Интеграция Прибалтики в советское общество осуществлялась и на уровне системы управления. С одной стороны, по характеру своих политических, государственных и общественных институтов, их связей с центральными всесоюзными учреждениями и организациями прибалтийские республики ничем не отличались от других союзных республик. Центральные комитеты, органы коммунистических партий и Верховные советы прибалтийских республик были органичной частью всесоюзной политической и государственной системы власти. Поэтому руководители ЦК Компартий Эстонии, Латвии и Литвы неизменно избирались в высшие органы съездов Коммунистической партии Советского Союза (президиумы, секретариаты, редакционные и мандатные комиссии), а затем в составы ЦК КПСС. Председатели же Президиумов Верховного Совета СССР были заместителями Председателя Президиума Верховного Совета СССР. Республиканские министерства и ведомства подчинялись всесоюзным министерствам и другим высшим органам власти СССР. Пятилетние и иные планы развития народного хозяйства прибалтийских республик строго соответствовали пятилетним и иным планам развития народного хозяйства СССР.

С другой стороны, можно обнаружить немало свидетельств того, что центральные власти учитывали специфику Прибалтики. Примером особого отношения к Прибалтике было предложение правительства СССР допустить в состав ООН наряду с СССР, Украинской ССР и Белорусской ССР также и Литовскую ССР, которая по количеству населения и своему удельному весу в экономике Союза заметно отставала от многих союзных республик. Бросалось в глаза и то, что в «Директивах XIX съезда ВКП(б) по пятому пятилетнему плану на 1951–1955 годы» задачи, поставленные перед экономикой Эстонии, Латвии и Литвы, были выделены особо. В своем докладе о директивах XIX съезду КПСС председатель Госплана СССР М.З. Сабуров привел сведения об успехах Эстонии, Латвии и Литвы в хозяйственном развитии в качестве единственных примеров того, как развиваются отдельные союзные республики СССР.

Материалы съездов правящей Коммунистической партии Советского Союза, регулярно проводившихся с 1952 года, позволяют увидеть как свидетельства интеграции прибалтийских республик в жизнь СССР, так и проявления особенностей в их развитии. Прежде всего докладчики и выступавшие на съезде руководители делегаций компартий прибалтийских республик подчеркивали высокие темпы развития экономики Эстонии, Латвии и Литвы. Так, в своем докладе М.З. Сабуров отметил: «Уже в итоге четвертой пятилетки продукция промышленности в Литовской ССР, в Латвийской ССР и Эстонской ССР увеличилась по сравнению с 1940 годом в 2,8 раза».

Темпы, которыми развивались три республики, были выше всесоюзных. Пятилетний план развития и восстановления народного хозяйства 1946–1950 годов Латвийская ССР выполнила в 1948 году. Среднегодовой прирост промышленности в республике составил более 45 %. Общий объем промышленного производства за пятилетку увеличился более чем в шесть раз, а уровень 1940 года был превзойден в 3 раза. Численность промышленных рабочих выросла в 2,5 раза.

В Латвии за годы пятилетки было восстановлено и построено вновь 1500 промышленных предприятий. Особенно быстро развивалась промышленность Риги. За годы первой пятилетки валовое производство в столице Латвии выросло в 7,5 раза, а число рабочих увеличилось в 4 раза. В «Истории Латвийской ССР» говорилось: «Гордостью республики стали такие рижские предприятия, как расширенный в несколько раз и реконструированный электротехнический завод ВЭФ, Рижский вагоностроительный завод, судоремонтный и суперфосфатный заводы, машиностроительный завод Министерства речного флота СССР, радиозавод имени A.C. Попова, приборостроительные заводы «Эталон» и «Гидрометприбор». Машиностроение и металлообрабатывающая промышленность стали ведущими отраслями производства Латвии. Их удельный вес в общем объеме промышленного производства составил 48 %.

Другой заметной особенностью развивавшейся промышленности прибалтийских республик являлась ее специализация на наиболее сложных видах производств, что ставило ее на передовые позиции в Союзе. Латышские историки писали: «По ряду отраслей промышленность Латвийской ССР стала выдвигаться на видное место в общесоюзном производстве, особенно в приборостроении, отчасти в области сложного машиностроения, легкой и пищевой промышленности, в производстве вагонов для электрифицированных железных дорог и в производстве электрооборудования для автомобилей… По выпуску электропоездов и автоматических телефонных станций Латвия заняла первое место, по производству электрооборудования — 2-е место среди союзных республик».

В своем выступлении на XIX съезде КПСС первый секретарь ЦК Компартии Латвии Я.Э. Калнберзин говорил: «Трудящиеся Латвии являются активными участниками величайших сооружений сталинской эпохи — гидроэлектростанций и каналов на Волге и Днепре, Аму-Дарье и на Дону. Латвийские предприятия посылают великим стройкам коммунизма крупные грейферные краны, телефонное оборудование, измерительные приборы, строительные материалы».

Об успехах своей республики в выполнении заданий послевоенной пятилетки говорил на этом же съезде первый секретарь ЦК Компартии Литвы А.Ю. Снечкус: «За годы Советской власти удельный вес промышленности в народном хозяйстве республики возрос почти в два раза и составляет сейчас 61 %. Возросла численность рабочего класса. В 1952 году промышленных рабочих имеется почти в три раза больше, чем имелось в 1940 году».

Производство электроэнергии в Литве с 1945 по 1951 год возросло в 8 раз. С 1944 по 1951 год основные фонды промышленности Литвы возросли в 2 раза. В 1947 году был введен в строй станкостроительный завод «Жальгирис», в 1948 году — электротехнический завод «Эльфа», в 1950 году — завод электросчетчиков. В «Истории Литовской ССР» сказано: «Уже в те годы были заложены основы для таких отраслей промышленности, как станкостроение, турбостроение, приборостроение, электромашиностроение, сельскохозяйственное машиностроение, цементная промышленность. Был освоен выпуск многих видов продукции, которая в годы господства буржуазии не производилась: паровые турбины, электромоторы, точные измерительные приборы, покрасочные аппараты, металлорежущие станки и другое. Высокое развитие получили отрасли, связанные с приморским положением республики, — судостроение, рыбодобыча и рыбопереработка».

Подводя итоги развития Эстонии за первую послевоенную пятилетку, первый секретарь ЦК Компартии Эстонии И.Г. Кэбин в своем выступлении на XIX съезде КПСС говорил: «Освобожденный из-под ига фашизма, эстонский народ под руководством Центрального Комитета ВКП(б) и лично товарища Сталина, при огромной помощи всего советского народа и особенно великого русского народа, в короткий срок развил свою экономику и культуру в таких масштабах, которые позволили превратить Советскую Эстонию из страны аграрной, с мелким хуторским крестьянским хозяйством, из бывшего придатка империалистических держав в республику высокоразвитой индустрии и крупного сельского хозяйства… По инициативе товарища Сталина в республике была создана мощная газосланцевая промышленность, бесперебойно снабжающая газом Ленинград… Эстонский народ за исключительно короткий срок поднял из руин такие крупнейшие предприятия текстильной промышленности, как Кренгольмская и Балтийская мануфактуры… Машиностроительная промышленность республики, оснащенная в период послевоенной пятилетки высокопроизводительной новейшей советской техникой, освоила и выпускает сложное оборудование для нефтяной, газовой и сланцевой промышленности, электродвигатели для котлов высокого давления и ряд других видов сложного оборудования».