3 июня крейсер «Красный Крым» в охранении эскадренных миноносцев «Сообразительный» и «Свободный» прибыл из Новороссийска в Севастополь с маршевым пополнением и боезапасом. Кроме этого, корабли доставили 8 45-мм орудий, 76 противотанковых ружей, 225 автоматов ППШ, 14 шт. 82-мм и 5 шт. 50-мм минометов, 2009 винтовок и 2 т медикаментов. После этого из Новороссийска в Севастополь прибыла подводная лодка С-32, доставившая 10 т боезапаса и 9 т продовольствия. Стоит обратить внимание на то, что далеко не всегда подводные лодки шли в полной загрузке. В данном случае лодка была загружена всего на 40 %. С чем это связано, сложно сказать.

5 июня из Новороссийска в Севастополь прибыли лидер «Харьков» и подводная лодка С-31, доставив 254 человека маршевого пополнения, 16 человек летного состава, 57 т боезапаса, 8 автоматов ППШ, 12 противотанковых ружей и четыре лейнера: два к 130-мм орудиям и два для 100-мм для береговых батарей № 702 бис (х. Молочный) и 2 бис (Воронцова гора). В тот же день лидер и подводная лодка вышли в Новороссийск. Лейнера к 100-мм орудиям, доставленные подводной лодкой, были найдены в районе 35-й батареи, т. е. скорее всего, замену лейнеров произвести не успели.

7 июня. В этот день из Новороссийска в Севастополь прибыли подводные лодки Л-23 (командир капитан 3-го ранга И.Ф. Фартушный) и Л-24 (командир капитан 3-го ранга Г.П. Апостолов). Они доставили 85 т боезапаса, 50 т продовольствия и 40 т бензина. Т. е. подводные лодки были загружены «под завязку».

Рано утром в Севастополь прибыл транспорт «Грузия» (капитан М.И. Фокин) в охранении эскадренного миноносца «Незаможник» (командир капитан 3-го ранга П.А. Бобровников), базового тральщика «Трал» (командир старший лейтенант Б.П. Фаворский) и четырех катеров МО. Поздним вечером транспорт «Грузия», приняв на борт раненых, эвакуированных, 36 т гильз и 38 т боезапаса для 100-мм орудий, в охранении эсминца «Незаможник», тральщиков «Трал», «Щит» и двух МО вышел из Севастополя в Туапсе.

До сих пор все обходилось. Корабли приходили и уходили почти без потерь. Но следующая потеря флота связана со странной ситуацией. Общепринято писать, что Севастополь не удалось удержать из-за нехватки снарядов. За десять дней обороны СОР выпустил 70 тыс. снарядов, или 2,5 тыс. тонн. На складах еще оставалось порядка 3,2 тыс. тонн, но в основном это были снаряды 45-мм, 76-мм старого образца и корабельный боезапас. В дефиците были 122-мм и 107-мм боезапас. Мало было 85-мм и 76-мм зенитных снарядов. Совсем трудно было с минометными минами. Минометов было очень много, но стрелять было нечем. И вот в этой сложной ситуации, из-за плохой организации приема транспортов Севастополь теряет сразу несколько кораблей.

В 2.40 10.06.1942 г. транспорт «Абхазия» (капитан М.И. Белуха) в охранении эсминцев «Свободный» (командир капитан 3-го ранга П.И. Шевченко) и «Бдительный» (командир капитан 3-го ранга Горшенин), базовых тральщиков «Якорь» (командир старший лейтенант И.В. Коровкин), «Защитник» (командир старший лейтенант В.Н. Михайлов) и трех сторожевых катеров типа МО прибыл из Новороссийска. На переходе конвой подвергся атаке 12 торпедоносцев, продолжавшейся с перерывами около двух часов. Немцы сбросили 24 торпеды, но ни одна из них не попала в цель. Налет был успешно отражен, и в ночь на 10 июня корабли ошвартовались у причала № 3 в Северной бухте. В 5 утра ЭМ «Бдительный», разгрузившись, покинул базу.

Оставшиеся в Севастополе транспорт «Абхазия» и эсминец «Свободный» оказались в сложной ситуации, хотя, в общем, был опыт отстоя транспортов и боевых кораблей в базе в дневное время. Утром транспорт находился у причала в Сухарной балке, имея на борту невыгруженными 168 тонн боезапаса, около 90 тонн авиационного боезапаса (т. е. его выгрузка только началась, было выгружено только продовольствие и личный состав). В это время начался налет авиации. Транспорт попытались накрыть дымзавесой, но по приказу командующего флотом в 6.40 задымление прекратили. В 7 утра опять начали задымление, и опять последовал звонок от командующего (обращаю внимание, по воспоминаниям, звонил лично командующий ЧФ!), так повторялось трижды.

