13.05.1945 г. I-367 (15-й ДПЛ) безрезультатно атаковала американский КОН одной человекоуправляемой торпедой. Остальные торпеды не могли быть использованы по техническим причинам. I-367 направипась в Куре. Ha-101 (33-й ДПЛ) пришла на о. Амами Осима, разгрузилась и направилась в Куре.

14.05 1945 г. Под юрисдикцию японского флота перешли находившиеся на Дальнем Востоке, немецкие и в т. ч. бывшие итальянские ПЛ. Так, немецкие U 181, U 862, U 219 и U 195, ставшие соответственно I-501, I-502, I-505 и I-506, вошли в состав Первого Экспедиционного флота в Южных водах, итальянские Commandante Alfredo Cappellini (в германском флоте U/Т 24) и Luigi Torelli (в германском флоте U/Т 25), ставшие соответственно I-503 и I-504 — в состав Второго Экспедиционного флота в Южных водах. Первые четыре корабля базировались на Сингапур, а два других — на Сабанг. По состоянию на 14.05.1945 г., I-504 находилась в Сингапуре, I-505 — в Джакарте, а /-506 — в Сурабайе. Причем последняя была приспособлена для транспортировки 252 т нефти.

15.05.1945 г. Ha-104 (11-я эскадра ПЛ) пришла в Куре.

16.05.1945 г. I-351 (15-й ДПЛ) вышла из Сингапура и направилась в Сасебо. Ro-50 (З4-й ДПЛ) вышла из Куре и направилась в район к югу от о. Окинава для борьбы с судоходством союзников.

19.05.1945 г. Ha-101 (11-я эскадра ПЛ) пришла в Куре. I-367 (15-й ДПЛ) пришла в Сасебо.

23.05.1945 г. Ha-103 (15-й ДПЛ) вышла из Куре и направилась к о. Маркус, имея на борту 56 т продовольствия и медикаментов. I-361 (15-й ДПЛ) вышла из Токуяма и направилась в район к юго-востоку от Окинавы для атаки американских боевых кораблей, имея на борту четыре человекоуправляемых торпеды (группа "Тодороки").

29.05.1945 г. Флоту была передана I-203, которая вошла в состав 11-й эскадры ПЛ и приступила к боевой подготовке. Все корабли, входившие в состав 11-й эскадры, перевели в 15-й ДПЛ, базировавшийся либо на Токуяма (ПЛ с человекоуправляемыми торпедами), либо на Куре (ПЛ типов Ro и На). Из ПЛ Ha-101, Ha-102, Ha-103, Ha-104 и Ha-105 сформировали 16-й ДПЛ, призванный доставлять грузы изолированным гарнизонам на островах в центральной части Тихого океана. Из Ha-109 и Ha-111 сформировали 10-ю эскадру, находившуюся в непосредственном подчинении командующего Первым Мобильным флотом. Оба корабля должны были быть укомплектованы смертниками и выполнить роль своеобразных человекоуправляемых торпед, в случае атаки противником островов Метрополии. Находившиеся в постройке или вступавшие в строй высокоскоростные ПЛ типа ST передавались в подчинение командующему 11-й эскадрой.

30.05.1945 г. I-361 (15-й ДПЛ) была потоплена в 400 милях на юго-восток от о. Окинава самолетами с американского АВ Anzio. Данные о том, смогла ли она использовать свои человекоуправляемые торпеды, отсутствуют.

31.05.1945 г. Флоту были переданы Ha-201 и Ha-202, которые вошли в состав 52-го ДПЛ и приступили к боевой подготовке. I-13 и I-14 (1-й ДПЛ) вышли из Куре и направились в Оминато. I-165 (15-й ДПЛ) вышла из Йокосуки и направилась в район к югу от о. Окинава для атаки американских боевых кораблей, имея на борту две человекоуправляемые торпеды (группа "Тодороки").

1.06.1945 г. МГШ принял решение, строившиеся ПЛ типа STo (I-402 и I-404)[39] переоборудовать в ТН. Капитан 1 ранга Аридзуми перенес свой флаг на I-401.

