К осени 1944 г. советскому руководству стало ясно, что сопротивление ресоветизации Прибалтики оказалось неожиданно более серьезным и активным, чем можно было ожидать от остатков германских частей и «полицаев»{1640}. С целью усиления контроля над ситуацией, 11 ноября 1944 г. были созданы Бюро ЦК ВКП(б) по Литве и Эстонии, 29 декабря 1944 г. — по Латвии. В задачу этим органам ставилось, в том числе «пресечение деятельности буржуазных националистов и других антисоветских элементов». С целью подготовки кадров для идеологической борьбы с националистами, согласно Постановлению ЦК ВКП(б) от 23 января 1945 г., в Москве и Ленинграде были организованы двухмесячные курсы по подготовке партийных работников для Латвийской, Литовской и Эстонской ССР. Перед пропагандистами были поставлены задачи «разъяснить основные принципы советского строя, ленинско-сталинской политики дружбы народов СССР, необходимость соблюдения советских законов и государственной дисциплины, раскрыть перед народом истинное лицо… буржуазных националистов, как злейших врагов… народа», обнародовать «факты зверств, издевательств и насилий, творимых презренными буржуазными националистами… привлекать к ответственности соучастников зверств немецких оккупантов», воспитывать население «в духе дружбы народов, уважения к русскому народу и другим народам СССР». В Прибалтике были сформированы группы «советского актива», организованы съезды крестьян, молодежи, интеллигенции, женщин, работников отдельных отраслей промышленности. Работали агитаторы, многомиллионными тиражами были изданы книги, календари, плакаты, портреты и пр.{1641}

Одной из трагических акций, осуществленных советскими властями в заключительный период войны, стали депортации некоторых народов СССР, решения о которых были связаны с реакцией советского руководства на «поведение» представителей этих народов во время оккупации и после нее. С целью борьбы с бандповстанческим движением, в апреле 1943 г. из Карачаевской АО было выселено 673 члена семей «бандглаварей и активных бандитов»{1642}. Однако эта мера советскому руководству показалась недостаточной. 12 октября 1943 г. был издан Указ Президиума ВС СССР и 14 октября 1943 г. — Постановление СНК СССР о выселении всех карачаевцев в Казахскую и Киргизскую ССР. Этот шаг был «обоснован» тем, что «в период оккупации… многие карачаевцы вели себя предательски… а после изгнания оккупантов противодействуют проводимым советской властью мероприятиям, скрывают от органов власти врагов и заброшенных немцами агентов, оказывают им помощь». Всего было депортировано 59 506 карачаевцев{1643}. 27 декабря 1943 г. Карачаевская АО была ликвидирована, а ее территория была поделена между Краснодарским, Ставропольским краями и Грузинской ССР.

Политическое решение о депортации калмыцкого народа было принято еще летом 1943 г.{1644} В декабре 1943 г. Президиум ВС СССР и Политбюро ЦК ВКП(б) приняли постановление «о ликвидации Калмыцкой АССР и образовании Астраханской области в составе РСФСР». Калмыки, в том числе проживавшие в сопредельных с Калмыцкой АССР регионах, подлежали депортации в Алтайский и Красноярский края, Омскую и Новосибирскую области. «Основанием» для депортации было обвинение калмыков в сотрудничестве с оккупантами, сдача в плен воинов 110-й калмыцкой кавалерийской дивизии, а также бандповстанческие проявления в Калмыкии{1645}. К 3 января 1944 г. было депортировано 93139 калмыков, а также арестовано 750 чел. из числа «бандпособников, пособников оккупантов, антисоветских элементов»{1646}.

Решение о депортации чеченского и ингушского народов, по данным А. Некрича, было принято 11 февраля 1943 г., однако И.В. Сталин и другие руководители государства высказались за то, чтобы отложить этот шаг до окончательного изгнания оккупантов с Северного Кавказа{1647}. Акция по депортации была осуществлена в период с 23 по 29 февраля 1944 г., в результате чего в Казахстан и Киргизию было депортировано 520 055 чел., а также арестовано 2016 чел.{1648} 7 марта 1944 г. Президиум ВС СССР издал указ «О ликвидации Чечено-Ингушской АССР и об административном устройстве ее территории», на основании которого был образован Грозненский округ (с 22 марта 1944 г. — Грозненская область). Южная часть территории ЧИАССР была передана Грузинской СССР, некоторые восточные районы — Дагестанской АССР, западные районы — Северо-Осетинской АССР. Советское руководство официально «обосновывало» депортацию чеченцев и ингушей как наказание за прогерманское поведение во время войны{1649}.

Планы по депортации балкарского народа в наказание за «предательство» и «неспособность защитить Эльбрус» родились у Л.П. Берии в январе 1944 г.{1650} 8–9 марта 1944 г. была проведена операция по выселению балкарцев, в рамках которой в Казахстан и Киргизию было депортировано 44 415 чел. 8 апреля 1944 г. Кабардино-Балкарская АССР была переименована в Кабардинскую АССР. Территория Балкарии, прилегающая к Эльбрусу, была передана Грузинской ССР. 20 мая 1944 г. Л.П. Берия запросил у И.В. Сталина разрешение выселить из Кабарды 2467 «немецких ставленников и предателей». В «обоснование» недоверия к кабардинцам, Л.П. Берия предоставлял И.В. Сталину информацию о заброске на Кавказ германских агентов из числа кабардинцев в июле — августе 1944 г.{1651}. Однако тотальной депортации кабардинского народа не последовало.

К апрелю 1944 г. руководство Крымского обкома ВКП(б) прямо обвиняло крымско-татарский народ «в пособничестве немцам», а в других документах отмечалось, что крымские татары «не приветствуют возвращение Красной Армии». 2 апреля и 11 мая 1944 г. ГКО издал постановления о выселении крымских татар из Крымской АССР в Узбекскую ССР, 29 мая 1944 г. — из Краснодарского края и Ростовской области в Марийскую АССР, Горьковскую, Ивановскую, Костромскую, Молотовскую и Свердловскую области РСФСР. Операция по депортации крымских татар была проведена с 18 по 21 мая 1944 г. 2 июня 1944 г. Л.П. Берия предложил И.В. Сталину выселить с территории Крымской АССР проживавших там болгар, греков и армян, что было поддержано. В итоге к 4 июля 1944 г. из Крыма было выселено 183 155 крымских татар, 12 422 болгар, 15 040 греков, 9621 армян, 1119 немцев, 3652 «иноподданных», а также «изъято» 7833 чел. из числа «антисоветского элемента»{1652}. 30 июня 1945 г. Крымская АССР была преобразована в Крымскую область{1653}.

16 июня 1944 г. состоялась депортация ряда «антисоветских элементов» из Прибалтики. В ночь с 5 на 6 февраля 1945 г. было выселено 673 чел. немцев и лиц без гражданства из Риги, которые были отправлены эшелоном в Коми АССР «для трудового использования»{1654}. Массовая депортация из Прибалтики была проведена после войны — в 1948 г. (операция «Весна»){1655}. На Западной Украине депортация семей «оуновцев» планировалась еще до освобождения этого региона. В этом регионе за период с 1 февраля по 31 декабря 1944 г. было выселено 13 320 чел., за первое полугодие 1945 г. — 5395 семей 12 773 чел.{1656}.