За вторым двором храм почти сравнивается с уровнем земли (илл. XXXV, 1). Фундамент стен и цоколей колонн показывает, что в гипостильном зале (I) было двадцать четыре колонны и, вероятно, высокий неф с окнами наверху, как в Рамессеуме. Два вестибюля, как и святая святых, имели колонны. Одна из комнат, на юге от святая святых, до сих пор сохранила крышу, украшенную изображениями созвездий – возможно, здесь изображен гороскоп.

На южной стороне гипостильного зала есть выходы в семь комнат, где хранились сокровища храма. Надписи и сцены показывают огромные богатства жрецов, которыми одаривал их победоносный и благочестивый фараон: «Говорит Рамсес своему отцу Амону-Ра, царю богов: «Возьми золото и серебро, как прибрежный песок, я достаю их тебе мерой. Приношу тебе ляпис-лазурь, бирюзу, и все драгоценные камни в сундуках, и чистое золото». Другая надпись говорит: «Приношу тебе серебро, золото, медь, царский лен, благовония Пунта; наполняю твою сокровищницу всеми драгоценными камнями, которые озарят твою красоту во веки веков».

Снаружи храм покрыт рельефами и надписями. На первом пилоне, в той его части, которая выходит за храмовую стену, изображен царь в колеснице во время охоты на диких ослов, горных коз и диких быков. На южной стене значится список праздников, ежегодно отмечаемых в храме. Сохранилась запись только о пяти месяцах, и она сообщает, что в среднем один праздник приходился на каждые три дня. Главным праздником была годовщина коронации; первоначально она не считалась большим событием, но позднее Рамсес добился того, что празднества продолжались в течение двадцати дней.

На западной стене изображены подробности суданской кампании с длинными рядами плененных негров, а эпизоды первой ливийской войны продолжаются до северной стены, где оканчиваются сценой, в которой фараон наблюдает за подсчетом рук, отрубленных у мертвых тел его врагов. Так как суданская кампания занимает лишь часть стены, остальное место заполнено эпизодами из сирийской войны, включая знаменитую битву на море. Все передано с подробностями и большим одухотворением; египетские корабли можно отличить от вражеских по изображению на носу головы льва. Дальше на стене и пилонах идут сцены из сирийского и ливийского походов.

В христианские времена второй двор использовался как церковь (илл. XXXVI, 1). Двор слишком велик, чтобы иметь крышу, поэтому на нем поставили небольшие колонны и накрыли кровлей более узкое пространство. В восточном конце установили алтарь, при этом сбив или замазав штукатуркой фигуры и надписи старой религии. Маленькие помещения на западе стали комнатами ризничих и домами священников, именно в одном из них Уилкинсон нашел «один из больших позолоченных крестов, которые украшали священническое облачение». Все эти христианские постройки недавно были снесены, и сейчас двор находится в том же состоянии, в каком его получили христиане. Ранние христиане в значительной степени виновны в уничтожении древних надписей и произведений искусства, но ими, по крайней мере, двигало религиозное рвение. Но что сказать о современных христианах, которые, обязавшись хранить следы прошлого, бездумно истребляют остатки того, что их не интересовало? Современные псевдоархеологи «отчистили» немало древних храмов от так называемых помех, уничтожив их так, что они безвозвратно исчезли в Море Времени.

В Мединет-Абу, как и в Карнаке, одна ограда окружает комплекс, состоящий из созданных в разное время храмов. Самый древний из них был построен в период XVIII династии, Большой храм принадлежит XX династии, а святилища цариц относятся к XXV и XVI династиям.

Храм XVIII династии был заложен Аменхотепом I. Он ориентирован скорее на северо-запад и окружен стеной, фрагмент которой Рамсес III сделал частью большой кирпичной ограды своего храма. Старая кладка осталась только на севере и западе (J). Это храм для проведения процессий, но, так как Аменхотеп конечно же почитался богом, здание могло служить также его заупокойным храмом. Пять правителей XVIII династии занимались строительством этого святого места: Аменхотеп I, Хатшепсут и три Тутмоса. Храм действовал и перестраивался вплоть до XX династии, когда он пришел в упадок, а затем его восстановили и частично перестроили фараоны Шабака и Тахарка; Птолемеи и римляне также дополнили его пристройками и восстановили некоторые разрушенные фрагменты.

Передний двор (К) довольно велик по сравнению с остальным зданием; входная дверь, расположенная на оси храма, отмечена именем Антония Пия, а в северном конце двора стоит колоннада (L), воздвигнутая при Птолемеях, но перестроенная тем же императором и также отмеченная его именем. За колоннадой стоит пилон Птолемеев, он любопытен тем, что возведен исключительно как архитектурный элемент; это всего лишь оболочка, так как стена со стороны храма так и не была построена.

Пройдя через пилон, можно попасть в небольшой двор (М); он часто называется двором Нектанеба, но датируется XXV династией. Нектанеб последовал примеру многих египетских фараонов и, стерев имя предыдущего царя, заменил его своим собственным. Двор довольно мал, это немногим больше, чем расширенная колоннада с ажурными простенками между колоннами. Тахарка украсил стены надписями, а Нектанеб присвоил двор себе, изобразив в нем сцены, и сделал свои надписи, повествующие о строительстве двора и его посвящении богам по завершении строительства.

В дальнем конце двора находится пилон с именами Шабаки и Тахарки; он ведет в другой двор (N), где стоял ряд из девяти колонн по обеим сторонам. Вероятно, это был гипостильный зал первого храма, в таком случае он принадлежит XVIII династии, хотя был восстановлен или перестроен позднее. Гранитная дверь справа датируется XXVI династией, и надпись на ней сообщает звучное название храма: Великолепный трон Амона-Ра. Ахорис, фараон XXIX династии, по всей видимости, восстановил зал. Он был одним из местных правителей, отложившихся от персов и тем самым проложивших дорогу для воцарения последней из местных династий.

Дверь на оси зала ведет в галерею с колоннами, окружающую святая святых. Колонны имеют квадратное сечение и соединены ажурными перегородками: такие перегородки здесь использованы впервые. Так как галерея относится ко времени Тутмоса III, возможно, что перегородки обязаны своим появлением влиянию архитектуры тех стран, где солнечный свет не столь жесток, как в Египте. Вероятно, ажурные экраны появились в результате отказа от внешней стены храма, чье место заняли колонны, но, так как египетская религия была религией таинств, внутренний двор нужно было скрыть от общих глаз. Низкая ажурная стена чуть выше человеческого роста отлично справлялась с этой задачей, в одно и то же время пропуская свет и воздух и не портя общего впечатления (илл. XXXVII, 1).

Устройство святая святых (О) заставляет предположить, что назначение ее состояло, прежде всего, в проведении процессии, а надписи говорят, что храм был посвящен Амону. Птолемей IX (Эвергет II) восстановил святая святых в обычном для Птолемеев стиле. Стены святая святых с внешней стороны также украшены сверху донизу.

За святая святых находятся несколько молелен, покрытых рельефами на религиозные темы. Имена Тутмоса I и Тутмоса II там без разбору вырезаны поверх имени Хатшепсут.