«История Литовской ССР» гласит: «Лагеря смерти и места массового уничтожения советских граждан и военнопленных существовали также в районе Алитуса, Шяуляя, Паневежиса, Баржая, Укмерге, Ново-Вильни и др.». Только в Паперяе, на окраине Вильнюса, фашисты уничтожили около 100 тысяч человек.

В «Истории Латвийской ССР (Сокращенный курс)» сказано: «В целях устрашения населения гитлеровцы прибегали к таким зверским актам террора, как сожжение населенных пунктов и полное истребление их населения. Такая судьба постигла деревню Аудрини Резекненского уезда, население которой прятало красноармейцев. Узнав об этом, гитлеровцы в начале 1942 года сожгли деревню, 30 ее жителей расстреляли на рыночной площади в Резекне, остальных 179 — у Анчупанских холмов. То же произошло в январе того же года с деревней Барсуки Луудзинского уезда и позднее осенью 1944 года с пятью хуторами в Злекской волости Венстпилского уезда».

В «Истории Литовской ССР» отмечалось: «За акты сопротивления и помощь советским партизанам гитлеровские оккупанты полностью сожгли деревни Ферма, Лазденай, Друшиляй, Шаркишес, Милюнай, Пирчюпяй. Жители одних деревень были расстреляны или сожжены, другие — угнаны в фашистское рабство».

Уничтожению на месте подвергалось население целых сел и местностей. Так, в сентябре 1941 года в местечке Эйшишкис были расстреляны из пулемета 800 человек: «3 июня 1944 года в деревню Перчюпе Тракайского уезда ворвались гитлеровцы. Окружив деревню, они произвели повальный грабеж, после чего загнали всех мужчин в один дом, а женщин и детей в три других дома и подожгли их. Пытавшихся вырваться и бежать фашистские изверги ловили и снова бросали в горевшие дома. Так было сожжено все население деревни — 119 человек, из них 21 мужчина, 29 женщин и 69 детей… Зверское массовое истребление мирных жителей немецкие оккупанты произвели в районе города Мариямполе, где было уничтожено 7700 человек. В местечке Сейрияй Апитусского уезда было расстреляно немцами 1900 человек, в Пильвишкяе было расстреляно 1000 жителей. В Шяуляйском уезде, по неполным данным, было уничтожено 3830 человек. В городах Тракай, Паневежис, Укмерге, Кедайняй и Брижай немцы истребили 37 640 человек мирного населения».

Массовое уничтожение населения опустошило земли Прибалтики. По оценкам Р. Мисиунаса и Р. Таагепера, только в результате казней, совершенных властями «Остланда» в трех республиках, было истреблено 210 тысяч человек местного населения (140 тысяч в Литве, 65 тысяч — в Латвии, 5 тысяч — в Эстонии).

К тому же по мере приближения к прибалтийским землям Красной Армии оккупанты и их пособники постарались увести за собой мирное население Прибалтики. В «Истории Латвийской ССР» сказано: «Эвакуируя» местное население, гитлеровцы старались обезлюдить целые районы. В первой декаде октября 1944 года ареной широко развернутой охоты на людей стала Рига. В этой операции приняли участие полиция и солдаты немецкой армии, окружавшие целые районы, с помощью собак хватавшие людей и гнавшие их в порт на суда. Таким образом из Риги было увезено более 76 тысяч жителей». Всего же из Латвии было вывезено в 1944 году 279 615 человек. Около 70 тысяч было вывезено из Эстонии.

Организованный фашистами вывоз десятков тысяч жителей Прибалтики со своей родной земли также сопровождался новыми потерями, главным образом из-за тягот эвакуации и невыносимых условий жизни в Германии. По мнению Р. Мисиунаса и Р. Таагепера, в 1944–1945 годах погибло около 20 тысяч эмигрантов из Прибалтики. Немалые потери понесли и те, кто сражался на стороне Германии и Финляндии (15 тысяч эстонцев, 40 тысяч латышей, 10 тысяч литовцев). Жертвы мирного населения края от военных действий составили еще около 30 тысяч человек.

