В ноябре 1993 года состоялись президентские выборы. Их выиграл Эмомали Рахмонов, фактически устранивший или распугавший всех серьезных конкурентов.

Официальное мирное соглашение было подписано только 27 июня 1997 года. К этому моменту война окончательно выродилась в вялые перестрелки банд на постапокалиптической пустоши.

Журналистка, побывавшая в те дни в Душанбе, живописала местные нравы:

В горах по-прежнему шла вялая партизанско-разбойничья война. Махмуд Худойбердыев, один из крупнейших полевых командиров, выступавших на стороне Народного фронта, затевал разнообразные авантюры аж до начала 2000-х годов, когда в конце концов погиб. Непримиримые борцы оставались и в лагере исламистов. Так, Мулло Абдулло совершал набеги на Таджикистан из Афганистана, наладил контакты с узбекскими исламистами и погиб только в 2011 году.

Российские миротворцы продолжали нести свою службу. «Голубые каски» стабилизировали обстановку и, по крайней мере, задерживали значительную часть потока наркотиков, которые везли из Афганистана. За время войны они потеряли более 300 человек погибшими и пропавшими без вести. Кроме русских военных, жертвами войны пали от 25 до 200 тысяч жителей республики. Чудовищный разброс в оценках численности жертв вызван практически полным отсутствием достоверных подсчетов. Речь может идти только о более или менее обоснованных прикидках.

Статус участников боевых действий люди, проливавшие кровь в глубинах Средней Азии, получили лишь недавно, и в целом усилия российского контингента не были оценены в мире по достоинству. Между тем если бы «вовчики» одержали победу в Таджикистане, последствия для региона были бы просто непредсказуемыми. По соседству с Таджикистаном находился практически захваченный талибами Афганистан, хаос легко мог охватить также и другие среднеазиатские республики бывшего СССР. В таком случае мир мог увидеть возрожденный по средневековым рецептам халифат на два десятилетия раньше, чем это произошло фактически. И в том, что этого не случилось, — огромная заслуга солдат и офицеров погранвойск, 201-й мотострелковой дивизии и 15-й бригады спецназначения ГРУ. Их действия просто неоценимы. Впрочем, это не первый и не последний случай, когда спасенный мир оказывается слеп и неблагодарен…

Распад СССР погрузил в хаос периферию погибшего государства, но и в столицу спокойствия не принес. После падения советской власти в стране естественным образом возникли две соперничающие группировки. Ельцин с его огромными амбициями, способностями к интригам и барским стилем поведения, конечно, не мог позволить существовать какому бы то ни было альтернативному «центру силы». Команда, собравшаяся вокруг первого президента России, имела очень четкое видение будущего и вовсе не планировала считаться с чьими-то еще представлениями о благе страны. Отметим, что для Ельцина ослабление хватки, болезни и потеря контроля над собой стали приметой чуть более позднего времени. В начале 90-х он еще был полон энергии и способен действовать жестко и решительно.

На другой стороне ринга находился Верховный Совет, избранный законодательный орган. Главой ВС РФ с июля 1991 года являлся Руслан Хасбулатов. Этот политик чеченского происхождения прочно вошел в союзную, а затем российскую элиту. Изначально он был университетским преподавателем, но в перестройку с головой ушел в политику. Хасбулатов поддержал Ельцина в 1991 году, однако теперь их пути разошлись.

Еще ближе к Ельцину до 1993 года находился другой знаковый персонаж противостояния Верховного Совета и президента — Александр Руцкой. Кадровый военный, он служил в авиации и с 1985 по 1988 год воевал в Афганистане в должности командира штурмового авиаполка, причем постоянно сам участвовал в операциях, был дважды сбит во время боевых вылетов, серьезно ранен и провел некоторое время в плену. С конца 80-х он отошел от военной службы и в 1990 году был избран народным депутатом РСФСР. Он активно поддерживал Ельцина, и весной 1991 года, когда тот выдвигался на высший пост руководства в России, Руцкой стал при нем вице-президентом. В августе 1991 года Александр Руцкой стал одним из основных организаторов победы над ГКЧП. Однако затем, в том же 1991 году начался конфликт между ним и его шефом. Беловежские соглашения вице-президент воспринял болезненно и даже выступал за арест Ельцина, Кравчука и Шушкевича. В дальнейшем его конфликт с Ельциным только усугублялся.