В июне 1938 года консгрукторское бюро завершило работы над планами очередной модернизации крейсеров типа «Миоко». Крейсера уже одиннадцать лег стояли в сгрою и, несмотря на многочисленные доработки, уступали своим иностранным аналогам. Поскольку государственные верфи оказались перебужены, два крейсера («Хагуро» и «Асигара») решили модернизировать на частных верфях. Вся программа модернизации получила название «Дай Ни Дзи Кайсо» («Вторая модернизация»). Подробно о ней было рассказано выше, при описании тактико-технических элементов крейсеров.

Первым па переделку встал «Хагуро». Работы на его борту начались 10 января 1939 года и завершили ее к 28 декабря того же года. Работа велась на частной верфи «Мицубиси» в Нагасаки. Вторым в док Сасебо Кайгуи Косе встал «Начи», модернизация которого шла с 15 января 1939 года по 31 марта 1940 года. 17 марта 1940 года в Сасебо провели контрольные измерения крейсера. Выяснилось, что водоизмещение его составило 12154/15840 т при осадке 5,33/6,32 м.

«Хагуро» вскоре после зачисления на службу. Большая часть бака закрыта тентом для защиты от солца.

«Хагуро» на рейде в Куре. Еще старые дымовые трубы, которые в октябре 1930 года удлинили на 2 м.

Третьим на модернизацию встал «Асигара» (верфь Йокосука Кайгун Косс), но работы начались лишь в июне 1939 года, а завершились 30 июня 1940 года. Причиной задержки стала замена пушек на крейсерах «Микума» и «Кумано», а также шедшая параллельно модернизация тяжелых крейсеров «Такао» и «Атаго». Первоначально планировалось модернизировать крейсер на частной верфи, но позже Адмиралтейство пересмотрело решение. 27 апреля 1940 года в Йокосуке провели контрольные измерения корабля. Его водоизмещение составило 12342/ 15933 т при осадке 5,40/6,35 м.

Последним модернизацию прошел «Миоко». Работы также отставали от графика, так как верфь была перегружена работой по замене пушек на крейсерах «Могами» и «Сузуя». Модернизация «Миоко» началась на верфи «Куре Кайгун Косе» 19 марта 1940 года и завершилась IX апреля 1941 года. 31 марта 1941 года в районе Укуруидзимы провели контрольные измерения. При водоизмещении 14984 т и мощности машин 132830 л.с. крейсер развил скорость 33,88 уз.

Пройдя модернизацию, 1 мая 1940 года «Начи» и «Хагуро» сформировали 5-й дивизион в составе 2-го флота. В июле-августе дивизион в составе трех крейсеров (прибавился «Асигара») участвовал в маневрах неподалеку от берегов Японии.

17 февраля 1941 года «Начи» и «Хагуро» снова направились к южным берегам Китая, выйдя из Сасебо и пройдя Окинаву, Гакао и Формозу, вернулись на базу 12 марта. С 13 по 20 марта оба крейсера стояли в доках, а затем отправились в залив Аритаке, откуда 29 марта взяли курс на острова Палау. 8-12 апреля крейсера оставались в Палау, затем 20–23 апреля провели в Йокосуке, а 26 апреля вернулись в Сасебо. Тем временем, 10 апреля флагманом 5-го дивизиона крейсеров стал «Миоко», «Асигара» после модернизации и участия в маневрах стал флагманом 2-го флота и 15-го дивизиона в китайских водах, где заменил в этой роли крейсер «Чокай». 10 октября 1940 года «Асигара» покинул Сасебо и взял курс на острова Хайнань. 16–20 декабря крейсер посетил Шанхай. В ходе французско-сиамского конфликта в январе 1941 года крейсер направился в Сайгон. 22 января он участвовал в экспедиции на юг французского Индокитая, а затем вернулся в порт Самах, лежащий на острове Хайнань. Затем крейсер зашел в Сайгон, где пробыл с 29 по 31 января 1941 года. Закончив визиты, крейсер вернулся к патрулированию вод у южного побережья Китая, оставаясь в регионе до апреля 1941 года.

«Хагуро» в 1932 году. Трубы удлинены, а между носовой рубкой и кожухом трубы установлены прожектора.

В апреле 1941 года начались первые приготовления кораблей к возможной войне. На «Начи», «Хагуро» и «Асигара» в бульбах оборудовали дополнительные топливные баки, соответствующие отсеки заполнили трубами, корабли оборудовали антимагнитными системами, а на фок-мачте оборудовали пункт пуска торпед. «Миоко» уже имел все это сделанным в ходе его модернизации. 5-й дивизион приступил к интенсивным учениям у побережья южного Китая.

В июле «Асигара» выдвинулся на юг и 12 июл‹гучаствовал в оккупации южного Индокитая. 25 июля крейсер вышел из порта Самах и с 29 июля по 11 августа пребывал в оккупированном Сайгоне, демонстрируя силу. 13 августа корабль вернулся в Самах. Проведя в порту два дня, крейсер вышел в море, курсируя у берегов южного Китая, а 23 сентября вернулся в Сасебо, где прошел полный осмотр. 10 октября крейсер придали 16- му дивизиону. Одновременно «Асигара» стал флагманом 3-го флота, на нем поднял свой флаг вице-адмирал Ибо Такахаси.

В первых днях сентября докование в Сасебо прошли остальные три крейсера, а 17 сентября они прибыли в Муродзуми. 14 октября поступил новый приказ. Корабли покинули базу и через залив Ариаке, Сукумо, Саэки и Беппу к 17 ноября прибыли в Куре. 17–23 ноября корабли пополняли запасы топлива и боеприпасов.

4 ноября было принято решение начать боевые действия против США 8 декабря 1941 года. Уже на следующее утро на корабли начали приходить приказы, содержащие задания на первый этап войны. «Миоко» (флагман контр-адмирала Такео Такаги), «Хагуро» и «Начи» были направлены на острова Палау. Два первых крейсера прибыли на место 1 декабря, тогда как третий оказался там лишь 6 декабря. 23 ноября «Начи» вышел из Куре и в тот же день прибыл в Сасебо. Проведя там три дня, крейсер вышел в море и через Макао прибыл в указанный район. «Асигара» после пополнения запасов топлива, покинул Сасебо 29 ноября и 1 декабря прибыл в Макао на Формозе (Тайвань).

«Миоко», 1932 г. В этот период крейсер использовался для быстрой переброски войск в Китай.

Действия в районе Филиппин и Голландской Ист-Индии в первые недели войны

В Макао базировались тяжелые крейсера «Асигара», «Майя», легкие крейсера «Кума», «Нака», «Натори», базы гидросамолетов «Камикава-мару» и «Санио-мару», а также шестнадцать эсминцев. Все эти корабли начали боевые действия, выполняя так называемый «план М» («М сакусен»), В их задачу входило сопровождать конвой с десантом, направлявшийся к Филиппинам. Высадка десанта началась 10 декабря в Апарри и Вигане. Несмотря на атаку пяти бомбардировщиков В-17Е из 14-го дивизиона, ни один корабль не получил повреждений. На базу тяжелые крейсера вернулись 14 декабря. Спустя пять дней они снова вышли в море, сопровождая новый конвой с десантом, который 22 декабря высадился в районе залива Лингаен. Высадив войска 14-й армии генерала Хомма, корабли вернулись на базу, не встречая по пути противодействия со стороны противника. 26 декабря «Асигара» покинул Макао и направился в Такао.