Даже если учитывать гибель только местного населения (как это делают Р. Мисиунас и Р. Таагепера), то количество жителей Прибалтики сократилось за 1941–1944 годы на 7 процентов. Получалось, что сохранение оккупационного режима, даже без каких-либо массовых выселений, предусмотренных планом «Ост», привело бы к тому, что к 2000 году на территории Прибалтики не осталось ни одного эстонца, латыша, литовца, а также представителей других народов, издревле проживавших на балтийской земле, кроме немецкого.

Первым народом, который в Прибалтике подвергся поголовному истреблению, был еврейский. В этом оккупантам активно помогали местные фашисты, демонстрировавшие свою идейную близость к нацизму и старавшиеся выслужиться перед новыми хозяевами. Отчитываясь перед своим берлинским начальством, бригаденфюрер СС Франц Вальтер Шталекер писал: «Мы заставляли местные антисемитские элементы организовывать погромы через несколько часов после захвата города». В Каунасе вооруженные банды националистов во главе с Климантисом в ночь с 25 на 26 июня 1941 года расправились более чем с 1500 евреями, подожгли и уничтожили несколько синагог и сожгли еврейский квартал, состоявший более чем из 60 домов. Шталекер писал: «В течение следующих ночей около 2300 евреев было обезврежено подобным же образом. Подобные же действия, только в меньшем масштабе, имели место по примеру Каунаса и в других районах Литвы, причем они также распространились на оставшихся в этих местах коммунистов».

М.Ю. Крысин писал, что, когда 24 июня немецкие части вступили в Каунас, «литовские повстанцы приступили к еврейским погромам с одобрения литовского военного коменданта Каунаса полковника Бобялиса, который почти ежедневно издавал антисемитские указы. 26 июня 1941 года банды националистов из группировок «Шаулю Сауюнга», «Яунои Лиетува», «Неолитуания» и других учинили первый массовый погром в пригороде Каунаса — Виллиамполе. Вооруженные погромщики врывались в квартиры по улицам Панегрю, Видурине, Юрбако и Арегалос, где жили евреи, советские активисты, сочувствующие Советам и те, чьи сыновья служили в Красной Армии, и убивали всех, кто попадался им на пути. По-видимому, «черные списки» составлялись заранее».

Расправы творились с жутким садизмом: «Раввину Салману Оссовскому отрезали голову пилой, а главе виллиампольской еврейской общины Абрахаму Гродзенскому отрезали язык и выкололи глаза. Детям разбивали головы прикладами винтовок. Людей вырезали целыми семьями в их собственных квартирах, а тех, кто пытался спастись, ловили и убивали на улицах».

М.Ю. Крысин привел строки из дневника доктора Елены Буйвидайте-Куторгене, которая писала 26 июня 1941 года о событиях в Каунасе: «Тела убитых валялись в квартирах, подъездах домов, подвалах, на лестницах, в подворотнях. Некоторые еще сжимали в руках топоры и палки, с помощью которых пытались защитить свои семьи от озверевших бандитов… Когда в Каунас 28 июня вошла передовая команда (Vorkommando) зондеркоманды «1 b», часть «работы по окончательному решению еврейского вопроса» уже была выполнена местными националистами». Погромы осуществляли два литовских отряда. Одним, численностью в 600 человек, руководил журналист Йонас Климайтис. Другим, в 200 человек, — врач доктор Зигонис.

Командир эйнзатцгруппы «А» бригаденфюрер СС Ф.В. Шталекер докладывал в Берлин: «В ходе первого погрома литовскими партизанами (так немцы называли банды своих пособников. — Авт.) было уничтожены 1500 евреев, сожжено или разрушено большое количество синагог, сожжен еврейский квартал, в котором находилось 60 домов. В последующие ночи таким же образом были обезврежены 2300 евреев. В других районах Литвы были проведены подобные акции, но в меньшем объеме, которые распространялись и на оставшихся коммунистов». Уничтожение евреев продолжалось.