Незаурядной личностью была и мать нашего героя. В осаждённый французами и англичанами Севастополь юная Катенька фон Вагнер (из древнего польско-литовского рода князей Сквирских) приехала из Киева по зову сердца. Ей было тогда всего девятнадцать лет. Вопреки воле родителей, под впечатлением душевного порыва Марии Григорьевой, Екатерины Бакуниной (внучки М.И. Кутузова) и Екатерины Грибоедовой она решила стать сестрой милосердия. Хрупкая молоденькая девушка, только-только начинающая понимать жизнь, она постигала её под вой ядер и свист пуль.

Впрочем, у Екатерины фон Вагнер была и ещё одна (быть может, главная) причина её приезда в Севастополь. Дело в том, что здесь, на бастионах, сражался человек, которого она любила больше всего на свете — любимец адмирала Нахимова капитан 2-го ранга Скоробогатов. Уже в самом начале войны Скоробогатов стал известен всей России. Командуя фрегатом «Флора», он вышел победителем из боя с целым отрядом турецких пароходов. Старшим офицером на «Флоре», как мы уже знаем, был лейтенант Владимир Шмидт, с которым у Скоробогатова были самые дружеские отношения. Будучи невестой командира фрегата, Екатерина фон Вагнер была знакома и со старшим офицером, а также знала и о существовании его брата Петра.

С начала своего появления в осаждённом Севастополе, Екатерина фон Вагнер вместе с другими сёстрами милосердия трудилась в госпитале под руководством великого хирурга Н. Пирогова. В нечастые свободные минуты она встречалась со Скоробогатовым.

Влюблённые уже были помолвлены, говорят, что была даже назначена дата венчания в Петропавловской церкви, когда Скоробогатов героически погиб на Малаховом кургане при отражении самого кровавого, третьего, штурма Севастополя. В этом же отчаянном бою был тяжело ранен в бедро и молодой лейтенант Пётр Шмидт. Это было уже его третье ранение! Молодого лейтенанта привезли в госпиталь, и рыдающая по погибшему жениху сестра милосердия Екатерина фон Вагнер его выходила.

Спустя четыре года, в 1859 году, Пётр Шмидт сделал своей спасительнице предложение. Уступив чувствам Шмидта, она согласилась. Любила ли Екатерина фон Вагнер своего нового жениха, как любила она погибшего капитана 2-го ранга Скоробогатова? Кто знает?

Как бы то ни было, но мужу она стала верной женой и другом, а детям заботливой матерью. Согласитесь, что история любви юной княжны к любимцу Нахимова, героическая смерть последнего и последующее замужество девушки на возвращённом ею к жизни молодом офицере могли бы стать сюжетом приключенческо-романтического романа! Увы, сюжетом к истории семьи Шмидтов станет совсем иная история и далеко не романтическая…

5 февраля 1867 года в Одессе в семье помощника военного коменданта порта капитан-лейтенанта Шмидта родился долгожданный сын. Это был шестой ребёнок Петра и Екатерины. Предыдущие пятеро детей были девочки, да и то к моменту рождения Петра три сестры скончались в младенческом возрасте. Учитывая тот факт, что отец был флотским офицером, воспитанием будущего революционера занимались мать и старшие сёстры. Впоследствии в своём письме Зинаиде Ивановне Ризберг Пётр Петрович писал: «В милом детстве моём я видел много любви и женской ласки. Я рос среди сестёр и мамы, так как отец всегда находился в плавании».

Так как старший брат Владимир всё ещё оставался холостяком, право назвать сына фамильным именем получил младший брат. Так родившийся мальчик стал Петром. Спустя несколько лет Екатерина Шмидт родила дочь Анну. В 1876 году Пётр Петрович Шмидт был назначен губернатором города и начальником порта в Бердянске. Семья перебралась туда.

