На следующий день, 8 марта, Шилков снова поднимает четверку Л-5 в воздух. В 16.25 на высоте 2000 м. в районе г. Нарва наши летчики вели бой на этот раз с шестью ФВ-190. Шилков сзади сверху с дистанции 100—50 м. сбил один ФВ-190. В этом же бою летчик Баранов сзади сверху был атакован ФВ-190 и сбит.

26 марта за 105 боевых вылетов, 25 проведенных воздушных боев, сбитие 11 самолетов противника лично и 3 в группе командир звена 2-й аэ гвардии младший лейтенант Шилков был представлен к ордену Ленина. Но командование решает немного «подождать», чтобы летчик добрал необходимое количество сбитых для представления к званию Героя. Ему вручают третий орден Красного Знамени.

Новых побед аса не пришлось долго ждать. 1 апреля 12 Ла-5, которых ведет комэск-1 Володин, сопровождали группу Пе-2 при налете на вражеские корабли севернее Азери. В 18.00–18.05 шесть Ла-5 (ведущий Цапов) на высоте 4000 м. вели бой с шестью ФВ-190. Шилков вовремя заметил двух ФВ-190, идущих со стороны солнца. Ведущий группы И.И. Цапов, не замечая этой пары, начал разворот, тем самым подставляя свой хбост самолетам противника. Один ФВ-190 пошел в атаку на ведущего пары. Шилков устремился ему наперерез и заградительным огнем заставил его отвернуть. Его ведомый. Жучков смело врезался между ними и атакой сверху с дистанции 100 м. сбил одного ФВ-190, тем самым спас комэска-2 от явной гибели. Шилков тремя последовательными атаками сбил второго ФВ-190.

2 апреля вновь четверка Ла-5 Шилкова и шестерка Ла-5 Володина прикрывали Пе-2, наносившие БШУ по кораблям противника в районе Азери. В 17.35 группа Шилкова на высоте 3000 м. в районе б. Вигрунд вела бой с четырьмя ФВ-190. Шилков атакой сверху сзади с дистанции 200–215 м. сбил одного ФВ-190. Мокшин атакой сзади сверху сбил второго ФВ-190.

24 апреля Шилков ведет шестерку Ла-5 с задачей выметания авиации противника из района Кунда— Азери. В 18.22 на высоте 2000 м. в 15 км юго-восточнее о. Б. Тютерс летчики вели бой на вертикальном маневре с четырьмя ФВ-190. Кравцов атакой сверху сзади с дистанции 50 м. сбил одного ФВ-190. Мокшин и Морозов сзади сверху с дистанции 60–20 м. атаковали двух ФВ-190 и сбили одного из них.

13 мая восемь Ла-5 (ведущий Цапов) вылетали на выметание истребительной авиации противника из района Азери. В 09.12 на высоте 800 м. вели бой с восемью ФВ-190, которые пытались атаковать Ил-2. Шилков сзади сверху с дистанции 70 м. сбил одного ФВ-190. Один подбитый ФВ-190 с дымом ушел на юго-запад.

7 июля 1944 г. звено Ла-5 под командованием Шилкова вылетало на прикрытие десанта и кораблей в районе Койвисто. В 08.25 на высоте 3000 м. завязался бой с восемью ФВ-190, которые бомбили острова. Бой шел на виражах на встречных курсах. В результате боя Шилков двумя атаками с дистанции 100 м. сбил одного ФВ-190.

В начале июля за 141 успешный боевой вылет и участие в 32 воздушных боях, в которых он лично сбил 14 и в группе 3 самолета противника, лейтенант Шилков представлен к званию Героя Советского Союза. 22 июля выходит Указ, а Золотую Звезду летчику вручат в начале сентября.

6 августа 1944 г. при отражении налета авиации на корабли был сбит самолет летчика Серого. Вылетавшие на поиск летчики на траверзе Кохтла в 10–12 км северо-западнее Тойла и в 5–6 км от берега заметили в шлюпке человека. Шлюпку тянуло к берегу, занятому немцами. Самолет КОР-2 из-за большой волны посадку произвести не мог и только сбросил продукты. В этот район поспешили два БМО. В течение этого периода летчики 3-го гиап непрерывно висели в районе и наводили катера на шлюпку. Дважды вылетал с этой задачей Шилков. Летчик Серый был спасен.