На военно-исторической конференции, посвященной 20-летию начала обороны Севастополя, начальник штаба Севастопольского базового района ПВО И.К. Семенов так вспоминал обстоятельства этого боя: «Однажды товарищ Октябрьский говорит мне: “Семенов, у вас дым идет в сторону немцев, и под ним скрываются немцы”. Второй раз звонит. Я спрашиваю, что делать, он ничего не сказал. В третий раз говорит, что противник накапливает силы и может ринуться в наступление, и приказывает прекратить дымить».

Выгрузка прикрывалась всего одной зенитной 45-мм полубатареей (два 45-мм орудия 552-й зен. бат.). Эсминец, который, по логике, мог прикрыть транспорт, отвели за Павловский мысок.

В 9.15 при налете группы «Не-111» из I/KG100 была потоплена баржа, стоявшая у правого борта судна, а в 9.20 серия бомб попала в «Абхазию». Возник пожар, но транспорт оставался на плаву. Затем последовал налет пикировщиков Ju-87. В 9.35, получив несколько прямых попаданий авиабомб, «Абхазия» начала крениться на правый борт. Личный состав во главе с капитаном покинул транспорт и укрылся на берегу в штольне, опасаясь взрыва боезапаса. Транспорт тонул долго, до вечера, но его уже никто не спасал. Взрыва не произошло, и транспорт сел на грунт с креном в 20 метрах от пирса № 1. Над водой торчали его надстройки и дымовые трубы. Возникает ряд вполне резонных вопросов: почему в течение ночи не был выгружен транспорт? Почему командующий ЧФ дал приказ прекратить задымление? Почему выгрузка не была прикрыта зенитной артиллерией? Ответа на эти вопросы мы, наверное, уже не найдем. «Абхазия» стала последним транспортом, принятым к причалам Сухарной балки. Причин было две: первая – причал оказался заблокированным затонувшим транспортом, а вторая заключалась в том, что вскоре на обороне Северной стороны, похоже, «поставили крест».

Но это была не единственная потеря. Эсминец «Свободный» разгрузился быстро (к 4.30 разгрузка была завершена). Около 9.00 корабль ошвартовался к стенке Павловского мыска, где располагались артиллерийские мастерские. В 9.35 его атаковали 15 самолетов Ju-87. Бомбы упали возле борта. Примерно в 10.30 еще несколько бомб взорвались на расстоянии 5–7 м от кормы. В обшивке образовалось множество пробоин и вмятин, загорелись дымовые шашки. Впоследствии вблизи правого борта произошло еще несколько взрывов, число осколочных повреждений продолжало расти.

Роковой для «Свободного» авианалет начался только после полудня, в 13.15. На эсминец набросились сразу 27 «юнкерсов»: 15 зашли с носа и 12 – с кормы. Обзорность на той точке, где стоял эсминец, с кормы, была ограничена высотами и строениями. Отвлекшись на отражение самолетов с носа, со стороны города, зенитчики не заметили вторую группу, которая зашла с кормы. Они открыли ответный огонь, но было поздно: корабль получил 9 прямых попаданий бомбами весом 100–250 кг. Одна угодила в щит 2-го 130-мм орудия, две в ходовой мостик, одна – в район первой трубы, одна – во 2-е машинное отделение, две – в кормовой мостик и две – в кормовую часть корпуса. Т. е. немецкие самолеты прошлись бомбами по кораблю с носа до кормы. Эсминец был полностью разрушен. Ситуация осложнилась тем, что загорелся мазут, затем начали рваться поднесенные к зенитным орудиям снаряды. Из экипажа 67 человек погибли, многие были ранены, в том числе и командир капитан 3-го ранга П.И. Шевченко. В данной ситуации был отдан единственно правильный приказ – покинуть судно. Вскоре после эвакуации личного состава от пожара взорвались торпеды в первом аппарате, а затем прогремели еще два взрыва – сдетонировал боезапас в кормовых погребах. «Свободный» лег на грунт с креном 50° на правый борт. Носовая надстройка осталась над водой и горела в течение 3 суток. Погиб новейший корабль, который благодаря тяжелому труду морзаводцев только 2.01.1942 г. вступил в строй. Вскоре последовали еще более досадные потери, но об этом чуть позже.