В первые годы британского господства характер экспорта страны не изменился. Судан вывозил гуммиарабик, слоновую кость, страусовые перья, кожи. Бюджет, остававшийся до 1913 г. дефицитным, расходовался на содержание армии, полиции, сооружение стратегических железных дорог, мостов и телеграфных линий. Основное бремя расходов Англия возложила на своего бесправного партнера по кондоминиуму — Египет, который в течение ряда лет ежегодно вносил английской колониальной администрации крупные суммы на «содержание египетского войска».

Интерес к возможностям развития хлопководства в Судане англичане проявили в первые же годы после установления режима кондоминиума. В 1904 г. в Лондоне был организован «Судан икспериментл плантейшис синдикэйт», переименованный затем в «Судан плантейшис синдикэйт». В 1913 г. британский парламент гарантировал заем для развития хлопководства в Судане в 3 млн. ф. ст., но война помешала выполнению этих планов.

Существенные сдвиги произошли в промышленности и сельском хозяйстве Судана за годы войны. Английское командование в широких масштабах использовало сырьевые и продовольственные ресурсы страны. За военные годы экспорт зерна вырос в 27 раз (с 2080 до 54 945 тыс. т); крупного рогатого скота — примерно в 4 раза (с 10 тыс. до 39 тыс. голов); овец и коз — в 2 раза (с 99 тыс. до 208 тыс. голов). Объем внешней торговли с 1908 по 1919 год увеличился в 15 раз — с 500 тыс. ф. ст. до 7500 тыс. ф. ст.

В Первую мировую войну Судан оказался в стороне от основных театров военных действий. Но суданские вооруженные силы по воле английского командования принимали участие в войне на стороне Антанты против Германии в Восточной Африке и во Французской Экваториальной Африке, несли охранную службу в зоне Суэцкого канала и на Синайском полуострове. Суданские рабочие батальоны в 1915 г. были посланы в Дарданеллы.

Во время войны Султан Дарфура Али-Динар, находившийся в вассальной зависимости от суданского генерал-губернатора, пользуясь поддержкой арабских племен Кордофана и ордена сенуситов в Ливии, пытался организовать вооруженную борьбу против английских колонизаторов. Но отряд полковника Келли 22 мая 1916 г. разбил войско Али-Динара и 23 мая занял столицу Дарфура Эль-Фашер. Али-Динар продолжал неравную борьбу и 16 ноября того же года погиб в бою с англичанами. Так был разгромлен колонизаторами последний оплот сопротивления в Восточном Судане, и Дарфур в качестве провинции был включен в состав Англо-Египетского Судана.

19 ноября 1924 г. был убит главнокомандующий египетской армии и английский губернатор Судана Ли-Стэк. Лондон потребовал вывести египетские войска из Судана и в одностороннем порядке разорвал договор с кондоминиумом, то есть Судан полностью стал колонией Англии.

Из Судана были выведены все египетские войска и чиновники. Теперь англичане решили опираться на местную феодальную знать. В 1925 г. были созданы так называемые «закрытые районы», составлявшие свыше двух третей Судана.

В закрытые районы были включены провинции: Дарфур, Бахр-эль-Газаль, Верхний Нил, почти весь Кордофан, некоторые районы провинции Кассала. В этих районах были восстановлены наиболее значительные союзы племен, сохранены остатки феодальных султанатов, среди оседлого населения искусственно созданы племена во главе с вождями, назначенными англ. властями. В закрытых районах не только консервировались, но и искусственно реконструировались отсталые социальные отношения.

В то же время в центральных районах страны Англия создавала условия для превращения Судана в хлопковую плантацию, в рынок сбыта для своих товаров. Вывоз хлопка, скота, гуммиарабика был монополизирован британскими компаниями. В центральных районах Судана создавались хлопковые плантации (главным образом в междуречье Белого и Голубого Нила, в районах Кассалы и Токара), построены предприятия по первичной обработке хлопка, проведены железные дороги, сооружены Сеннарская плотина и водохранилище. Гезирская оросительная система охватила 1 млн. дедданов земли. Естественно, эта земля стала приносить доход английским акционерным компаниям «Судан плантейшен синдикейт» и «Кассала коттон компани». Земли Гезирского района, бывшие прежде собственностью суданцев, были частью экспроприированы колониальными властями, в частью «арендованы» на 40 лет по крайне низким ценам. В итоге за годы первого послевоенного десятилетия Судан стал страной монокультуры хлопка (в 1929 г. хлопчатник давал 70% стоимости экспорта).

По англо-египетскому соглашению 1929 г., заключенному без участия и согласия суданцев, 92% нильских вод, используемых для орошения, предоставлялось Египту и лишь 8% — Судану. В дополнение к этому в 1933—1937 гг. на Ниле, выше Хартума, была построена плотина Гебель-Аулия на средства Египта, управляемая египтянами и используемая в интересах Египта. Созданное при этом водохранилище лишало Судан значительного количества плодородных земель, затопленных водами Нила.

26 августа 1936 г. Лондон согласился на восстановление англо-египетского кондоминиума в Судане.

Летом 1940 г. части итальянской армии вторглись на территорию Судана со стороны Эритреи и заняли города Кассалу, Галлабат, Курмук. К весне 1941 г. итальянцы были вытеснены из страны.

В 1941—1945 гг. Судан стал одной из значимых военных баз Англии в Африке, где имелись аэродромы, военные предприятия, ремонтные мастерские. Суданские воинские части принимали участие в боевых операциях в Эритрее, Египте, Ливии, Тунисе. Создание в годы войны предприятий по производству боеприпасов, военного снаряжения и обработке сельхозпродукции способствовало росту численности рабочего класса и обогащению местных предпринимателей.

Созданная в 1937 г. общесуданская организация «Генеральный конгресс лиц, окончивших учебные заведения» объединила радикальные группы интеллигенции и мелкой буржуазии, а также часть офицеров. В августе 1945 г. «Генеральный конгресс» выступил с требованием создания в Судане национального правительства и объединения Судана с Египтом на правах федерации.

Усилившиеся еще в годы войны разногласия внутри «Генерального конгресса» о путях развития Судана привели в 1945 г. к его расколу и образованию ряда политических партий. Крупнейшей была созданная в том же году партия «Аль-Умма» («Нация»), отражавшая интересы феодалов, вождей племен, части буржуазии и госслужащих. Эта партия была связана с влиятельной сектой «Аль-Ансар». Выступая за независимый Судан, против союза с Египтом, «Аль-Умма» склонялась к дальнейшему сохранению прочных связей с Англией.

Тогда же была создана партия «Аль-Ашикка» («Родные братья»). Она опиралась на городские слои мелкой и средней буржуазии, крупное чиновничество, интеллигенцию, учащуюся молодежь, часть рабочих и крестьян, главным образом сторонников секты «Аль-Хатмия», основанной в начале XIX века. Партия выступала за единство Судана с Египтом и создание египетско-суданского государства.

15 октября 1951 г. парламент Египта денонсировал Англо-египетский договор 1936 г. и конвенцию 1899 г. о Судане. Однако 12 февраля 1953 г. было заключено англо-египетское соглашение о Судане, предусматривавшее «самоопределение» Судана после трехлетнего переходного периода при сохранении в силе на этот период всех основных полномочий английского генерал-губернатора, а также военной оккупации Судана английскими войсками.