Вознесенский в реальности был виноват, что Госплан, исходя из разного числа рабочих дней, занизил планы промышленного производства на первый квартал 1949 года по сравнению с четвертым кварталом 1948 года. «Самоуправство» Вознесенского, «хитрость» в отношении Совета министров, «преступные факты» подгона цифр и «культивирование в Госплане непартийных нравов», «факты обмана Правительства» — все это явилось основанием для увольнения Вознесенского из Госплана. Постановление Совмина СССР «О Госплане СССР» вышло 5 марта 1949 года. Всего из Госплана было уволено 300 человек.

Председателем Госплана назначили М. З. Сабурова, человека из соперничающей группировки Маленкова. Он родился в Донбассе в 1900 году, окончил Московский механико-машиностроительный институт им. Н. Э. Баумана, работал главным технологом на Новокраматорском заводе тяжелого машиностроения, в Наркомате машиностроения, в Госплане, в 1941–1942 годах был председателем Госплана, затем — заместителем председателя СНК СССР.

Сабуров, как и М. Г. Первухин (родился в 1904 году; нарком электростанций и электропромышленности; зампредседателя СНК СССР), были опорной фигурой в кадровой системе Маленкова.

7 марта 1949 года Вознесенскому был дан месячный отпуск «для лечения». Однако это не было концом, Сталин еще не принял в его отношении никакого решения. Более того, вскоре он пригласил Вознесенского к себе на дачу и в присутствии всех членов Политбюро поднял за него тост: «Сегодня мы прощаемся с нашим дорогим соратником и другом Николаем Алексеевичем Вознесенским. Он совершил ошибку, мимо которой мы пройти не можем. Но мы знаем его выдающиеся способности и качества руководителя, и я уверен, что скоро он вернется в наше руководящее ядро. За здоровье нашего друга и товарища Николая Алексеевича Вознесенского!» (Вознесенский Л. А. Истины ради. М., 2002. С. 140).

Вознесенский был выведен из Политбюро и стал ждать нового назначения. Через месяц Сталин пригласил его на одно заседание, но это была их последняя встреча. Хотя Сталин не раз говорил Маленкову, что пора найти Вознесенскому новую работу, дело все время затягивалось.

Направленный из ЦК в Госплан уполномоченный ЦК Е. Е. Андреев посылает Маленкову и Пономаренко записку о том, что обнаружена пропажа многих секретных документов (за пять лет исчезло 236 секретных и совершенно секретных документов). Их перечень мог привести Сталина в шок. (Тематически они касались расположения советских предприятий за рубежом, пятилетних планов, производства военной техники, угля, черных и цветных металлов, нефти и т. д.)

В конце февраля, по решению Политбюро, было сформировано несколько инспекторских групп КПК и направлены в Ленинград вместе с большой группой следователей по особо важным делам МГБ СССР.

Проверки личных дел руководящих ленинградских работников выявили множество фактов нарушения порядка работы с кадрами. Выяснилось, что некоторые люди были назначены на высокие руководящие хозяйственные должности не имея для этого никаких оснований. По линии МГБ шла проверка допуска этих людей к секретным материалам и работе с грифованными документами. В первую очередь проверка коснулась личных дел высшего руководства. И здесь, в личном деле второго секретаря горкома Я. Ф. Капустина, обнаружилась подозрительная зацепка. В учетной партийной карточке Капустина значился строгий выговор за аморальное поведение в тот период зарубежной командировки. В 1935–1936 годах он как инженер находился на двухгодичной стажировке в Англии на заводе фирмы «Метрополитен-Виккерс». На ней была пометка A. A. Жданова, однако сопроводительных документов нигде не было обнаружено. «Аморальное поведение» — это интимные отношения с переводчицей-англичанкой и скандал, устроенный ее мужем, когда он, неожиданно вернувшись домой, застал любовников. Капустин оказался в полицейском участке, откуда его «вытащили» сотрудники советского торгпредства. Затем последовало разбирательство в партийной организации торгпредства, строгий выговор Капустину, и дело тихо замяли. Эта информация была доложена Жданову в 1939 году и сочтена им недостойной внимания. Все компрометирующие Капустина материалы оперативного учета были уничтожены в 1945 году по распоряжению начальника Ленинградского УНКВД П. Н. Кубаткина, поскольку согласно инструкции запрещалось собирать документы подобного рода на партийных работников такого ранга. В 1949 году дело всплыло. Теперь это решение было сочтено попыткой скрыть шпионскую деятельность Капустина, и по указанию Сталина Капустин и Кубаткин были арестованы.

Капустин после допросов признал факт его вербовки английской разведкой. Было ли это на самом деле? Не исключалось, что неожиданное появление оскорбленного мужа в минуту его свидания было частью вербовочной операции. Во всяком случае, это старый прием многих контрразведок. В донесении от 1 августа 1949 года Абакумов сообщил Сталину, что существуют «веские основания считать Капустина агентом Британской разведки».

Капустин на первых допросах начал давать показания, что до войны в Ленинграде сложилась группа во главе с Кузнецовым и Попковым, которая вынашивала идею создания Российской коммунистической партии. Позже эту идею поддержал Вознесенский, Родионов, Шумилов (главный редактор газеты «Ленинградская правда»). Они обсуждали идею перенести правительство РСФСР и ЦК РКП(б) в Ленинград, превратив его в новую столицу республики. Всего в эту группу входило более 75 партийных работников Ленинграда, включая второго секретаря Ленинградского обкома и горкома партии Турко, председателя Ленгорисполкома Лазутин, заведующую орготделом Ленинградского обкома партии Закржевскую.

Вслед за Капустиным были освобождены от постов второй секретарь обкома Г. Ф. Бадаев, председатель горисполкома П. Г. Лазутин, секретарь одного из городских райкомов М. А. Вознесенская (сестра H. A. Вознесенского), министр просвещения РСФСР A. A. Вознесенский (его брат).

В числе первых также были арестованы оказался зампредседателя Ленинградского областного совета Э. П. Бояр, секретарь Куйбышевского райкома ВКП(б) М. А. Вознесенская (сестра H. A. Вознесенского), заместитель министра Морского Флота СССР А. Д. Вербицкий, который ранее был секретарем Ленинградского горкома ВКП(б), заведующая орготделом обкома ВКП(б) Т. В. Закржевская, первый секретарь Ярославского обкома ВКП(б) И. М. Турко, который ранее был вторым секретарем Ленинградского обкома партии. 5 августа 1949 года был арестован первый секретарь Крымского обкома ВКП(б) Н. В. Соловьев, ранее работавший председателем Ленинградского облисполкома.

Кадровая экспансия ленинградцев, связанная с выдвижением A. A. Кузнецова, бросалась в глаза, т. к. были выдвинуты на руководящую работу в другие регионы сотни ленинградцев. Если учесть, что Сталин всегда подозрительно относился к различным кланам, то данный факт теперь казался подтверждающим тайный сговор. В обвинительное заключение Сталин вписал в отношении Кузнецова, что тот, «обманным путем пробравшись в ЦК ВКП(б)… повсюду насаждал своих людей — от Белоруссии до Дальнего Востока и от Севера до Крыма».

Хотя не объяснялось, что такое «обманным путем».

В сентябре в Ленинградском военном округе была проведена кадровая чистка: были сняты со своих постов командующий генерал-полковник Д. Н. Гусев, заместитель командующего по политчасти генерал-лейтенант В. Н. Богаткин, начальник политуправления генерал-майор H. H. Цветаев. Чистка также была проведена и в руководстве Черноморским флотом. Это означало, что Кремль крайне серьезно воспринял «ленинградскую» угрозу.