Присоединение стран Балтии, а затем Бессарабии, воссоединенной с левобережной Молдавией, повлекло за собой вереницу арестов и депортаций «социально-опасных» и «антисоветских элементов» вместе с семьями. Согласно плану мероприятий «по этапированию, расселению и трудоустройству», следовало депортировать в качестве «ссыльно-переселенцев» в указанные выше районы около 13 тысячи глав семей и 40 тысяч членов семей [45].

Для наведения должного порядка в стране правительство провозгласило ряд суровых мер, согласно которым, простые нарушения трудовой дисциплины приравнивались к преступлениям. По закону, введенному указом от 26 июня 1940 года, предусматривалось наказание за самовольный уход с работы вплоть до четырёх месяцев тюрьмы, за прогул приговаривали к исправительно-трудовым работам на срок от одного до шести месяцев с удержанием четверти зарплаты. В целях борьбы с текучестью рабочей силы запрещалось менять место работы по собственному желанию. Суды оказались завалены такими делами, которые полагалось рассматривать в течение пяти дней, а органы внутренних дел — исполнением мер наказания. Только за первые девять месяцев по этому закону осудили два с половиной миллиона человек.

Затем в силу вступили два других строгих указа: об ответственности за выпуск недоброкачественной продукции (10 июля 1940 года) и об уголовной ответственности за мелкие кражи на производстве и за хулиганство (10 августа 1940 года). Первый указ особых последствий не имел — качество советской продукции оставляло желать лучшего. А вот по второму указу, предусматривавшему год тюрьмы, пострадали очень многие [44].

С 3 февраля 1941 года у руководства Наркомата внутренних дел, и особенно у кадровиков, возникла серьёзная озабоченность в связи с тем, что Сталин И.В. решил разукрупнить это ведомство, создав на базе Главного управления государственной безопасности (ГУГБ) самостоятельный наркомат. О действительных причинах такого деления (тем более что с началом войны оно было ликвидировано) остаётся пока что только догадываться. Одни источники говорят о документах, в которых нарком Берия Л.П. неоднократно обращался к Сталину И.С. с письмами, в которых просил в связи «с непомерно возросшим объёмом работ и его разноплановостью» разделить ведомство на две составляющие, сделав органы внутренних дел и государственной безопасности самостоятельными единицами. Другие исследователи считают, что таким действием Сталин И.В. стремился несколько ослабить позиции своего энергичного соратника, действительно способного «подмять под себя» многие, в том числе и напрямую не касавшиеся его, государственные проблемы.

Автором высказывалось собственное мнение о том, что, поскольку товарищ Сталин И.В. ничего не делал непродуманно, без далеко видимых целей, то вопрос о преобразовании Наркомата внутренних дел надо рассматривать с позиций целенаправленной подготовки вождём народов Красной армии и всей Страны Советов к предстоявшему в будущем широкомасштабному «освободительному походу» в Европу. Естественно, что с предполагавшимся стремительным продвижением советских войск на территорию сопредельных государств функции двух «дружественных» наркоматов становились совершенно различными. Органы государственной безопасности должны были оперативно распространять свою специфическую деятельность на «освобождённые страны» непосредственно сразу после вхождения туда передовых воинских частей. Именно с этой целью Особый отдел (ОО) Главного управления госбезопасности НКВД СССР был расформирован, а вместо него созданы и им переданы функции указанного ОО: 3-е управление Наркомата обороны СССР и Наркомата военно‑морского флота и 3‑й отдел НКВД СССР по оперативной работе в войсках НКВД.

В новой, объявленной 26 февраля 1941 года, структуре НКВД СССР имелись четыре типа главков, управлений и отделов. Одни обеспечивали чисто внутренние дела государства, без которых невозможно обойтись: милиция, пожарная охрана, местная противовоздушная оборона, тюрьмы, архивы и прочее. Другие за счёт труда заключённых, являвшихся важной производительной силой социализма, создавали прочный тыл и управляли (помимо собственно ГУЛАГа) лагерями железнодорожного строительства, гидростроя, горно‑металлургических предприятий, промстроя, топливной и лесной промышленности, а также лагерями по строительству Куйбышевских заводов, сверхсекретного подземного командного пункта для правительства в Жигулёвских кручах, различных объектов на Дальнем Севере и шоссейных дорог по всей стране. Сюда же следует отнести Управление по делам военнопленных и интернированных, которых ещё не было, за исключением, может, поляков и финнов, но мощный поток коих предполагался с началом наступательных боевых действий. К этим подразделениям необходимо прибавить и чуть позднее созданные Главное управление аэродромного строительства, подготавливавшее взлётно-посадочные полосы для военно-воздушных сил Красной армии, и Управление лагерей по строительству предприятий чёрной металлургии. К третьему типу относились подразделения обеспечения собственной работы наркомата: Административно-хозяйственное управление (АХУ), отдел кадров, финансово-плановый, контрольно-инспекторский, секретариат и др.

Но наиболее мощными представлялись главки, управления и отделы, сведенные нами в четвёртую группу, которую обобщённо назовём войска НКВД. Сюда входили (в порядке их объявления): Главное управление погранвойск (к июню 1941 года снимавшихся со своих рубежей и передававших границу полевым воинским частям); Главное управление войск НКВД по охране железнодорожных сооружений (станций, мостов, тоннелей и др. как на своей, так и на занимаемой наступающей армией территории) и особо важных предприятий промышленности (собственных и в освобождённых странах); Управление оперативных войск (для подавления сопротивления противника в тылу стремительно идущей вперёд Красной армии); Управление конвойных войск (для препровождения сдавшегося противника в лагеря военнопленных); Управление агитации и пропаганды войск НКВД (для моральной поддержки и обеспечения правильного понимания военнослужащими внутренних войск политики партии и правительства); Управление военного снабжения войск НКВД (без снабжения какая же армия обойдётся); Военно-строительный отдел (для восстановления разрушенных при ведении боевых действий и возведения новых сооружений, необходимых войскам НКВД). Оперативное решение в войсковых подразделениях вопросов, относившихся к государственной безопасности, возлагалось на упоминавшийся выше 3‑й отдел НКВД. В своей совокупности эти мощные войска должны были обеспечивать поддержание надлежащего порядка в тылу наступавшей Красной армии.

Всё логично, глубоко продумано и материально обеспечено. Произведенное кардинальное преобразование строго подчинено решению одной главной задачи — оперативному и фундаментальному освоению предполагавшихся к освобождению западных стран [1].

После произведённого преобразования в штатах центральных аппаратов этих двух ведомств в то время состояло: в НКВД — 10000 человек, а в НКГБ — чуть больше 11000 сотрудников.

Поскольку разделение Наркоматов госбезопасности и внутренних дел произошло вроде бы всерьёз и надолго, Отделы кадров совместно с тяжёлой партийно-административной бюрократической машиной начали добросовестно отрабатывать долгий процесс согласования и назначения работников на должности. Тысячи и тысячи строго и совершенно секретных деловых бумаг — представлений, характеристик, заключений, писем, запросов, выписок из протоколов и прочих иных — появились на свет и стали настойчиво ходить по учреждениям и кабинетам. Самые значимые из них огромным потоком со всех сторон шли в Москву, в Центральный Комитет коммунистической партии (большевиков) для обязательного согласования и утверждения.