Вдоль южной кромки пустыни, в месте соприкосновения с горами, расстилаются обширные луга, главным образом у подножия холмов и на нижних склонах гор, где дожди бывают чаще, чем в пустыне. Выше появляются зоны лиственных и хвойных лесов. К лиственным относятся и фруктовые деревья: яблони, персиковые и абрикосовые деревья, как и деревья, дающие грецкие орехи, фисташки, миндаль. На верхних склонах гор и в долинах встречаются альпийские луга, имеющие большое значение для выпаса скота. Уникальным типом растительности, произрастающей вдоль русел рек Сырдарьи, Амударьи, Или, Чу и Сарысу, является toqäy – густые заросли камыша, тополей, лоха узколистного, ивы, тамариска и других растений, особенно в районах частого половодья. Такая растительность характерна для берегов Амударьи. Здесь обитают кабаны, камышовая кошка и фазан. В районах toqäy Амударьи, низовьев Пянджа и Вахша можно встретить тигров.

Растительность и особенности почв тесно взаимосвязаны. В целом почвенные зоны соответствуют основным растительным зонам. Почвы Северного Казахстана имеют переходный характер – от чернозема вдоль северной границы к каштановым почвам в центре. Они содержат богатый слой гумуса и благоприятную структуру для удержания влаги и таким образом великолепно служат сельскохозяйственным целям. Не почвы, а нехватка регулярных осадков сделали сельское хозяйство рискованным предприятием в регионе. На сбор урожая влияет не только скудость дождей, долгий сухой сезон может осушить поверхность почвы и привести к последующей эрозии из-за характерных сильных ветров. Большая часть Туранской низменности к югу от травянистых равнин покрыта бурой и серо-бурой пустынной почвой, ни одна из которых не располагает к земледелию, особенно когда сочетается с нехваткой воды. Однако у горной кромки картина меняется. Здесь сероземы, которые образовались из лежащего в их основе лёсса. Зона серозема совпадает с лугами вдоль подножия холмов и на нижних склонах гор, где почва содержит мало гумуса, который развился из редкого травяного покрова. Сероземы богаты кальцием и образуют благоприятные почвы для сельского хозяйства.

Хотя эти почвы способны дать хороший урожай, они быстро истощаются, если в них не вносить регулярно удобрения, а перед тем, как стали применяться химические удобрения, в почву добавляли тину и ил из каналов, а также размельченные куски стен жилищ из лёсса. Навоз, смешанный с соломой, использовался только как топливо (по-узбекски: chälmä). Земледельцу следует быть весьма осторожным в орошении этой земли, богатой щелочными солями. Ведь слишком много воды и недостаточный дренаж вызовут подъем солей с нижнего яруса почвы на поверхность, где они образуют белый соляной слой. В экстремальных условиях это может привести к образованию солончаков (по-узбекски: shor tupraq или shorkhaq). На таком солончаке не прорастет ничего, кроме поташника. В других районах такие солончаки образуются в естественных условиях.

Хотя единственным эффективным средством от образования солончаков является хорошая дренажная система, эти просоленные почвы могут быть восстановлены мощной и повторяющейся подачей воды, которая вымывает щелочь в дренажные канавы. Если эта вода не будет унесена, произойдет промежуточное засоление и образуются солонцеватые почвы, где их нижний ярус затвердевает в виде столбцов, непроницаемых для воды. Такие почвы непригодны для выращивания растений, кроме полыни горькой и некоторых трав, главным образом из-за накопления натриевых солей. Солонцеватые почвы занимают широкие пространства казахских равнин. В районах солончаков образуется промежуточный тип почвы между солончаками и солонцами, известный как takyr или shor, похожий на плайя на американском юго-западе. Такиры имеют вид сухих озер и лишены растительности. Слой соли лежит непосредственно под поверхностью земли. Весной такиры часто затопляет дождевая вода, и жители нередко спускают ее в колодцы, перед тем как поверхность такиров высохнет. Такиры встречаются главным образом в туркменской пустыне и к востоку от Аральского моря. Почвы горных районов малопригодны для сельского хозяйства, за исключением долин, богатых сероземом, таких как Фергана, часть Нарына, район Фрунзе и склоны гор к югу от Душанбе.

