В конце августа 1922 года командующий флотилией адмирал Старк был назначен начальником тыла, к на флотилию с принадлежащими ей сухопутными частями лег ряд новых задач: охрана Владивостока; борьба с партизанами на полуострове Муравьев-Амурский в Посьетском районе; охрана побережья Татарского пролива; поддержка блокады побережья залива Петра Великого к востоку от Владивостока; оборона Камчатки; охрана звериных и рыбных промыслов и лесных богатств, расположенных в районе побережья, занятого белыми; доставка пополнений и грузов отряду генерала Пепеляева на побережье Охотского моря. Вся эта работа требовала исключительного напряжения всего состава флотилий.

26 сентября 1922 года генерал Дитерихс издал указ, в коем говорилось, что, ввиду критического положения, все силы и средства должны быть обращены на защиту края. Согласно указу, временно закрывались все высшие учебные заведения и военные училища, для призыва учащихся в войска создавалось ополчение. Во Владивостоке под ружье было поставлено 4 тыс. человек. В близлежащем городке Никольске было собрано около 700 человек. Спешно формировались офицерские батальоны, ратники снабжались теплой одеждой из средств городских самоуправлений и, по готовности, немедленно отправлялись на фронт. Образовывался и особый фонд на нужды войны. Между тем красные, подтянув резервы, начали проявлять особую активность на фронте.

В октябре 1922 года началась эвакуация. Из частных судов и пароходов Добровольного флота был составлен отряд транспортов. Всего эвакуации подлежало 10 тысяч человек, считая в том числе несколько сот раненых, для которых было зафрахтовано два японских парохода. Эвакуация Владивостока протекала во всех деталях, строго следуя секретному оперативному приказу командующего Сибирской флотилией от 23 октября 1922 года № 26. Этот приказ, рассчитанный по часам, был выполнен в совершенном порядке, точно в назначенные сроки. К 11 часам ночи 24 октября Владивосток был оставлен белыми частями. Красные вступили в город в 10 часов утра 25 октября, но не имели плавучих средств, чтобы организовать преследование белой флотилии. Так перевернулась последняя страница истории борьбы с большевиками на водах Отечества.

Белый фронт, защищавший черноморское побережье в начале 1920 года, был достаточно силен, чтобы держать под контролем не только берега занятого Русской армией Крымского полуострова, но и всю прибрежную зону Черноморско-Азовского бассейна. Однако общая политическая обстановка за границей и в самой России складывалась не в пользу планов, намеченных Петром Николаевичем Врангелем для Юга России. Приказом командующего Черноморским флотом адмирала Саблина от 20 июня 1920 года военный флот был разделен на три отряда и состоял из более чем 120 судов. С той поры, как вся борьба с большевиками была перенесена в Крым, Главнокомандующим Вооруженными силами на Юге России генералом Врангелем было дано секретное приказание командующему штабом флота на случай неудач по отражению большевистского наступления на фронте перешейков, разработать план эвакуации армии, флота и учреждений тыла из Крыма в Константинополь.

Секретным отношением начальника штаба Главнокомандующего Вооруженными силами на Юге России от 4 апреля 1920 года за № 002430, на имя командующего флотом, Главнокомандующий приказывал: «Соблюдая полную секретность, в кратчайший срок подготовить соответствующий тоннаж для перевозки в случае необходимости около 100 тыс. человек в Константинополь. Для этого предлагалось распределить нужный тоннаж по предполагаемым портам посадки с таким расчетом, чтобы было можно начать посадку на суда через 4–5 дней после начала отхода с перешейков». При этом Врангелем предлагались пункты посадки и численное распределение войск по портам полуострова. Работа над планом эвакуации началась, и в ней приняли самое деятельное участие все высшие чины флота, посвященные в текст секретной бумаги Врангеля. Их умения и навыки помогли в самый кратчайший срок подготовить все необходимое для того, чтобы спасти Русскую армию от полного разгрома большевистскими ордами.