На следующий день, 7 августа, четверка Ла-5, которую повел Шилков на прикрытие кораблей в Нарвском заливе, в районе банки Вигрунд на высоте 3000 м. вела бой с двумя ФВ-190. Шилков сзади сверху с дистанции 50 м. сбил одного ФВ-190. Из самолета выпрыгнул парашютист. Летчик Швыдков сзади сверху с дистанции 75 м. сбил второго ФВ-190.

Когда командир 2-й эскадрильи Иван Цапов в конце октября убыл на учебу в г. Моздок, на его место был назначен А. Шилков, а более опытный летчик И. Кравцов стал командиром 1-й авиаэскадрильи.

Капитан Шилков и летчики, которых он водил в бой, отличились в ноябре при освобождении острова Церель.

Особо удачный бой провела группа Шилкова 23 ноября. Юго-восточнее острова Церель наши летчики вели бой с восемью ФВ-190. Шилков атакой сзади сверху с дистанции 200—30 м. сбил ФВ-190. Морозов сверху сбил второй ФВ-190. Затем Шилков атаками сзади сверху с дистанции 150—50 м. сбил третий ФВ-190.

В заключительных боях победного 1945 г. Шилков сбивает свой последний, 19-й самолет. 17 февраля на Ла-7 при прикрытии корректировщика Ил-2 в районе Либава его восьмерка вступает в бой с 12 ФВ-190. Результат боя: четыре сбитых ФВ-190.

По одному самолету противника, кроме него, сбили Рябушкин, Першин и Попов.

Еще один бой в составе восьмерки при выполнении аналогичной задачи в том же районе группа Шилкова проводит 7 марта 1945 г. Самолетов противника на этот раз меньше — шесть, но итог боя ничуть не хуже — три поверженных на землю ФВ-190 без потерь с нашей стороны. Их сбили Рябушкин, Лоншаков и Дырин. Это был один из последних боев, которые провел комэск-2 А. Шилков за войну.

За время его командования 2-й эскадрильей летчики сбили 33 самолета. Последней наградой летчику, сделавшему после присвоения ему звания Героя, 46 боевых вылета и проведшему 9 воздушных боев, в которых он сбил 5 самолетов противника, стал четвертый орден Красного Знамени.

Всего за войну Александр Шилков совершил 164 боевых вылета на ЛаГГ-3, Ла-5, Ла-7, из них 7 на разведку, 31 — на прикрытие кораблей флота, в 40 воздушных боях лично сбил 19 и в группе 3 самолета противника (в приведенных единицах ровно 20). По количеству личных воздушных побед он находится в числе первых асов 3-го гиап, 1-й гиад и всей истребительной авиации ВВС ДКБФ.

В боевой характеристике комэска отмечалось:

«Волевой, грамотный командир, обладающий отличными организаторскими способностями. Прекрасный летчик-истребитель с отличной техникой пилотирования, он сочетает героизм и мужество с трезвым расчетом. Он непрерывно совершенствуется сам и учит молодой летный состав, как надо бить врага… Любимец летчиков, в его лице летчики видят воплогцение советского аса. Не было воздушного боя, чтобы Шилков не вышел победителем, несмотря на превосходство врага. Не только в воздухе, но и на земле он всегда среди летчиков, что-то объясняет, что-то доказывает, причем как в воздухе, так и на земле от него дышит напористостью, убедительностью, настойчивостью. Он учит молодых летчиков, что в бою надо иметь горячее сердце патриота и холодный рассудок Врага надо бить умением, перехитрить его, навязать ему свою волю. Для него воздух — это родная стихия, и кто его окружает стремится быть на него похожим».

После войны Шилков продолжил службу. Командовал эскадрильей на Северном флоте. Освоил МиГ-15 и МиГ-17. Как бы наверстывая упущенное, его военная карьера набирала обороты. В то время как многих летчиков увольняли по возрасту, по ранению, за пребывание в плену, он уверенно продолжал службу. Окончил ВОК авиации ВМС в г. Моздоке, затем поступил в Военно-морскую академию в Ленинграде.