В регионе имеют большое значение определенные экзогенные факторы, влияющие на образ жизни его обитателей, на то, что они едят, как одеваются и обеспечивают себя жильем. Наиболее важным из этих факторов является нехватка воды, древесины для отопления и использования в качестве строительного материала, а также резкое отграничение равнин и пустынной низменности от горных районов. Сочетание этих факторов сыграло определенную роль в разделении экономической деятельности на две главные сферы: оседлое земледелие и кочевое скотоводство. Рассматривая эти сферы деятельности, заметим, что Узбекистан располагает достаточно большой территорией, пригодной для оседлого земледелия. Однако значительная часть страны пока не может использоваться в интересах земледелия. Эта территория представляет собой чол, или безводную равнину и пустыню. Внутри чола единственная характерная зона – это toqäyzar вдоль рек, которая помимо растительности toqäy также включает несколько оазисов. Чол, таким образом, не является зоной оседлого земледелия, за исключением отдельных мест, где имеется вода. Однако эта территория дает достаточно растительности для выпаса скота, а разведение каракулевых овец имеет большое экономическое значение. Здесь также добывается древесина саксаула.

Ближе к горам располагается ädir, холмистая территория или горные склоны, такие как у узбекского подножья Тянь-Шаня, возвышающегося с уровня 2 тыс. футов до 5 тыс. Это часть зоны сероземов с травяным покровом, которая описана выше. Она образует единственный регион в Узбекистане, пригодный для неорошаемого земледелия. Этот вид земледелия называется lälmirkarlik или bäharikarlik (от узбекского слова bähar – весна), а у русских – богарное земледелие. Такое земледелие возможно в этом регионе потому, что на возвышенности выпадает большее количество дождевых осадков, чем на равнине. Но даже в этих условиях можно рассчитывать на успех лишь в выращивании зерновых, главным образом пшеницы и ячменя. Адир фактически более пригоден для выпаса скота и является потенциальным источником высококачественного сена, особенно заготовленного весной. Более высокие склоны гор называются по-узбекски tagh (горы). Они не играют в жизни узбеков большой роли, разве как для заготовки древесины из горных лесов и таких растений, как kiyik ot (буквально трава для антилоп) – источник получения эфирного масла целебного свойства. Более важными представляются горные луга над линией лесов, yäylawlär (джайляу) или летние пастбища, хотя они в Узбекистане значат меньше, чем jailoolor в Кыргызстане, куда ежегодно отгоняют скот на выпас.

Ни одна из вышеупомянутых территорий не пригодна для оседлого земледелия в полной мере. Для этого необходимы постоянное и надежное снабжение водой и плодородная почва. Такое сочетание имеет место в зонах сероземов, соседствующих с реками, которые питают горные снега. Именно в этих условиях развивалось орошаемое (по-таджикски: ābikārī; по-узбекски: suwli) или осеннее (по-таджикски: tiramāhī) земледелие в густонаселенных оазисах или wahälär в Ферганской долине и районе Ташкента, в районах Зеравшана и Кашкадарьи, а также на территории к югу от Душанбе. Другая группа внушительных оазисов располагается в районах Хивы, Ургенча и к югу от Нукуса в верховьях Амударьи, где большое количество плодородного речного ила регулярно вносится в верхний слой почвы. Наконец, имеются важные оазисы Южного Туркменистана, в районе Мары на Мургабе, Теджена на одноименной реке, и отдельные оазисы вдоль кромки Копетдага, у подножия гор. Почвы оазисов Мары и Теджена плодородны, и это в сочетании с ясной, постоянно солнечной погодой делает их важными районами производства высококачественного хлопка.