Те из чинов армии, кто понадеялся на милость победителей, не желая эвакуироваться за границу, имели возможность очень скоро убедиться в собственной трагической ошибке. Образ залитого кровью Крыма зимы 1920 года стал хрестоматийным примером отношения большевиков к побежденным. Воцарившись в некогда великой стране, именно из Крыма декабря 1920 года они начали свой бесконечный террор, продлившийся не одно десятилетие. В связи с этим тем, кто избежал страшной смерти на мысе Св. Ильи, на Чумной горе и в наспех созданных концентрационных лагерях, нельзя забыть неоценимые заслуги командующих Черноморским флотом вице-адмиралов Михаила Павловича Саблина и Дмитрия Всеволодовича Ненюкова. Нельзя также не вспомнить деятельность начальника штаба флота, контр-адмирала Владимира Владимировича Николя и начальника Морского управления вице-адмирала Александра Михайловича Герасимова. Их успехи обусловлены участием в разработке и исполнении плана крымской эвакуации других специалистов. Флагмана инженера-механика генерал-лейтенанта Ермакова, контр-адмирала Сергея Владимировича Евдокимова и подчиненных им лиц.

12 октября 1920 года командующим Черноморским флотом и начальником Морского управления барон Врангель назначил контр-адмирала Михаила Александровича Кедрова. Это назначение было призвано заменить больного и через несколько дней скончавшегося вице-адмирала Саблина. Начальником штаба флота, по представлению Кедрова, был назначен хорошо известный ему контр-адмирал Николай Николаевич Машуков. 27 октября 1920 года командующим флотом были назначены в порты посадки старшие морские начальники, коим были даны подробные инструкции на случай эвакуации. Так в порт Евпатории был назначен контр-адмирал Александр Михайлович Клыков, в Ялтинский порт — контр-адмирал Павел Павлович Левицкий, в Феодосию — капитан 1-го ранга Иван Константинович Федяевский и в Керчь — начальник 2-го отряда судов контр-адмирал Михаил Александрович Беренс.

После того как последний солдат взошел на корабль и в Севастополе больше ни одной военной части не оставалось, в 14 ч 50 мин 2 ноября 1920 года прибыл с Графской пристани на крейсер «Генерал Корнилов» сам Главнокомандующий генерал Врангель. Прибыв в сопровождении ближайших чинов штаба, он отдал приказание сниматься с якоря. На борту крейсера разместился и штаб Главкома, и штаб командующего флотом, а также особая часть штаба флота. Там же пребывали и Государственный банк, и семьи офицеров, и команды крейсера, а также многочисленные пассажиры. Всего на борт крейсера поднялось 500 человек.

Следуя в изгнание, не предвидя, что для многих чинов Белой армии оно станет пожизненным, Главнокомандующий послал обнадеживающую радиотелеграмму в Константинополь А. В. Кривошеину для широкого распространения в армии и среди беженцев: «Русская армия, оставшись одинокой в борьбе с коммунизмом, несмотря на полную поддержку крестьян, рабочих и городского населения Крыма, вследствие своей малочисленности, не смогла отразить натиск во много раз сильнейшего противника, перебросившего войска с польского фронта. Я отдал приказ об оставлении Крыма, учитывая те трудности и лишения, которые Русской армии придется перетерпеть в ее дальнейшем крестном пути, я разрешил желающим остаться в Крыму. Таких почти не оказалось. Все казаки и солдаты Русской армии, все чины Русского флота, почти все бывшие красноармейцы и масса гражданского населения не захотели подчиниться коммунистическому игу. Они решили идти на новое тяжелое испытание, твердо веря в конечное торжество своего правого дела. Сегодня закончилась посадка на суда, везде она прошла в образцовом порядке. Неизменная твердость духа флота и господство на море дали возможность выполнить эту беспримерную в истории задачу и тем спасти Армию и население от мести и надругания. Всего из Крыма ушло около 150 000 человек и 120 судов Русского флота. Настроение войск и флота отличное, у всех твердая вера в конечную победу над коммунизмом и в возрождение нашей Великой Родины. Отдаю Армию, Флот и выехавшее население под покровительство Франции, единственной из великих держав, оценившей мировое значение нашей борьбы».