Уже в августе 1861 года Иван Дмитриевич нашел подпольную типографию, которую у себя на дому устроил некто Всеволод Костомаров. Там обнаружились распространяемые им прокламации «К молодому поколению» и газета «Великорус». Следственной комиссии III Отделения Собственной Его Императорского Величества канцелярии Костомаров дал признательные показания, что автором «Великоруса» является Чернышевский, а прокламации «К молодому поколению» — некто Николай Шелгунов.

У Следственной комиссии появились первые доказательства вины Чернышевского и Шелгунова в подрывной антигосударственной деятельности. Комиссия продолжила работу по сбору доказательств, и арест двоих революционеров-демократов оставался лишь вопросом времени.

А из III Отделения Собственной Его Императорского Величества канцелярии 19 октября 1861 года поступает запрос за № 1621 на имя Санкт-Петербургского обер-полицмейстера А. В. Паткуля: «Секретно.

Милостивый Государь Александр Владимирович.

Предполагая войти с представлением о награждении Надзирателя здешней полиции Путилина за успешное исполнение поручений, которые были на него возложены по делам III-го Отделения Собственной Его Императорского Величества Канцелярии, имею честь покорнейше просить Ваше Превосходительство, почтить меня уведомлением, не изволите ли встречать со своей стороны к тому препятствия, и если препятствия нет, то не благоугодно ли будет Вам, Милостивый Государь, доставить ко мне формулярный список о службе Путилина.

Примите уверение в моем совершенном почтении и преданности.

Граф Шувалов»[38].

Через двенадцать дней, 31 октября 1861 года, Путилин за успешное исполнение возложенных на него особых поручений был награжден орденом Святого равноапостольного князя Владимира 4-й степени. Однако узнал он о своем триумфе на секретной службе Его Величества лишь двумя месяцами позже, когда из III Отделения Собственной Его Императорского Величества канцелярии 4 декабря 1861 года за № 1869 на имя Санкт-Петербургского обер-полицмейстера поступило сообщение, подписанное еще одним бывшим полицейским начальником Ивана Дмитриевича: «Господину С.-Петербургскому Обер-Полицеимейстеру. Государь Император, по всеподданнейшему докладу Шефа Жандармов об успешном исполнении Квартальным Надзирателем С.-Петербургской городской полиции Коллежским Секретарем, Иваном Путилиным особых поручений по делам III-го Отделения Собственной Его Императорского Величества Канцелярии, Всемилостивейше соизволил пожаловать Путилина кавалером Ордена Св. Равноапостольного Князя Владимира 4-ой степени, о чем имею честь уведомить Ваше Превосходительство, долгом считая присовокупить, что я вместе с сим сообщил Канцелярии Капитула Орденов о доставлении к Вам, Милостивый Государь, орденских знаков и грамоты для вручения означенному Кавалеру.

Управляющий Отделением,

Свиты Его Величества

Генерал-Майор Потапов»[39].

Приказ Санкт-Петербургского обер-полицмейстера по Санкт-Петербургской полиции от 6 декабря 1861 года № 265 официально возвестил об успехах Ивана Дмитриевича: «Высочайшая награда. Государь Император, по всеподданнейшему докладу Шефа Жандармов, об успешном исполнении Квартальным Надзирателем С.-Петербургской Полиции, Коллежским Секретарем, Иваном Путилиным, особых поручений по делам III-го Отделения Собственной Его Императорского Величества Канцелярии, Всемилостивейше соизволил пожаловать его кавалером Ордена Св. Равноапостольного Князя Владимира 4-ой степени.

О таковой Высочайшей воле сообщенной мне в отношении Свиты Его Величества Генерал-Майора Потапова, от 4 сего Декабря, за № 1869, я долгом считаю объявить по С.-Петербургской Полиции.

Подписал:

С.-Петербургский Обер-полициймейстер,

Генерал-Адъютант Паткуль»[40].

29 сентября 1862 года приказом по Министерству внутренних дел за № 41 Иван Дмитриевич был причислен к этому ведомству с откомандированием в распоряжение Санкт-Петербургского военного генерал-губернатора.

Надо отметить, что авторитет Путилина к тому времени был настолько высок, что ему поручали расследование наиболее сложных правонарушений в сфере экономики. В январе 1863 года его командировали в распоряжение высочайше утвержденной под председательством статс-секретаря князя Голицына следственной комиссии, где знаменитый сыщик находился по июнь месяц того же года. Указанная следственная комиссия занималась делом о злоупотреблениях в изготовлении и торговле золотыми и серебряными вещами.

За выслугу лет приказом по Министерству внутренних дел № 9 от 20 февраля 1863 года Путилина произвели в очередной чин — титулярного советника со старшинством с 31 октября 1862 года.

4 апреля 1866 года на императора Александра II, который совершал прогулку у ворот Летнего сада, было совершено покушение: революционер-террорист Дмитрий Каракозов совершил попытку убийства царя, однако находившийся неподалеку шапочных дел мастер Осип Комиссаров в момент производства террористом выстрела оттолкнул его руку, в результате чего Каракозов промахнулся.

Террорист был задержан на месте преступления, арестован и заключен в Петропавловскую крепость, а 3 сентября 1866 года по приговору Высшего уголовного суда казнен. В тот же день Осип Иванович Комиссаров за свой мужественный поступок был удостоен императором Александром II ордена Святого Владимира 4-й степени и возведен в потомственное дворянство.

Покушение на Александра II показало, что полицейскую службу в Санкт-Петербурге необходимо серьезно улучшить, а саму полицию должен возглавить преданный и ответственный офицер, хороший организатор.

На должность Санкт-Петербургского обер-полицмейстера именным указом от 17 апреля 1866 года император Александр II назначил генерал-майора Федора Федоровича Трепова, бывшего начальника 3-го округа Корпуса жандармов, генерал-полицмейстера в Царстве Польском, ранее более семи лет командовавшего Жандармским полком.

Трепов был решительным, храбрым и твердым в реализации своих замыслов кавалерийским офицером, неоднократно отличившимся в действиях против польских мятежников. Ознакомившись с работой городской полиции, он признал положение дел в Санкт-Петербургской полиции неудовлетворительным и тотчас же приступил к преобразованию столичного охранного ведомства.

По мнению нового главы полиции, существенный пробел в организации до 1866 года составляло отсутствие особой части, целью которой являлось производство расследований для раскрытия преступлений и изыскания общих мер к их предупреждению и пресечению. Ранее эти обязанности лежали на чинах наружной полиции, которая, неся на себе всю тяжесть рутинной службы, не имела ни средств, ни возможности добиться успеха в этой области.