» к Мессине, получил существенные повреждения. Брат же Руперта, принц Мориц, сумел со «Суоллоу» и «Мармадюк» дойти до Тулона.

Руперт пару недель ремонтировал в Мессине свой корабль и присоединился к брату 25 ноября 1650 года. В Тулоне их ласково встретил адмирал Франции Сезар де Бурбон, герцог де Вандом, который рассматривал Руперта как союзника по войне с Испанией. Благодаря Вандому Руперт смог выгодно продать во Франции груз с «Мармадюк», переоборудовать свои суда и докупить еще несколько кораблей. «Мармадюк» теперь стал «Ривендж оф Уайтхолл» (Месть за Уайтхолл), были куплены английский приватир «Хонест Симен» и еще одно судно – «Лоял Сабджект». К апрелю 1651 года вместе с «Констант Реформэйшн» и «Суоллоу» роялистская эскадра насчитывала 5 кораблей. Когда до Руперта дошли слухи, что в марте 1651 года в Средиземное море вошел адмирал Пенн с 8 кораблями, он понял, что оставаться ему здесь слишком опасно.