Умерла Екатерина Яковлевна 29 декабря 1877 года в возрасте всего 42 лет и была похоронена на городском кладбище. Как защитнице Севастополя, ей при погребении был отдан прощальный ружейный салют. Наверное, это единственный случай в истории дореволюционной России, когда воинским салютом провожали в последний путь женщину-героиню. Могила Екатерины Яковлевны сохранилась до наших дней.

Средняя сестра Анна Петровна Избаш вспоминает: «Я помню, как Петя рыдал все три дня до её похорон, рыдал безутешно, не успокаиваясь ни на одну минуту. После смерти матери любовь и ласку её старалась заменить нам сестра Мария. Эта 16-летняя девочка создала особенную, исполненную грусти и доброты обстановку нашего сиротства. Эта обстановка не могла не отразиться на впечатлительном мальчике». Вполне возможно, что именно это событие и стало отправной точкой в психической неустойчивости нашего героя.

Так Пётр Петрович Шмидт оказывается вдовцом с двумя маленькими детьми на руках. При этом необходимо добавить, что стенания многих авторов на «несчастное детство» Петеньки Шмидта безосновательны. Разумеется, смерть матери наложила свой отпечаток. Но у Пети была заботливая старшая сестра, заботливый отец. Кроме этого семья губернатора города, разумеется, никогда не испытывала никаких материальных проблем, имела хороший дом и прислугу.

В сентябре 1880 года Пётр Петрович Шмидт отвёз своего старшего 13-летнего сына Петра в Петербург, где определил в подготовительный класс при Морском училище. Сделано это было не из-за каких-то материальных затруднений или желания пристроить куда-нибудь одного из детей. В семье со столь славными морскими традициями вопроса о том, кем быть маленькому Пете, думаю, вообще не стояло. Всё было предопределено заранее. Старший сын, как отец, как дядя и как дед, должен был продолжить военно-морскую династию Шмидтов. Такое решение было вполне разумным. При связях самого Петра Петровича, а тем более его старшего брата, который относился к старшему племяннику как к родному сыну, военно-морская карьера была Шмидту 3-му (так стали называть Петра Шмидта, после поступления в Морское училище) была обеспечена.

«Моряки старинных фамилий, влюблённые в далёкие горизонты», — писал о таких кадетах, как Петя Шмидт, поэт русского Серебряного века Михаил Кузьмин.

В Морское училище принимались мальчики в возрасте 12–14 лет. Курс обучения был шестилетний. За это время воспитанники получали общее среднее образование и высшее военно-морское. Воспитанники находились на полном казённом содержании, жили в самом корпусе. По воскресеньям отпускали к родственникам. Распорядок дня был следующий: в 6 часов 30 минут побудка, гимнастика и утренний чай, в 8 часов первый урок. Ежедневно было по три урока, по полтора часа каждый. Ещё полтора часа на строевые учения и три часа в день на личные дела. В 11 часов отбой.

При поступлении Шмидта училище возглавлял контр-адмирал А.П. Епанчин, продолжавший старые, ещё крузенштерновские, традиции. В 1882 году его сменил контр-адмирал Д.С. Арсеньев, слывший «паркетным адмиралом». Он был участником нескольких военно-дипломатических миссий, а затем многие годы служил воспитателем при великих князьях. Новый начальник первым делом, во избежание «дурных влияний», ограничил отпуск воспитанников в город. Затем он обратил внимание на то, что их головы слишком забиты морскими науками, что они в большинстве своём слабо разбираются во всём, что выходит за эти рамки. Они неотёсанные увальни, не умеют вести себя в обществе, особенно дамском. Адмирал же был убеждён, что морской офицер должен уметь показать себя не только в бою, но и в свете. С приходом Арсеньева в старших классах стали преподавать высшую географию и статистику, русский язык, литературу и Закон Божий. В первой (старшей кадетской) роте ввели внеклассные лекции по русской истории, а в старшей гардемаринской — по всеобщей. В училище приглашались известные учёные для чтения популярных лекций. Арсеньев ввёл и уроки танцев, поощрял занятие кадет музыкой.