Радиоконтрразведывательной службой была разработана английская радиосеть МИД, связывающая Лондон с корреспондентскими точками во всех странах, которые поддерживают дипломатические отношения с Великобританией.

Осуществляли контроль около 3400 советских радиостанций, принадлежащих 294 организациям, где было выявлено большое число случаев разглашения по радио сведений, составляющих государственную тайну.

Проводилось обеспечение радиоразведывательной работы партизанских связистов в период войны средствами тайнописной связи. Была проведена работа по дешифровке тайнописей, вскрытию защиты паспортов и документов иностранных государств. В это же время была проведена работа по разработке защиты ряда советских документов.

Работы по специальной технике были направлены на обеспечение оперативных разработок внутри страны и в тылу противника, а также на обеспечение контрразведывательной работы, по документам средствам тайнописи и другим видам техники для перебросок в тыл противника, а также для агентурных мероприятий внутри страны.

Усилилось значение радиоконтрразведывательной службы. Была восстановлена сеть радиостанций этой службы на освобожденной от немецких оккупантов территории, построены новые станции. Радиоконтрразведывательные подразделения получали новую звукозаписывающую, пеленгаторную и приемную аппаратуру, выпускаемую советскими заводами.

Вместе с тем было отмечено, что основная аппаратура службы радиоконтрразведки и пеленгаторных пунктов сильно износилась и морально устарела. Предлагалось усилить контроль эфира, так как радионаблюдение пропускало некоторое количество неизвестных радиостанций.

В числе других предложений обеспечения службы радиоконтрразведки современной передовой техникой предлагалось возвратить в МГБ лаборатории, которые в 1941 году были переданы со всем штатом, оборудованием и помещением в НКВД СССР.

Согласно справке 6-го отдела 2-го Управления НКГБ от 13 ноября 1945 года за годы войны контрразведкой в советском тылу были задержаны 1854 немецких агента, у которых были изъяты 376 КВ радиостанций. При этом органами НКВД были обезврежены 172 диверсионные группы, в состав которых входили 554 агента, 35 разведывательно-диверсионных групп (в составе 302 агентов противника), 109 диверсантов-одиночек, 242 разведгруппы (в которые входили 663 немецких агента) и 224 разведчика-одиночки.

21 мая 1946 года начальник Отдела «Б» МГБ Блиндерман в своей докладной записке предложил передать в Отдел «Р» Кучинскую лабораторию, которая являлась технической базой службы радиоконтрразведки. 28 мая заместитель начальника 4-го спецотдела МВД Железов в докладной записке на имя руководства органов госбезопасности поддержал предложение Блиндермана.

Быстрое развитие физико-технических наук и широкое применение за границей средств связи, прослушки и перехвата обуславливало необходимость активно развивать применение физико-технических средств для нужд советской радиоконтрразведки.

5 января 1953 года Отдел «Р» был передан в состав формируемого ГРУ МГБ. Штатная численность отдела составляла 352 человека, начальником которого до 3 ноября 1953 года был Леонид Николаевич Никитин.

5 марта того же года, после смерти Сталина, на совместном заседании Пленума ЦК КПСС, Президиума ВС и СМ СССР на базе МГБ и МВД было создано объединенное МВД СССР. Отдел ОТ МГБ был реорганизован в 5-й спецотдел, а Отдел «Р» ГРУ МГБ — 4-й спецотдел МВД СССР.

Теперь за ведение радиоконтрразведки отвечал 4-й спецотдел МВД. А аппаратурой радиоконтрразведки занималось 5-е отделение 2-го спецотдела (применения ОТ) МВД, начальником которого был назначен Григорий Иванович Заболотный.

10 февраля 1954 года Президиумом ЦК КПСС было принято решение о выделении органов госбезопасности из МВД в самостоятельное ведомство. 13 марта Указом Президиума ВС СССР был образован Комитет государственной безопасности при СМ СССР (далее — КГБ). Председателем КГБ был назначен И. А. Серов.

17 марта 1954 года 4-й спецотдел был введен в структуру КГБ, и его начальником стал П. Ф. Кузнецов. 2 июля 1959 года он вошел в состав Оперативно-технического управления (далее — ОТУ) КГБ как 4-й отдел.

Известно, что в 1962 году в рамках секретной операции «Анадырь» по доставке на Кубу баллистических ракет в группу советских контрразведчиков вошли также и специалисты радиоконтрразведки.

В результате радиоконтрразведка засекла выход в эфир агентурного передатчика в особом режиме, когда сеанс длился считанные секунды, а сообщение как бы выстреливалось. Удалось запеленговать агентурный радиопередатчик и захватить с поличным резидента ЦРУ Клемента Инклана.

В 1964 году с целью объединения усилий всех радиотехнических служб 4-й отдел (радиоконтрразведки) ОТУ был передан в состав 8-е ГУ КГБ как 11-й отдел. На протяжении 1964—72 годов службами радиоконтрразведки и радиоразведки 8-го ГУ КГБ руководил Владимир Иванович Бондаренко, будучи заместителем начальника Главка.

Согласно годового отчета 8-го ГУ КГБ в ноябре 1968 года Спецслужба КГБ (войска радиоразведки) осуществляла перехват шифрованной переписки от 2002 действующих радиостанций 115 стран мира. Подразделения радиоконтрразведки разрабатывали 24 радиоцентра органов разведки капиталистических стран, которые обеспечивали связь со 108 агентурными точками.

Было запеленговано 3 новых агентурных радиостанции во Вьетнаме. Агентурных радиосвязей с советской территории не было выявлено. Розыскными подразделениями установлены в СССР адреса 500 владельцев незарегистрированных радиостанций.

В 1973 году на базе дешифровального управления 8-го ГУ было создано новое 16-е управление (радиоэлектронной разведки) КГБ. В связи с этим отдел радиоконтрразведки был реорганизован в Службу «Р» 2-го ГУ (контрразведки) КГБ, а в 1978 году — Управление «Р» 2-го ГУ КГБ.

25 декабря 1991 года, после развала СССР и ликвидации КГБ, радиоконтрразведка была реорганизована в Управление «Р» 2-го ГУ Министерства безопасности РФ, а 12 апреля 1995 года — Управление «Р» 2-го ГУ Федеральной службы безопасности РФ (далее — ФСБ).

На протяжении всей истории СССР органы государственной безопасности и внутренних дел под воздействием внешних обстоятельств и роста объёма задач постоянно реорганизовывались, изменяли свою структуру и название. Соответственно менялась структура и название подразделений радиоконтрразведки (см. таблицу).

Исследовательские работы по вопросам технического обеспечения радиоразведки и прослушки начал проводить с 1926 года Научно-исследовательский институт связи (далее — НИИС) РККА.

В 1929 году в структуре НИИС были созданы следующие спецлаборатории:

— секретного телеграфирования отдела радиопередатчиков;

— пеленгаторная отдела радиоприёмников;