В этих же письмах он сообщал, что вновь назначенному члену Коллегии НКИД В. Л. Коппу поручено «работать над всеми вопросами по организации в НКИД шифровального дела». В соответствии с данными о выполненной в 1924 году работе 2-го отделения секретно-шифровальной части НКИД значится, что зашифровано было 309 408, а дешифровано 479 299 документов.

Что касается Украины, то 10 сентября 1924 года Постановлением СНК УССР на базе Шифровального бюро ГПУ УССР был образован Спецотдел. На него были возложены обязанности по управлению шифровальной работой во всех наркоматах и центральных учреждениях УССР (кроме общесоюзных), разработке и учету шифров, подбору и учету личного состава шифровальных подразделений, общему надзору за состоянием конспирации в шифровальной работе. Постановлением СНК УССР от 24 ноября 1924 года было утверждено его штатное расписание в количестве пяти человек.

28 марта 1924 года на основании приказа Революционного Военного Совета (далее — РВС) СССР № 446/96 о реорганизации Центрального аппарата наркомата по военным и морским делам (далее — НКВМД) СССР Центральный шифровальный отдел Штаба РККА был реорганизован в Шифровальный отдел при РВС СССР.

В 1925 году начальник Спецотдела ОГПУ Г. И. Бокий благодаря своим успехам в «секретной войне» сумел занять должность заместителя председателя ОГПУ. Он организовал образцовую работу по вопросам криптологии и радиоразведки. В 1926 году была введена в действие «Инструкция по ведению секретного и шифровального делопроизводства».

7 января 1925 года комиссия НКИД заслушала доклад о работе секретной части и постановила объединить секретную и шифровальную части и назвать вновь созданное подразделение секретно-шифровальной частью НКИД. Через два месяца, 7 марта 1925 года, было принято решение о ликвидации секретной части и создании вместо нее в составе шифровальной части 3-го (секретного) отделения. 9 марта 1925 года Коллегия НКИД утвердила это решение.

В этом же году нарком иностранных дел Г. П. Чичерин снова затронул вопрос о пополнении персонала шифровальщиков. 21 апреля и 8 мая 1925 года он обратился по этому вопросу в секретариат ЦК РКП(б): «Недостаточность персонала нашей шифрчасти становится уже государственной опасностью».

В конце 1925 года секретариат Коллегии НКИД начал функционировать на правах управления, секретно-шифровальная часть была переименована в секретно-шифровальный отдел, а три отделения, которые входили в его состав, переименованы в 1, 2 и 3-й подотделы соответственно.

В сентябре 1926 года названия управлений Штаба РККА стали номерными. Военное Разведывательное Управление превратилось в IV Управление Штаба РККА. Шифровальное отделение было выведено из состава 2-го (агентурного) отдела и реорганизовано в 1-ю (шифровальную) часть IV Управления, начальником которой стал Вольдемар Янович Закис (1896–1938), а его помощником — Эдуард Янович Озолин (1898–1938). Шифровальный отдел при РВС СССР был реорганизован в 2-й отдел Управления делами НКВМД и РВС СССР.

9 декабря 1927 года приказом ОГПУ № 242/96 было утверждено Положение о специальных отделениях при Полномочных представительствах (далее — ПП) ОГПУ. Эти отделения выполняли такие задачи:

— организовывали секретное и шифровальное делопроизводство во всех учреждениях, расположенных на территории ПП ОГПУ как местного, так и союзного значения;

— осуществляли контроль за порядком ведения и хранения мобилизационных и шифровальных материалов;

— вели учет лиц, которые ведали секретной перепиской в советских учреждениях;

— создавали шифры и обеспечивали ими все учреждения, расположенные на территории полномочного представительства за исключением тех, которые использовали шифр, установленный Специальным отделом ОГПУ.

В 1927 году шифровальный отдел НКИД, состоявший из трех подотделов, был реорганизован в секретно-шифровальный отдел в составе двух подотделов. На базе 3-го подотдела был образован секретный архив НКИД.

1 декабря 1929 года приказом ОГПУ № 282 в составе ОГПУ, кроме Спецотдела, было образовано еще Центральное шифровальное бюро (начальник — В. М. Колосов, он же — начальник 1-го отделения Спецотдела), ответственное за шифрованную связь.

Спецотдел в тот период состоял из таких подразделений:

— 1-е отделение — наблюдение за сохранением режима секретности во всех партийных, государственных и общественных организациях, начальник — В. М. Колосов;

— 2-е отделение — создание шифров и кодов для ОГПУ, НКВМД и НКИД, радиоперехват, начальник — Федор Григорьевич Тихомиров;

— 3-е отделение — руководство шифровальной работой в системе ОГПУ, связь с заграничными резидентурами, а также руководство лагерями ОГПУ, начальник — Федор Иванович Эйхманс, он же помощник начальника Спецотдела;

— 4-е отделение — дешифровка перехваченных документов, начальник — Александр Григорьевич Гусев (с сентября 1923-го по январь 1938 года), он же — помощник начальника Спецотдела;

— 5-е отделение — криптографическое обслуживание военного ведомства, начальник — Владимир Дмитриевич Цибизов;

— техническое отделение, начальник — Антон Дмитриевич Чурган;

— лаборатория (некоторое время именовалась 7-м отделением) — прикладная химия и графология, начальник — Евгений Евгеньевич Гопиус;

— фотографическое отделение, начальник — П. А. Алексеев.

Круг вопросов, которые изучались подразделениями, работавшими на лабораторию Гопиуса, был чрезвычайно широким: от изобретений всяческих приспособлений для радиошпионажа до исследований солнечной активности, земного магнетизма и проведения разных научных экспедиций. Здесь изучалось все, что имело любой оттенок таинственности.

Контроль технических новшеств советской криптослужбы осуществлял заместитель начальника ее оперативного отдела Ф. И. Эйхманс. Все специалисты-криптологи и радиотехники проходили по секретному внештатному расписанию. Общее количество личного состава Спецотдела составляло 189 человек.

Интересно, что начальник Спецотдела Г. И. Бокий предпринимал попытки использования для криптологической деятельности специалистов оккультных и мистических наук. Так, зимой 1924 года он привлек к работе в Спецотделе ученого-мистика Александра Васильевича Барченко (1881–1938). Основные научные интересы этого исследователя были сосредоточены в сфере изучения биоэлектрических явлений в жизни клетки, работе мозга и живом организме в целом. Свои лабораторные опыты А. В. Барченко совмещал с должностью эксперта Спецотдела по психологии и парапсихологии. В частности, им разрабатывалась методика выявления лиц, склонных к криптологической работе.

Ученый выступал и консультантом при обследовании всевозможных знахарей, шаманов, медиумов, гипнотизеров и других людей, утверждавших, что они общаются с призраками. С конца 1920-х годов Спецотдел активно использовал их в своей работе. Для проверки этих «экстрасенсов» одно из подразделений Спецотдела оборудовало «черную комнату» в здании ОГПУ по Фуркасовскому переулку, дом 1.