4.06.1945 г. I-351 (15-й ДПЛ) пришла в Сасебо. Доставленное ею топливо позволило 901-й авиационной группе (шесть торпедоносцев и четыре бомбардировщика с I-400, I/-401, I-13 и I-14) приступить к тренировкам атаки шлюзов Панамского канала, макет которых был построен в бухте Нанао (залив Тояма) на западном побережье о. Хонсю.

5.06.1945 г. Ro-50 (15-й ДПЛ) пришла в Куре после патрулирования у о. Окинава. I-13 и I-14 (1-й ДПЛ) пришли в Оминато.

6.06.1945 г. I-36 (15-й ДПЛ) вышла из Куре и направилась к Марианским о-вам для атаки американских боевых кораблей, имея на борту шесть человекоуправляемых торпед (группа "Тодороки").

10.06.1945 г. I-122 (33-й ДПЛ) во время учебного похода с экипажем строившейся ПЛ, была потоплена американской ПЛ Skate в заливе Тояма (на западном побережье о. Хонсю). Ha-103 (16-й ДПЛ) пришла на о. Маркус разгрузилась и направилась в Куре.

14.06.1945 г. Ha-101 (16-й ДПЛ) вышла из Куре и направилась к о. Маркус, имея на борту 56 т продовольствия и медикаментов.

16.06.1945 г. I-363 (15-й ДПЛ) вышла из Куре и направилась в район к югу от о. Окинава для атаки американских боевых кораблей, имея на борту пять человекоуправляемых торпед (группа "Тодороки"). Ha-103 (16-й ДПЛ) пришла в Куре.

17.06.1945 г. I-400 и I-401 (1-й ДПЛ) вышли из Куре и направились в Дайрен (Манчжурия) для приема топлива и окончательной подготовки к нанесению удара по шлюзам Панамского канала.

19.06.1945 г. I-401 (1-й ДПЛ) подорвалась на магнитной мине в районе к югу от о. Хонсю, выставленной (ориентировочно 16.06.1943 г.) американской базовой авиацией. Корабль был вынужден направиться в Куре для восстановительного ремонта.

20.06.1945 г. МГШ решил отменить воздушный удар по Панамскому каналу и атаковать американские АВ у атолла Улити. I-13 и I-14 (1-й ДПЛ) вышли из Оминато и направились к атоллу Трук. На каждом из кораблей имелось по два разобранных ГСМ, которые планировали собрать на Труке и использовать в качестве разведчиков для обеспечения удара человекоуправляемых торпед по американским АВ у о. Улити. I-36 (15-й ДПЛ) дважды безуспешно атаковала американский КОН на подходах к о. Сайпан тремя человекоуправляемыми торпедами. В результате контратаки со стороны ЭМ эскорта рулевое управление ПЛ и оставшиеся три человекоуправляемые торпеды получили тяжелые повреждения. Корабль не мог всплыть из-за патрулировавших в районе американских ЭМ.

21.06.1945 г. I-401 (1-й ДПЛ) пришла в Куре и встала в док для устранения повреждений, полученных в резупьтате подрыва на мине 19.06.1945 г.

22.06.1945 г. I-352 и I-204, имевшие 90 % готовность, были разрушены в Куре американской базовой авиацией. Оба корабля стояли у достроечной стенки верфи флота. Ha-101 (16-й ДПЛ) пришла на о. Маркус, разгрузилась и направилась в Куре.

24.06.1945 г. I-400 пришла в Куре.

25.06.1945 г. Флоту была передана Ha-204, которая вошла в состав 33-го ДПЛ и приступила к боевой подготовке.

26.06.1945 г. Флоту была передана Ha-203, которая вошла в состав 33-го ДПЛ и приступила к боевой подготовке.

27.06.1945 г. I-165 (15-й ДПЛ) была потоплена в 450 милях к востоку от о. Сайпан американской базовой авиацией. I-36 (15-й ДПЛ) во Внутреннем японском море была безуспешно атакована неизвестной американской ПЛ.