Колчак свою министерскую службу начал с того, что выехал на фронт.

В результате осеннего наступления Красной армии русские и чехословацкие войска белых оказались далеко отброшенными от Волги на восток. Военно-морской министр объезжал прифронтовые части, выясняя обстановку на местах.

17 ноября 1918 года Колчак вернулся с фронта в Омск. В эту же ночь произошел переворот.

Командир Сибирской казачьей дивизии полковник Волков поднял по тревоге 300 казаков и разогнал правительство Комуча, переехавшего к тому времени из Самары в Омск. В ходе переворота был лишь один раненый, да и тот – чех. Руководителей «директории» (так себя именовало правительство Комуча) выслали в Китай. Несколько десятков из администрации «директории» было расстреляно без суда и следствия. Директория пала. Спешно созванное заседание Совета министров рассмотрело вопрос о создании диктатуры. На роль диктатора были выдвинуты три кандидата: генералы Хорват и Болдырев и адмирал Колчак.

В результате недолгого обсуждения кандидатуры Болдырева и Хорвата были отвергнуты. Кандидатуре Колчака была оказана мощная поддержка со стороны присутствующих на заседании морских офицеров.

Совет министров принял постановление: верховную власть, взятую на себя после распавшейся Директории. Правительство передает в руки Александра Васильевича Колчака, именуемого впредь Верховным правителем России и Верховным главнокомандующим. Постановление приняли единогласно. После поздравлений Колчак поблагодарил Совет министров и выразил уверенность в том, «что общими дружными усилиями, вместе с нашей доблестной армией мы одолеем врага, возродим нашу матушку-Россию и восстановим в ней законность и порядок».

В конце заседания кабинет министров принял постановления о государственном перевороте и о производстве вице-адмирала Колчака в адмиралы.

В течение того же дня, 18 ноября, из Омска во все концы Сибири и Европейской России полетели сообщения с текстом постановления Совета министров: «Ввиду тяжелого положения государства и необходимости сосредоточить всю полноту верховной власти в одних руках, Совет министров постановил передать временно осуществление верховной государственной власти адмиралу Колчаку, присвоив ему наименование Верховного правителя». В тот же день было опубликовано и обращение Верховного правителя к населению:

«Всероссийское временное правительство распалось. Совет министров принял всю полноту власти и передал ее мне, Александру Колчаку. Приняв крест этой власти в исключительно трудных условиях Гражданской войны и полного расстройства государственной жизни объявляю, что я не пойду ни по пути реакции, ни по гибельному пути партийности. Главной своей целью ставлю создание боеспособной армии, победу над большевизмом и установление законности и правопорядка, дабы народ мог беспрепятственно избрать себе образ правления, который он пожелает, и осуществить великие идеи свободы, ныне провозглашаемые по всему свету. Призываю вас, граждане, к единению, к борьбе с большевизмом, к труду и жертвам.

Верховный правитель адмирал Колчак. 18 ноября 1918 года.

Город Омск»

В начале декабря омское правительство праздновало первые боевые успехи на Урале. В то же время в Сибири полыхали крестьянские восстания, организовывались партизанские республики, действовало большевистское подполье.

Как военный моряк Колчак предполагал создать военно-морские силы, тем более что в его распоряжении оказалось значительное количество морских офицеров, имеющих боевой опыт.

В течение 1918–1919 гг. были сформированы три речные боевые флотилии – Камская, Обь-Иртышская и Енисейская и два подразделения морской пехоты – Отдельная бригада морских стрелков и Морской учебный батальон.

Командиром бригады морских стрелков был назначен контр-адмирал Старк.

Во Владивостоке была сформирована Сибирская флотилия в составе нескольких миноносцев и транспортных судов, там же производилось формирование команд для Амурской флотилии, корабли которой были захвачены японцами летом 1918 г.[11]

Общее командование морскими силами Дальнего Востока было поручено другу Колчака, контр-адмиралу Тимиреву, а впоследствии, весной 1918 года, его сменил контр-адмирал Федорович.

Уже на следующий день после переворота капитан 1-го ранга Смирнов был назначен на должность управляющего Морским министерством с производством в контр-адмиралы.

С весны 1919 года он одновременно исполнял обязанности командующего Речной боевой флотилии (Камской).

Сказать, что Омск того времени был перенаселен, значит, не сказать ничего. Он был просто забит военными и гражданскими лицами «под завязку». В ресторанах и забегаловках пропивали, проедали и продавали все, в том числе и Россию-матушку.

Интересные записки оставил один из очевидцев тех событий:

«1919 год. Омск, 9 февраля

Вот уже завтра неделя как приехали в Омск. Устраивался. Катастрофически обстоит квартирный вопрос. Первые дни ночевал у Ключникова, Наташа – у Елизаветы Николаевны. Затем переехали в комнату, занятую ключниковским родственником, живущим сейчас в Томске. Послали ему телеграмму. Приедет сюда – пропали, не приедет – торжествуем: комната отличная и, по-здешнему, дешево – 350 руб. в месяц.

Ежедневно бываю в юрисконсульстве. Но уже намечается переход на новую должность, по-видимому, более интересную, хотя и значительно более трудную: Тельберг предложил место заведующего отделом печати. Принципиально согласился.

Общее политическое положение смутно, тревожно и неустойчиво. “Радости нет” – это уже во всяком случае. На глазах ухудшаются отношения с союзниками, шевелится внутренний большевизм, с другой стороны нарастает самая черная и бессмысленная военная реакция. Жизнь все время, как на вулкане. Мало у кого есть надежда победить большевиков.

Сам по себе Омск занятен, особенно по населению. Сплошь типично столичные физиономии, столичное оживление. На каждом шагу – или бывшие люди царских времен, или падучие знаменитости революционной эпохи. И грустно становится, когда смотришь на них, заброшенных злою судьбой в это сибирское захолустье: нет, увы, это не новая Россия, это не будущее. Это – отживший старый мир, и ему не торжествовать победу, грустно.

Это не авангард обновленной государственности, это арьегард уходящего в вечность прошлого. Нужно побывать в обеденные часы в зале ресторана «Россия», чтобы увидеть это живо и осязательно…

Понимаешь, осознаешь, ощущаешь все это – и все же не оторвешься от круга уходящей жизни, ибо в ней – корни и души, и тела… С ней умереть, с ней уйти… Ужели в самом деле так? Странно… Но во всяком случае, – ave vita nona, moriture te salutant…

Н.В. Устрялов

Белый Омск. Дневник колчаковца».

Мацкевич и Вологдин, как и многие моряки, прибывшие из Владивостока, сначала жили в вагонах колчаковского поезда.

Это была наиболее дисциплинированная часть, быстро нашедшая применение. Уже в декабре 1918 года Мацкевич был назначен начальником Механического отделения Морского технического управления с производством в инженер-механика, капитана 1-го ранга.