Бруно Мегре и Бруно Гольниш (Bruno Gollnisch) настаивали на кооперации с другими правыми и центристскими партиями, но Ле Пен был против любого компромисса. На национальном конгрессе партии 1997 г. Мегре заявил о себе как о потенциальном преемнике Ле Пена. Последний, однако, отказался назначать его своим заместителем и, кроме того, выдвинул его жену Жани (Jany) первым номером от НФ на предстоящих выборах в Европарламент.

В начале 1999 г. Мегре и его союзники покинули партию, организовав Национальное республиканское движение, расколов НФ на многих уровнях значительно сильнее, чем это удалось сделать Партии новых сил четверть века назад. Большинство из ушедших желали наладить контакты с парламентскими правыми силами и также считались интеллектуалами партии. Однако Ле Пен назвал раскольников не иначе, как «экстремистами» и «расистами». На выборах в Европейский Парламент в том же году НФ набрал 5,7 %, а национал-республиканцы – лишь 3,3 %.

Опросы общественного мнения перед президентскими выборами 2002 г. предрекали выход во второй тур исполняющего обязанности президента Жака Ширака и кандидата от социалистов Лионеля Жоспена (Lionel Jospin). Однако, опередив Жоспена на 0,7 %, во второй тур неожиданно вышел Ле Пен (16,9 %). Таким образом, впервые более чем за 30 лет во втором туре французских президентских выборов не было кандидатов от левых сил, но при этом присутствовал крайне-правый политик. Успеху Ле Пена способствовало разобщение левых, первоначально не желавших поддерживать Жоспена, а также ухудшение криминальной обстановки в стране. НФ же в своей риторике всегда делал акцент на укреплении в стране законности и правопорядка.

Шираку, однако, не потребовалось вести серьёзной кампании во втором туре, т. к. по стране прокатилась волна массовых протестов против Ле Пена, подкреплённая «чёрным пиаром» в СМИ. В первомайских антилепеновских демонстрациях по всей Франции приняли участие более полутора миллионов человек. Жак Ширак также отказался публично дебатировать с Ле Пеном, поэтому традиционные теледебаты были отменены. В итоге Ширак победил, набрав 82,2 % голосов, при этом, согласно соцопросам, подавляющее большинство тех, кто проголосовал за Ширака, сделали это, «чтобы не прошёл Ле Пен».

Националисты, однако, не смогли капитализировать президентский успех своего лидера, получив на выборах в законодательное собрание 11,3 %. Это, впрочем, было значительно больше, чем у сторонников Мегре из Национального республиканского движения, набравших лишь около одного процента голосов.

На региональных выборах 2004 г. НФ набрал 15,1 % голосов, почти как в 1998 г., однако количество представителей советов из числа кандидатов от НФ уменьшилось почти вдвое из-за возвращения мажоритарной системы выборов на этом уровне.

На выборах в Европарламент от Франции, проходивших в том же году, также была введена мажоритарная система. Партия набрала 9,8 % голосов и получила 7 мандатов.

На президентских выборах 2007 г. Мегре поддержал Ле Пена, который занял четвёртое место, набрав 11 % голосов. При этом партия в том же году набрала всего 4,3 % на выборах в национальную ассамблею и не получила ни одного мандата. Поддержка партии оказалась самой низкой с 1981 г. Только один кандидат, дочь Жан-Мари Ле Пена Марин (Marine), вышла во второй тур двухтуровых выборов в регионе Па-де-Кале (Pas de Calais), но проиграла кандидату от социалистов. Партия также начала испытывать серьёзные финансовые трудности, из-за которых, в частности, Ле Пену пришлось продать здание штаб-квартиры «Национального фронта» в Париже, а также свой собственный бронированный автомобиль. Двадцать постоянных сотрудников аппарата НФ также были в 2008 г. отправлены в неоплачиваемый отпуск.

На региональных выборах 2010 г. НФ, однако, восстановил свои позиции, набрав почти 12 % общего числа голосов и получив 118 мандатов[740].

Осенью 2008 г. Жан Мари Ле Пен анонсировал, что в 2010 г. уйдёт с поста президента партии[741]. В борьбу за лидерство вступили вице-президент партии Бруно Гольниш и Марин Ле Пен, поддержанная своим отцом. В январе 2011 г. Марин Ле Пен, получив две трети голосов на партийных выборах, стала новым лидером националистов[742].

Марин Ле Пен изначально видела свою задачу в трансформации НФ в более «мейнстримовую» партию, избавленную от ксенофобского имиджа. Такая политика стала быстро приносить плоды: на выборах в советы кантонов в 2011 г. НФ набрал 15 % от общего числа голосов (в сравнение с 4,5 % в 2008 г.). Однако из-за мажоритарной системы это дало партии лишь 2 места из 2026.

На президентских выборах 2012 г. Марин Ле Пен заняла третье место, набрав 17,9 % голосов и показав лучший на тот момент результат за всю историю НФ.

На выборах в национальное собрание 2012 г. националисты получили 13,6 % голосов (в первом туре) и два мандата. Одним из депутатов от НФ стала Марион Марешаль-Ле Пен (Marion Maréchal-Le Pen), внучка Жана-Мари и племянница Марин, самый молодой парламентарий в истории Франции (на момент выборов ей было 23 года)[743].

Идеологически НФ, оставаясь националистической партией в самом широком значении термина, существенно менялся на протяжении своей истории. С одной стороны, НФ становится всё более и более умеренной партией, во всяком случае риторически, с другой стороны, риторику и идеологию НФ зачастую перенимали их конкуренты из числа мейнстримовых партий. Так, антииммигрантская риторика экс-президента Франции и лидера Республиканской партии Николя Саркози сейчас неотличима от риторики НФ, а президент Франсуа Олланд требует реформирования ЕС с тем, чтобы у стран-участниц было больше независимости, что является одним из ключевых требований евроскептиков[744].

В конце 1970-х гг. и в 80-е гг. экономическая программа НФ была скорее либеральной, упирающей на снижение налогов, уменьшение государственной интервенции и бюрократии. Эту программу 1978 г. называли «рейганизмом до Рейгана».

Однако к 1990-м гг. программа НФ сместилась к протекционизму. Это следует понимать в контексте окончания Холодной войны, когда противостояние коммунизма и «свободного мира» перешло в борьбу национализма и глобализации.