Таким образом, солдаты и офицеры 29-го территориального корпуса РККА были одеты в мундиры бывшей литовской национальной армии (образца 1930 года), но с советскими знаками различия.

Выпушки приборного цвета на брюках, обшлагах и воротниках мундира, а также на фуражке, как правило, сохранялись. В пехоте он (приборный цвет) был желтый, в артиллерии — черный, в кавалерии — белый, в технических войсках — красный, в авиации — малиновый. Амуниция солдат и офицеров была немецкого образца, но литовского производства, в качестве защитного головного убора использовалась немецкая каска образца 1918 года.

Несколько отличное от пехотного было обмундирование литовской кавалерии, однако она в отличие от пехоты была включена в состав 6-го кавалерийского корпуса РККА Западного Особого военного округа (кавалерийские полки 29-го литовского и 24-го латышского территориальных корпусов в 1941 году были, видимо, переданы в состав 6-го кавкорпуса РККА ЗапОВО. — Примеч. авт.).

22 июня, с началом военных действий, в частях литовского корпуса, находившихся на отдыхе после учебных ночных стрельб, была объявлена боевая тревога.

184-я стрелковая дивизия заняла оборону по левому берегу реки Варены, имея 297-й и 262-й стрелковые полки в первом и 294-й стрелковый полк во втором эшелоне. Утром 23 июня дивизия получила приказ отходить на Вильнюс, но 24 июня мотопехота и танки немцев окружили ее в районе Валькининкай (42–45 км юго-западнее Вильнюса), подвергая части дивизии сильным ударам авиации. Прорваться из окружения на Вильнюс удалось лишь штабу дивизии, отдельным группам бойцов и двум батареям противотанкового артиллерийского дивизиона. Сказалась острая нехватка боеприпасов, особенно в артиллерии. Кроме того, лошади из артиллерийских частей по плану перевооружения были изъяты, а средства механизированной тяги к началу войны еще не были получены.

179-я стрелковая дивизия заняла оборону северо-восточнее Пабраде, перехватив дороги на Швенченеляй и Швенченис. В первом эшелоне дивизия имела 259-й и 234-й стрелковые полки, а во втором эшелоне — 215-й стрелковый полк. В ночь с 23 на 24 июня дивизия вместе со штабом корпуса начала отход под ударами авиации противника. Между Глубоким и Полоцком отходящие части столкнулись с вражескими танками и мотоциклистами. Подразделения старшего лейтенанта Вазнялиса и лейтенанта Римаса успели окопаться у дороги и вступили с ними в бой. Лейтенант Римас связкой гранат подбил немецкий танк. Одна из батарей дивизиона, которым командовал майор А. Раугале (618-й легкий артиллерийский полк), своим огнем подбила два вражеских танка. При подходе к району Полоцка части дивизии уничтожили прятавшихся в лесу немецких парашютистов.

В начале июля, получив пополнение, дивизия заняла оборону северо-западнее Невеля, но понесла большие потери и отошла к Великим Лукам. В боях погибли командир дивизии полковник Устинов, комиссар дивизии старший батальонный комиссар Продеус и начальник штаба майор Копылов.

В конце июля дивизия, принимавшая участие в обороне Великих Лук, после ожесточенных боев с немецкими войсками снова вынуждена была начать отход вместе с другими соединениями 22-й армии Западного фронта.

В августе оставшиеся в строю бойцы и командиры литовской дивизии были направлены в различные части Красной армии.

Вильнюсское пехотное училище. 22 июня училище, находившееся в лагерях в районе Швенченеляй (65 км северо-восточнее Вильнюса), было приведено в боевую готовность. Оно состояло из двух батальонов курсантов (около 1100 человек) и роты курсантов-политруков (около 120 человек). Батальоны и небольшая часть роты курсантов-политруков под командованием начальника училища полковника Г. П. Сокурова были направлены в Вильнюс для обороны города и борьбы с воздушными десантами врага. 23 июня оба батальона заняли оборону на широком фронте на окраинах Вильнюса.

В течение дня на город совершали налеты небольшие группы люфтваффе, одну из которых курсанты подбили пулеметным огнем.

В 21.00 был получен приказ оставить занимаемые рубежи и отходить по дороге через Ошмяны на Минск.

Прикрывавшая отход курсантская рота старшего лейтенанта Кугренаса отбила южнее Вильнюса две атаки немцев, уничтожив 50 солдат и 6 мотоциклов, затем оторвалась от противника и догнала главные силы. При отражении атак германских мотоциклистов большую отвагу проявил курсант Рагаускас. Раненый, он огнем пулемета уничтожил несколько десятков солдат вермахта.

24 июня в районе Медники (25 км юго-восточнее Вильнюса) вражеские парашютисты пытались преградить путь отходящим подразделениям училища. Две роты под командованием капитана Валюлиса с ходу атаковали противника и уничтожили около взвода немцев.

С 25 июня по 2 июля подразделения училища продолжали с боями отходить от одного рубежа к другому. Обороняясь у Ошмян, они нанесли большие потери противнику. При этом отличился курсант Дубинскас, командовавший боевым охранением. В районе Солы (15 км северо-западнее Сморгони) было уничтожено четыре танка и до взвода пехоты противника. На подступах к Сморгони авангард училища атаковали десять немецких танков при поддержке артиллерийского и пулеметного огня. Группа курсантов, которой командовал впоследствии погибший капитан Валюлис, связками ручных гранат подорвала 3 танка. В этих боях отважно сражались курсанты Талалас, Мешка, Величка, Рудженис, Чеплинскас, Решиис и другие. С утра 28 июня пехота и танки противника начали окружать подразделения училища, оборонявшиеся на окраинах Сморгони. Отдельные группы курсантов с боями вышли из окружения и, обходя Молодечно, ко 2 июля соединились в районе Лепеля. Группа под командованием курсанта Виленскиса прикрывала мосты в районе Молодечно, обеспечивая отход главных сил училища. При этом особенно отличились курсанты Гоштаутас, Сайфиуллин, Чимбадзе, Сипавичус, Янчулис, Круглов.

В Лепеле подразделения курсантов и Лепельское минометно-артиллерийское училище были сведены в Лепельскую оперативную группу, занявшую оборону южнее города. В ходе оборонительных боев было успешно отражено несколько сильных атак пехоты и танков противника.

Позднее подразделения училища участвовали в оборонительных боях на реке Западная Двина у Бешенковичей и на западной окраине Витебска.

К 25 июля личный состав курсантских батальонов (около 20 командиров и 500 курсантов) был направлен в Новокузнецк Кемеровской области, где с 15 августа училище начало занятия.

Оставшиеся в лагерях Швенченеляй под командованием политрука А. Мичуды рота курсантов-политруков и другие подразделения училища, уничтожив склады с оружием и боеприпасами, 25 июня присоединились к отступающей 179-й стрелковой дивизии 29-го литовского стрелкового корпуса. Курсанты роты политруков были распределены по частям дивизии на должностях политруков рот и командиров взводов и участвовали в боях в районах Пустошки и Великих Лук.